FuNGI

S9VPX4

Protein Details

Accession

S9VPX4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
286-307	YSAPPPRKEKPKPRAPTPPPLN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
291-300	PRKEKPKPRA

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007275 YTH_domain
Gene Ontology	GO:1990342 C:heterochromatin island GO:0033620 C:Mei2 nuclear dot complex GO:1990251 C:nuclear exosome focus GO:1905762 F:CCR4-NOT complex binding GO:0106222 F:lncRNA binding GO:0003729 F:mRNA binding GO:0097157 F:pre-mRNA intronic binding GO:0140517 F:protein-RNA adaptor activity GO:0110064 P:lncRNA catabolic process GO:0071031 P:nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing GO:0071030 P:nuclear mRNA surveillance of spliceosomal pre-mRNA splicing GO:0071029 P:nuclear ncRNA surveillance GO:0033621 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts GO:2000804 P:regulation of termination of RNA polymerase II transcription, poly(A)-coupled GO:1902794 P:siRNA-independent facultative heterochromatin formation
Pfam	View protein in Pfam PF04146 YTH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50882 YTH
CDD	cd21134 YTH

Amino Acid Sequences

MSNTNFNSQSSKQLPELPNLEVLRSLWPSQPSNESNDSRSVWSSRPAEPVHVLSNPTANSFTSPLKRPAPDSREAPIGRRIMIDDPRLAKPVKYDFTRHCTDYGHSYEWPYFRSVRRESLMYGPPSAVPPESPVFPPYPPESATLQSKYYPAQSDAPAAYYDRARFELQPPSKRRTLSPPPRRIVDPYGPRFTEDDPYSKSPYAMAGDRPPLSAPMYPVGYPPYGAKASSQLGADDLRGTTSRYPLMASDVRASHSPSLIDPYAHRSVADVPYADHPHYSVNAEPYSAPPPRKEKPKPRAPTPPPLNFARASEYRNDKGERISMINPRVILDESGISHRSRYFIMLCDNETAIAHAKKTSIWAVKHEAASRVSDAYKKASIYFIFIAKPTNNALGYAQVVSDLNSAELPFWADNATYAGGVRVKWIKTCNLFSAEISDIVGRMNHGMTAKDGMEMMYDEGCRLCILVNSAIMKRIGRDR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.47
3	0.48
4	0.41
5	0.44
6	0.4
7	0.38
8	0.3
9	0.28
10	0.26
11	0.26
12	0.27
13	0.24
14	0.28
15	0.31
16	0.33
17	0.4
18	0.37
19	0.41
20	0.46
21	0.45
22	0.43
23	0.45
24	0.43
25	0.38
26	0.39
27	0.36
28	0.3
29	0.35
30	0.37
31	0.35
32	0.41
33	0.39
34	0.4
35	0.4
36	0.41
37	0.37
38	0.35
39	0.33
40	0.27
41	0.3
42	0.26
43	0.24
44	0.22
45	0.19
46	0.19
47	0.2
48	0.25
49	0.27
50	0.31
51	0.36
52	0.41
53	0.43
54	0.47
55	0.54
56	0.54
57	0.54
58	0.53
59	0.5
60	0.53
61	0.52
62	0.49
63	0.46
64	0.42
65	0.36
66	0.33
67	0.32
68	0.29
69	0.34
70	0.34
71	0.32
72	0.34
73	0.35
74	0.37
75	0.36
76	0.3
77	0.31
78	0.35
79	0.37
80	0.36
81	0.41
82	0.44
83	0.5
84	0.54
85	0.5
86	0.44
87	0.39
88	0.38
89	0.38
90	0.37
91	0.33
92	0.29
93	0.3
94	0.32
95	0.31
96	0.3
97	0.27
98	0.26
99	0.28
100	0.35
101	0.36
102	0.38
103	0.4
104	0.4
105	0.4
106	0.42
107	0.44
108	0.38
109	0.35
110	0.29
111	0.27
112	0.26
113	0.25
114	0.18
115	0.12
116	0.13
117	0.14
118	0.16
119	0.16
120	0.17
121	0.18
122	0.18
123	0.21
124	0.2
125	0.21
126	0.2
127	0.22
128	0.22
129	0.24
130	0.29
131	0.27
132	0.26
133	0.24
134	0.24
135	0.23
136	0.24
137	0.22
138	0.2
139	0.22
140	0.21
141	0.23
142	0.22
143	0.22
144	0.19
145	0.18
146	0.16
147	0.15
148	0.16
149	0.14
150	0.17
