Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9VNY1

Protein Details
Accession S9VNY1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-302IWNLKHPSHHKGKSNPPERQIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.5, nucl 9, cyto 8, extr 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037867  Swd2/WDR82  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:1990567  C:DPS complex  
GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:1902801  P:regulation of siRNA-independent facultative heterochromatin formation  
GO:1904594  P:regulation of termination of RNA polymerase II transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MDVNLLSTLKPAHSFRDNSIGSVLSSIDFDDRGEYLAAACSADGAVQIYDALNPKLIKTVFCPEMGLEIARFTHHSKNLLLSTKKTNNNLYYYSTFDDKLISTFPGHSDRVTNLEVSPIEDQFVSTSYDNTLKLWDIHRTPRCLGSLDLPSAGLPAYDPTGLVFAVACHSLSRIFLYDARKYDTEPFSTFSINDSRYLSRFSFPPLMPEWRHMEFSNDGKFILLSTRANVHYVLDAFSGEIVSRLDGFQDVPSSDASLGSSVTFAPQAPFIIGAANDKTLNIWNLKHPSHHKGKSNPPERQIVAQSLIKPFLAKHNPRYHQFITGGSQLVFWLPEDFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.44
4 0.42
5 0.39
6 0.39
7 0.33
8 0.26
9 0.24
10 0.21
11 0.11
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.09
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.09
23 0.11
24 0.11
25 0.09
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.05
34 0.06
35 0.06
36 0.08
37 0.11
38 0.11
39 0.14
40 0.14
41 0.14
42 0.2
43 0.21
44 0.2
45 0.22
46 0.29
47 0.27
48 0.27
49 0.28
50 0.22
51 0.24
52 0.23
53 0.2
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.13
59 0.14
60 0.2
61 0.23
62 0.25
63 0.25
64 0.3
65 0.35
66 0.4
67 0.4
68 0.36
69 0.42
70 0.48
71 0.53
72 0.52
73 0.54
74 0.5
75 0.52
76 0.51
77 0.47
78 0.4
79 0.38
80 0.36
81 0.3
82 0.26
83 0.22
84 0.21
85 0.16
86 0.15
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.14
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.17
97 0.2
98 0.2
99 0.18
100 0.14
101 0.16
102 0.15
103 0.16
104 0.16
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.08
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.12
116 0.13
117 0.12
118 0.13
119 0.11
120 0.12
121 0.14
122 0.17
123 0.18
124 0.27
125 0.31
126 0.33
127 0.34
128 0.35
129 0.34
130 0.31
131 0.29
132 0.24
133 0.23
134 0.2
135 0.19
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.12
140 0.07
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.03
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.11
163 0.15
164 0.18
165 0.19
166 0.22
167 0.22
168 0.22
169 0.27
170 0.26
171 0.25
172 0.23
173 0.24
174 0.22
175 0.22
176 0.21
177 0.16
178 0.18
179 0.16
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.17
184 0.21
185 0.2
186 0.17
187 0.17
188 0.19
189 0.24
190 0.22
191 0.25
192 0.25
193 0.29
194 0.29
195 0.31
196 0.32
197 0.28
198 0.3
199 0.26
200 0.27
201 0.24
202 0.28
203 0.29
204 0.24
205 0.22
206 0.2
207 0.2
208 0.16
209 0.15
210 0.13
211 0.09
212 0.1
213 0.14
214 0.14
215 0.16
216 0.16
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.17
268 0.17
269 0.18
270 0.23
271 0.3
272 0.32
273 0.38
274 0.42
275 0.48
276 0.56
277 0.62
278 0.63
279 0.65
280 0.75
281 0.78
282 0.82
283 0.8
284 0.74
285 0.75
286 0.68
287 0.65
288 0.59
289 0.52
290 0.47
291 0.43
292 0.42
293 0.37
294 0.37
295 0.31
296 0.27
297 0.24
298 0.3
299 0.36
300 0.4
301 0.47
302 0.56
303 0.63
304 0.67
305 0.74
306 0.66
307 0.63
308 0.58
309 0.51
310 0.45
311 0.42
312 0.4
313 0.31
314 0.29
315 0.22
316 0.21
317 0.18
318 0.14