Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9XJI6

Protein Details
Accession S9XJI6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-120VEDNLSKRRKAQRERQEQLQHERYHydrophilic
149-174IPEPGDLTRKKRPKQPRRERFYATSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-166RKKRPKQPRR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 9.5, cyto_mito 6, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
Amino Acid Sequences MATFHPDFLNMAPPPNYIAGVGRGATGFTTRSDLGPAQELPSQDAVKAAIDKRKSGEEPEEDDIDPRYQDPENEVALFATAPYGAEDEEADRIYQTVEDNLSKRRKAQRERQEQLQHERYEKENPKVSSQFADLKRGLSTLTDEDWLNIPEPGDLTRKKRPKQPRRERFYATSDFVLASARNEGQLESTVTTDGETGLDSTTENGTKTNFVEIGAARDKVLGIKLAQASTNLTSPSTVDPKGYLTSLNSMIPRNNTDLGDVKKARKLLQSVIETNPKHASGWVAAARLEEVANKNSQARILILKGCDNCPRSEDVWMEAIRLHPVDEAKVIIADAVRNLPHSVTLWLEAERLETQVSAKKRIIKKALELNPTSVGLWKEAVNLEEEVTNARILLARAVELIPMSIDLWLALARLETYKNAQKVLNKARQTIRTSYEVWIAAARLEEQQGNVSRVEKIMARGVAELQESGGMLQREQWLHEAEKCEKEGAVLTAQAIINTCLSIGLDEEDQLDTWMDDAQSFLISKCLDCARAVFAYALRVYSSNENIWLRAVETEKIYGSTDTVCSILEKAVEACPRTEILWLVYAKERKNTGDVNGARNILGRAFDYNSNSEEIWLAAVKLEFVNNEDERAKKLLARARIESGSERIWTKSISLERVLGNLEGALALLEDALKLFPTYDKFWMMKGQILEDGNDAGKARDAYITGTKLCPHSIPLWILLAKLEAKETIVRARVVLDRAKVRNPKNELLWLEVLKMENSAGNVSQVKAALAKALQECPSSGLLWSEAIWLEPRAQRKTRATDALRKCESNSYLLCTIARMLYSESKPEKAHEWFMKAIKADQDNGDVWVWFYKFSLEIGTQEQQQEVIRNCETADPRHGYYWPTITKDVKNARKSIPELLKEAANRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.24
4 0.17
5 0.19
6 0.17
7 0.18
8 0.18
9 0.16
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.12
15 0.11
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.19
20 0.2
21 0.21
22 0.25
23 0.24
24 0.23
25 0.24
26 0.24
27 0.24
28 0.27
29 0.25
30 0.21
31 0.21
32 0.19
33 0.19
34 0.24
35 0.25
36 0.28
37 0.3
38 0.33
39 0.35
40 0.42
41 0.42
42 0.42
43 0.45
44 0.44
45 0.48
46 0.49
47 0.49
48 0.42
49 0.41
50 0.38
51 0.31
52 0.25
53 0.2
54 0.19
55 0.17
56 0.18
57 0.21
58 0.23
59 0.24
60 0.24
61 0.23
62 0.2
63 0.19
64 0.17
65 0.13
66 0.09
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.1
83 0.11
84 0.14
85 0.19
86 0.21
87 0.3
88 0.37
89 0.38
90 0.45
91 0.52
92 0.59
93 0.65
94 0.73
95 0.76
96 0.8
97 0.84
98 0.86
99 0.85
100 0.82
101 0.82
102 0.8
103 0.73
104 0.66
105 0.63
106 0.55
107 0.56
108 0.56
109 0.54
110 0.53
111 0.51
112 0.55
113 0.55
114 0.54
115 0.47
116 0.44
117 0.45
118 0.4
119 0.45
120 0.38
121 0.36
122 0.35
123 0.32
124 0.27
125 0.19
126 0.21
127 0.16
128 0.16
129 0.17
130 0.16
131 0.17
132 0.19
133 0.19
134 0.16
135 0.14
136 0.13
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.18
141 0.22
142 0.28
143 0.37
144 0.47
145 0.52
146 0.62
147 0.71
148 0.75
149 0.81
150 0.86
151 0.87
152 0.87
153 0.89
154 0.87
155 0.82
156 0.79
157 0.74
158 0.66
159 0.56
160 0.47
161 0.39
162 0.31
163 0.26
164 0.19
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.14