151	0.17
152	0.18
153	0.21
154	0.3
155	0.35
156	0.43
157	0.46
158	0.48
159	0.51
160	0.5
161	0.49
162	0.49
163	0.53
164	0.55
165	0.61
166	0.65
167	0.65
168	0.66
169	0.66
170	0.6
171	0.56
172	0.53
173	0.52
174	0.48
175	0.5
176	0.47
177	0.46
178	0.43
179	0.38
180	0.36
181	0.28
182	0.26
183	0.25
184	0.28
185	0.3
186	0.29
187	0.27
188	0.21
189	0.21
190	0.2
191	0.17
192	0.16
193	0.15
194	0.19
195	0.19
196	0.19
197	0.18
198	0.16
199	0.16
200	0.15
201	0.13
202	0.12
203	0.13
204	0.12
205	0.13
206	0.14
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.12
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.12
215	0.13
216	0.14
217	0.14
218	0.1
219	0.11
220	0.11
221	0.11
222	0.08
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.08
227	0.08
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.13
234	0.14
235	0.14
236	0.15
237	0.15
238	0.16
239	0.16
240	0.18
241	0.14
242	0.13
243	0.12
244	0.09
245	0.13
246	0.12
247	0.12
248	0.11
249	0.17
250	0.18
251	0.18
252	0.17
253	0.14
254	0.17
255	0.19
256	0.19
257	0.13
258	0.12
259	0.16
260	0.18
261	0.17
262	0.14
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.14
267	0.11
268	0.12
269	0.12
270	0.13
271	0.13
272	0.14
273	0.18
274	0.2
275	0.2
276	0.21
277	0.28
278	0.34
279	0.44
280	0.52
281	0.58
282	0.65
283	0.74
284	0.77
285	0.79
286	0.84
287	0.79
288	0.8
289	0.78
290	0.74
291	0.68
292	0.63
293	0.58
294	0.48
295	0.43
296	0.38
297	0.32
298	0.27
299	0.29
300	0.32
301	0.31
302	0.35
303	0.36
304	0.31
305	0.3
306	0.31
307	0.28
308	0.25
309	0.27
310	0.29
311	0.3
312	0.3
313	0.28
314	0.26
315	0.25
316	0.22
317	0.18
318	0.13
319	0.11
320	0.11
321	0.14
322	0.15
323	0.13
324	0.14
325	0.14
326	0.15
327	0.14
328	0.16
329	0.15
330	0.16
331	0.22
332	0.22
333	0.23
334	0.23
335	0.23
336	0.2
337	0.18
338	0.17
339	0.16
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.14
344	0.14
345	0.17
346	0.22
347	0.24
348	0.24
349	0.28
350	0.34
351	0.38
352	0.41
353	0.41
354	0.38
355	0.33
356	0.33
357	0.3
358	0.25
359	0.22
360	0.22
361	0.21
362	0.22
363	0.24
364	0.22
365	0.22
366	0.24
367	0.23
368	0.24
369	0.25
370	0.22
371	0.21
372	0.21
373	0.24
374	0.2
375	0.22
376	0.2
377	0.21
378	0.19
379	0.19
380	0.19
381	0.17
382	0.18
383	0.16
384	0.14
385	0.11
386	0.11
387	0.1
388	0.11
389	0.09
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.11
402	0.11
403	0.09
404	0.09
405	0.11
406	0.12
407	0.12
408	0.16
409	0.2
410	0.21
411	0.25
412	0.28
413	0.34
414	0.39
415	0.43
416	0.44
417	0.43
418	0.43
419	0.39
420	0.4
421	0.34
422	0.28
423	0.24
424	0.19
425	0.14
426	0.14
427	0.14
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.11
432	0.12
433	0.13
434	0.14
435	0.17
436	0.17
437	0.16
438	0.16
439	0.13
440	0.13
441	0.14
442	0.13
443	0.12
444	0.12
445	0.12
446	0.12
447	0.12
448	0.11
449	0.1
450	0.1
451	0.09
452	0.13
453	0.15
454	0.19
455	0.23
456	0.24
457	0.27
458	0.28
459	0.27

S9VPX4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer