Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9XDX9

Protein Details
Accession S9XDX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
435-469TSNALESNAKRKRKNQKKKNYKKMKERKLGTAMDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
443-462AKRKRKNQKKKNYKKMKERK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR023267  RCMT  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0009383  F:rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity  
GO:0070475  P:rRNA base methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MDFYIHAATILDDLSQKKGSIKQLVFNSKKHDPKRTYALVCETLKYKHVLDEVIQCSKLLDLEKKIKKNLARVLVHDLLMSKRGISASTGSIKEAILRHKTRLNAEFVKLKIRNKVKSHEELALKNPVTLPRWIRINTIKATKEEVLKQLALTRVSSLKEVGPGTYYMDEIIDNLIALDGETSLVNESCYQEGKVIIQDKASCIPAAILGNQRQTKVGDIIDGCAAPGNKTTHLAALFPNAKIFAFERNSQRVQTLQKMVEISGAQNVEILHQDFTQSDIMDPKFANVTHILLDPSCSGSGIVSRQDFLLEESEQDLVEDVNRLESLCSFQSTILKHALQFPKCQYVTYSTCSVHRLENEQVVCDVLSQEPQWKCNTIENTLPQWEDRGIPEYCTDPMMAKAMIRCVPGKFGTIGFFVCNLYHSGRVGNLLGNGTSNALESNAKRKRKNQKKKNYKKMKERKLGTAMDSTGHISESKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.18
4 0.22
5 0.28
6 0.35
7 0.42
8 0.43
9 0.46
10 0.54
11 0.65
12 0.66
13 0.63
14 0.63
15 0.63
16 0.69
17 0.7
18 0.71
19 0.66
20 0.69
21 0.74
22 0.75
23 0.7
24 0.66
25 0.66
26 0.63
27 0.59
28 0.53
29 0.47
30 0.4
31 0.38
32 0.35
33 0.29
34 0.25
35 0.26
36 0.25
37 0.26
38 0.33
39 0.35
40 0.36
41 0.35
42 0.31
43 0.29
44 0.27
45 0.27
46 0.22
47 0.23
48 0.26
49 0.36
50 0.45
51 0.51
52 0.55
53 0.59
54 0.6
55 0.63
56 0.64
57 0.63
58 0.58
59 0.56
60 0.6
61 0.55
62 0.51
63 0.42
64 0.35
65 0.27
66 0.26
67 0.22
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.16
75 0.22
76 0.22
77 0.21
78 0.22
79 0.21
80 0.23
81 0.24
82 0.27
83 0.3
84 0.32
85 0.35
86 0.39
87 0.43
88 0.46
89 0.47
90 0.48
91 0.44
92 0.45
93 0.47
94 0.44
95 0.49
96 0.47
97 0.46
98 0.47
99 0.51
100 0.56
101 0.55
102 0.63
103 0.61
104 0.63
105 0.63
106 0.61
107 0.57
108 0.51
109 0.5
110 0.5
111 0.42
112 0.36
113 0.34
114 0.31
115 0.28
116 0.31
117 0.3
118 0.26
119 0.32
120 0.32
121 0.35
122 0.38
123 0.41
124 0.41
125 0.46
126 0.44
127 0.39
128 0.43
129 0.4
130 0.39
131 0.36
132 0.35
133 0.31
134 0.28
135 0.27
136 0.26
137 0.27
138 0.23
139 0.2
140 0.18
141 0.18
142 0.18
143 0.19
144 0.16
145 0.14
146 0.16
147 0.16
148 0.15
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.13
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.18
188 0.17
189 0.13
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.13
196 0.15
197 0.21
198 0.22
199 0.22
200 0.21
201 0.21
202 0.21
203 0.18
204 0.16
205 0.13
206 0.12
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.12
218 0.12
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.1
223 0.14
224 0.15
225 0.14
226 0.14
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.18
234 0.23
235 0.28
236 0.29
237 0.29
238 0.29
239 0.27
240 0.27
241 0.28
242 0.28
243 0.24
244 0.25
245 0.25
246 0.24
247 0.22
248 0.19
249 0.14
250 0.12
251 0.11
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.13
272 0.12
273 0.14
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.1
280 0.11
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.09
288 0.09
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.12
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.08
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.1
314 0.09
315 0.11
316 0.1
317 0.11
318 0.15
319 0.16
320 0.19
321 0.2
322 0.2
323 0.2
324 0.28
325 0.35
326 0.32
327 0.36
328 0.37
329 0.41
330 0.41
331 0.41
332 0.34
333 0.33
334 0.35
335 0.34
336 0.35
337 0.27
338 0.29
339 0.31
340 0.3
341 0.27
342 0.25
343 0.26
344 0.25
345 0.3
346 0.29
347 0.28
348 0.26
349 0.23
350 0.21
351 0.16
352 0.14
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.17
357 0.18
358 0.2
359 0.22
360 0.24
361 0.26
362 0.31
363 0.34
364 0.3
365 0.35
366 0.38
367 0.4
368 0.4
369 0.39
370 0.31
371 0.3
372 0.27
373 0.23
374 0.2
375 0.2
376 0.18
377 0.18
378 0.19
379 0.19
380 0.19
381 0.18
382 0.16
383 0.12
384 0.13
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.15
389 0.19
390 0.21
391 0.22
392 0.23
393 0.21
394 0.26
395 0.25
396 0.26
397 0.23
398 0.21
399 0.22
400 0.21
401 0.21
402 0.17
403 0.17
404 0.15
405 0.14
406 0.13
407 0.14
408 0.14
409 0.16
410 0.15
411 0.16
412 0.16
413 0.18
414 0.18
415 0.17
416 0.17
417 0.16
418 0.16
419 0.15
420 0.15
421 0.13
422 0.12
423 0.11
424 0.09
425 0.09
426 0.13
427 0.15
428 0.25
429 0.33
430 0.41
431 0.48
432 0.57
433 0.67
434 0.74
435 0.84
436 0.84
437 0.87
438 0.9
439 0.95
440 0.97
441 0.97
442 0.96
443 0.96
444 0.96
445 0.96
446 0.95
447 0.9
448 0.88
449 0.86
450 0.8
451 0.73
452 0.68
453 0.58
454 0.49
455 0.44
456 0.36
457 0.27
458 0.23