173 0.14
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.13
197 0.13
198 0.16
199 0.15
200 0.2
201 0.21
202 0.2
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.15
207 0.16
208 0.12
209 0.09
210 0.14
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.18
218 0.14
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.16
223 0.18
224 0.17
225 0.16
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.18
230 0.15
231 0.13
232 0.15
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.18
237 0.2
238 0.22
239 0.23
240 0.23
241 0.24
242 0.21
243 0.22
244 0.26
245 0.27
246 0.33
247 0.34
248 0.33
249 0.34
250 0.36
251 0.37
252 0.36
253 0.36
254 0.33
255 0.38
256 0.41
257 0.41
258 0.43
259 0.48
260 0.43
261 0.43
262 0.39
263 0.31
264 0.26
265 0.23
266 0.2
267 0.13
268 0.18
269 0.17
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.13
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.14
285 0.13
286 0.14
287 0.15
288 0.17
289 0.17
290 0.2
291 0.21
292 0.23
293 0.28
294 0.27
295 0.25
296 0.25
297 0.28
298 0.25
299 0.27
300 0.25
301 0.21
302 0.23
303 0.23
304 0.21
305 0.18
306 0.17
307 0.15
308 0.14
309 0.12
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.13
343 0.15
344 0.18
345 0.2
346 0.28
347 0.32
348 0.4
349 0.45
350 0.43
351 0.47
352 0.52
353 0.57
354 0.55
355 0.51
356 0.46
357 0.4
358 0.38
359 0.32
360 0.25
361 0.18
362 0.13
363 0.13
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.09
404 0.14
405 0.15
406 0.17
407 0.19
408 0.21
409 0.3
410 0.38
411 0.42
412 0.39
413 0.44
414 0.47
415 0.51
416 0.51
417 0.47
418 0.41
419 0.36
420 0.36
421 0.33
422 0.3
423 0.24
424 0.21
425 0.17
426 0.14
427 0.11
428 0.09
429 0.09
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.1
435 0.11
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.11
440 0.11
441 0.12
442 0.1
443 0.1
444 0.11
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.1
451 0.09
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.08
460 0.11
461 0.11
462 0.12
463 0.13
464 0.13
465 0.14
466 0.16
467 0.19
468 0.19
469 0.21
470 0.21
471 0.19
472 0.17
473 0.16
474 0.15
475 0.12
476 0.1
477 0.08
478 0.07
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.05
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.12
520 0.11
521 0.1
522 0.11
523 0.11
524 0.11
525 0.08
526 0.09
527 0.1
528 0.12
529 0.13
530 0.11
531 0.15
532 0.15
533 0.15
534 0.15
535 0.14
536 0.12
537 0.12
538 0.13
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.1
546 0.1
547 0.09
548 0.09
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.11
559 0.13
560 0.13
561 0.13
562 0.14
563 0.14
564 0.14
565 0.14
566 0.11
567 0.1
568 0.14
569 0.14
570 0.15
571 0.19
572 0.23
573 0.23
574 0.26
575 0.27
576 0.23
577 0.27
578 0.27
579 0.25
580 0.3
581 0.32
582 0.32
583 0.33
584 0.32
585 0.28
