Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9VT98

Protein Details
Accession S9VT98    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-35YVNAKQYHRILKRREARARLEERLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-61KRREARARLEERLRGMQTTKKPYLHESRHKHAMRRPRGPG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001289  NFYA  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0000792  C:heterochromatin  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000979  F:RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:1903715  P:regulation of aerobic respiration  
Pfam View protein in Pfam  
PF02045  CBFB_NFYA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51152  NFYA_HAP2_2  
Amino Acid Sequences MNPYEPVEGLYVNAKQYHRILKRREARARLEERLRGMQTTKKPYLHESRHKHAMRRPRGPGGRFLTAEKVSQLKAQEALEEGKSESPNGSETRGLMDTLDTAPTTTTTTNEFLDTNDTADDSPSSTLSSHVPNNAAGGPAGLDLTGSREETQHNPSIFGTTTNSNFNTVSANPNPNALTHPGGVDGNRSSTPSAAVPSHTSTDTTNIGPSNSSINAQIHNSTAATNNQHHRHSNAPSNAPTLTSNENIQLRNASSSAVSNPLSVNDPGVDLNLSNPIVMQLDPSNLLHSPSSNQNTPRTSFFPPSTTTEDRPSPPVSNRHHSTANNTDYGNLPTTTHPNSVFHKNATHTYHTTPGSELTGPNGDSFADLDVYQTDDPVTTSLIHSQHPIGSIGDLSDPSTAHGSGIPNLTSHHMGHLNLTGNNQDSIIIDQQPYTSHDSTSAHP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.32
4 0.41
5 0.46
6 0.53
7 0.59
8 0.64
9 0.73
10 0.8
11 0.84
12 0.81
13 0.81
14 0.82
15 0.82
16 0.8
17 0.78
18 0.72
19 0.67
20 0.67
21 0.6
22 0.52
23 0.48
24 0.48
25 0.49
26 0.53
27 0.55
28 0.52
29 0.53
30 0.58
31 0.65
32 0.67
33 0.69
34 0.68
35 0.69
36 0.75
37 0.77
38 0.77
39 0.73
40 0.74
41 0.73
42 0.74
43 0.73
44 0.73
45 0.77
46 0.72
47 0.75
48 0.7
49 0.66
50 0.58
51 0.53
52 0.49
53 0.42
54 0.4
55 0.33
56 0.3
57 0.24
58 0.26
59 0.25
60 0.2
61 0.22
62 0.21
63 0.2
64 0.19
65 0.21
66 0.19
67 0.18
68 0.17
69 0.18
70 0.18
71 0.18
72 0.16
73 0.14
74 0.16
75 0.16
76 0.18
77 0.15
78 0.15
79 0.18
80 0.18
81 0.17
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.09
93 0.1
94 0.12
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.15
99 0.14
100 0.18
101 0.17
102 0.14
103 0.13
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.11
115 0.14
116 0.15
117 0.17
118 0.18
119 0.17
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.12
124 0.1
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.12
137 0.15
138 0.2
139 0.24
140 0.23
141 0.24
142 0.23
143 0.24
144 0.22
145 0.2
146 0.17
147 0.14
148 0.16
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.15
156 0.19
157 0.19
158 0.22
159 0.2
160 0.22
161 0.22
162 0.2
163 0.21
164 0.18
165 0.16
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.15
186 0.14
187 0.14
188 0.12
189 0.14
190 0.15
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.13
212 0.16
213 0.21
214 0.25
215 0.27
216 0.27
217 0.28
218 0.31
219 0.32
220 0.36
221 0.34
222 0.34
223 0.33
224 0.33
225 0.31
226 0.27
227 0.24
228 0.19
229 0.17
230 0.15
231 0.14
232 0.16
233 0.19
234 0.18
235 0.18
236 0.16
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.11
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.08
257 0.05
258 0.06
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.18
278 0.22
279 0.24
280 0.27
281 0.32
282 0.35
283 0.37
284 0.38
285 0.35
286 0.35
287 0.36
288 0.34
289 0.32
290 0.32
291 0.34
292 0.38
293 0.38
294 0.37
295 0.36
296 0.38
297 0.37
298 0.38
299 0.37
300 0.33
301 0.35
302 0.41
303 0.43
304 0.48
305 0.49
306 0.5
307 0.52
308 0.49
309 0.51
310 0.51
311 0.48
312 0.41
313 0.38
314 0.34
315 0.31
316 0.32
317 0.27
318 0.18
319 0.16
320 0.16
321 0.21
322 0.23
323 0.24
324 0.23
325 0.24
326 0.29
327 0.35
328 0.36
329 0.33
330 0.34
331 0.34
332 0.4
333 0.41
334 0.42
335 0.38
336 0.38
337 0.43
338 0.39
339 0.37
340 0.31
341 0.28
342 0.25
343 0.23
344 0.2
345 0.17
346 0.19
347 0.18
348 0.17
349 0.16
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.1
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.08
367 0.1
368 0.15
369 0.17
370 0.17
371 0.19
372 0.2
373 0.2
374 0.21
375 0.21
376 0.16
377 0.15
378 0.14
379 0.13
380 0.13
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.11
386 0.13
387 0.12
388 0.11
389 0.14
390 0.15
391 0.17
392 0.2
393 0.19
394 0.17
395 0.19
396 0.22
397 0.22
398 0.21
399 0.22
400 0.22
401 0.22
402 0.24
403 0.28
404 0.28
405 0.26
406 0.27
407 0.25
408 0.24
409 0.24
410 0.22
411 0.18
412 0.15
413 0.17
414 0.19
415 0.19
416 0.18
417 0.18
418 0.19
419 0.2
420 0.23
421 0.26
422 0.24
423 0.22
424 0.25