Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CSJ3

Protein Details
Accession B0CSJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-141KTKGKDKEGDQKKERRRPAQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-139GKTKGKDKEGDQKKERRRP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_306026  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MNSSNIDDIWDEPVAHQDEVEAPTRSKRPLFLVESDDDDDDQAPRRVARKPPPQQDIDIDALFQDVDEEEFTSLPPALDIEAVRRRAEARHKQAAPSLTPHEILPSSSPPHDTGDRREEQGKTKGKDKEGDQKKERRRPAQLNEGRLLGPSGFPQLIKDVKNFRIEGKGHEATDLNRLLQVYQFWTHSLYPKTPFRDTVERVEKLCHSRRMNVSLSVWRDEAHGITKARANTEDDMDDDDVTRKAPPSEDELHPGQPASPIFSQTSSPMPSRPPSSASEYDLHDDDIEALIREESALSREKPPAPMEDDEESFWSTVDDYQPPRLSQPAPQATPMDEDHDMWDLVREIEMNTSTSQDEASSIPKASTTEEDWDGSIYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.2
4 0.17
5 0.2
6 0.22
7 0.26
8 0.22
9 0.2
10 0.27
11 0.31
12 0.35
13 0.33
14 0.34
15 0.36
16 0.42
17 0.46
18 0.44
19 0.46
20 0.44
21 0.46
22 0.44
23 0.39
24 0.3
25 0.26
26 0.22
27 0.17
28 0.2
29 0.18
30 0.17
31 0.19
32 0.23
33 0.29
34 0.37
35 0.46
36 0.53
37 0.61
38 0.7
39 0.74
40 0.74
41 0.71
42 0.67
43 0.61
44 0.55
45 0.44
46 0.34
47 0.27
48 0.23
49 0.19
50 0.14
51 0.09
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.14
68 0.2
69 0.22
70 0.22
71 0.23
72 0.24
73 0.29
74 0.39
75 0.43
76 0.46
77 0.53
78 0.55
79 0.56
80 0.6
81 0.57
82 0.49
83 0.43
84 0.38
85 0.3
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.21
90 0.2
91 0.17
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.2
96 0.19
97 0.23
98 0.28
99 0.28
100 0.3
101 0.36
102 0.37
103 0.38
104 0.41
105 0.4
106 0.4
107 0.47
108 0.49
109 0.43
110 0.49
111 0.52
112 0.51
113 0.53
114 0.52
115 0.54
116 0.55
117 0.62
118 0.63
119 0.67
120 0.73
121 0.77
122 0.81
123 0.78
124 0.77
125 0.77
126 0.77
127 0.78
128 0.73
129 0.69
130 0.62
131 0.56
132 0.46
133 0.37
134 0.3
135 0.19
136 0.14
137 0.09
138 0.1
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.11
143 0.15
144 0.16
145 0.19
146 0.22
147 0.26
148 0.3
149 0.3
150 0.28
151 0.32
152 0.31
153 0.31
154 0.33
155 0.32
156 0.28
157 0.28
158 0.27
159 0.21
160 0.26
161 0.22
162 0.15
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.16
175 0.17
176 0.17
177 0.21
178 0.25
179 0.29
180 0.28
181 0.3
182 0.3
183 0.36
184 0.37
185 0.41
186 0.44
187 0.41
188 0.4
189 0.4
190 0.38
191 0.37
192 0.41
193 0.4
194 0.34
195 0.39
196 0.42
197 0.45
198 0.45
199 0.4
200 0.37
201 0.34
202 0.34
203 0.3
204 0.26
205 0.21
206 0.2
207 0.18
208 0.16
209 0.13
210 0.15
211 0.14
212 0.15
213 0.18
214 0.18
215 0.19
216 0.19
217 0.2
218 0.17
219 0.19
220 0.18
221 0.15
222 0.17
223 0.16
224 0.15
225 0.12
226 0.12
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.16
235 0.22
236 0.23
237 0.27
238 0.28
239 0.28
240 0.27
241 0.26
242 0.2
243 0.17
244 0.16
245 0.16
246 0.14
247 0.15
248 0.16
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.2
253 0.18
254 0.19
255 0.18
256 0.21
257 0.24
258 0.26
259 0.26
260 0.26
261 0.27
262 0.33
263 0.34
264 0.34
265 0.33
266 0.32
267 0.33
268 0.3
269 0.27
270 0.19
271 0.17
272 0.13
273 0.11
274 0.1
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.08
283 0.12
284 0.13
285 0.17
286 0.23
287 0.25
288 0.29
289 0.31
290 0.33
291 0.34
292 0.34
293 0.35
294 0.34
295 0.33
296 0.3
297 0.3
298 0.26
299 0.21
300 0.19
301 0.14
302 0.11
303 0.12
304 0.14
305 0.17
306 0.19
307 0.26
308 0.3
309 0.3
310 0.32
311 0.34
312 0.32
313 0.33
314 0.41
315 0.42
316 0.41
317 0.43
318 0.42
319 0.39
320 0.42
321 0.37
322 0.31
323 0.23
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.21
328 0.17
329 0.18
330 0.14
331 0.13
332 0.12
333 0.11
334 0.09
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.15
340 0.15
341 0.15
342 0.14
343 0.11
344 0.12
345 0.11
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.16
351 0.17
352 0.19
353 0.21
354 0.22
355 0.25
356 0.27
357 0.28
358 0.27