586 0.27
587 0.25
588 0.16
589 0.14
590 0.1
591 0.1
592 0.11
593 0.14
594 0.15
595 0.16
596 0.17
597 0.18
598 0.17
599 0.15
600 0.14
601 0.11
602 0.1
603 0.08
604 0.07
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.07
610 0.06
611 0.08
612 0.13
613 0.12
614 0.15
615 0.16
616 0.17
617 0.19
618 0.21
619 0.2
620 0.17
621 0.23
622 0.26
623 0.32
624 0.35
625 0.35
626 0.37
627 0.38
628 0.38
629 0.34
630 0.31
631 0.25
632 0.23
633 0.21
634 0.18
635 0.18
636 0.17
637 0.15
638 0.19
639 0.21
640 0.22
641 0.22
642 0.24
643 0.23
644 0.24
645 0.24
646 0.18
647 0.14
648 0.11
649 0.09
650 0.06
651 0.06
652 0.04
653 0.03
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.03
659 0.03
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.07
664 0.1
665 0.14
666 0.16
667 0.21
668 0.21
669 0.23
670 0.28
671 0.27
672 0.27
673 0.25
674 0.23
675 0.23
676 0.23
677 0.22
678 0.18
679 0.18
680 0.14
681 0.14
682 0.13
683 0.09
684 0.11
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.11
689 0.13
690 0.18
691 0.2
692 0.19
693 0.2
694 0.22
695 0.22
696 0.23
697 0.2
698 0.18
699 0.18
700 0.21
701 0.21
702 0.21
703 0.22
704 0.21
705 0.21
706 0.18
707 0.18
708 0.14
709 0.13
710 0.13
711 0.1
712 0.11
713 0.13
714 0.15
715 0.18
716 0.2
717 0.2
718 0.19
719 0.22
720 0.24
721 0.26
722 0.28
723 0.28
724 0.33
725 0.36
726 0.44
727 0.49
728 0.52
729 0.57
730 0.6
731 0.6
732 0.56
733 0.61
734 0.54
735 0.51
736 0.49
737 0.41
738 0.35
739 0.31
740 0.28
741 0.2
742 0.19
743 0.14
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.1
748 0.12
749 0.14
750 0.14
751 0.15
752 0.14
753 0.14
754 0.14
755 0.13
756 0.12
757 0.11
758 0.15
759 0.16
760 0.2
761 0.22
762 0.21
763 0.21
764 0.22
765 0.23
766 0.19
767 0.17
768 0.14
769 0.13
770 0.13
771 0.12
772 0.11
773 0.1
774 0.1
775 0.12
776 0.11
777 0.16
778 0.19
779 0.26
780 0.32
781 0.36
782 0.43
783 0.5
784 0.57
785 0.6
786 0.66
787 0.66
788 0.69
789 0.74
790 0.75
791 0.72
792 0.65
793 0.6
794 0.58
795 0.53
796 0.49
797 0.41
798 0.38
799 0.34
800 0.34
801 0.32
802 0.25
803 0.25
804 0.19
805 0.18
806 0.13
807 0.15
808 0.22
809 0.23
810 0.31
811 0.33
812 0.36
813 0.37
814 0.38
815 0.41
816 0.38
817 0.46
818 0.44
819 0.45
820 0.47
821 0.49
822 0.5
823 0.45
824 0.44
825 0.41
826 0.38
827 0.36
828 0.33
829 0.34
830 0.3
831 0.31
832 0.28
833 0.21
834 0.19
835 0.2
836 0.18
837 0.15
838 0.14
839 0.13
840 0.13
841 0.14
842 0.17
843 0.14
844 0.16
845 0.21
846 0.24
847 0.26
848 0.26
849 0.26
850 0.24
851 0.25
852 0.29
853 0.27
854 0.3
855 0.27
856 0.27
857 0.27
858 0.32
859 0.34
860 0.32
861 0.37
862 0.36
863 0.38
864 0.4
865 0.41
866 0.37
867 0.39
868 0.42
869 0.39
870 0.39
871 0.42
872 0.45
873 0.48
874 0.55
875 0.6
876 0.61
877 0.63
878 0.64
879 0.65
880 0.68
881 0.67
882 0.67
883 0.66
884 0.61
885 0.58
886 0.54
887 0.53