Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9VT24

Protein Details
Accession S9VT24    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-180EAEQKLSQPKQRNRKQKPSSEAAHydrophilic
227-251NSSATQKCPVCRRKVHPKNVICLEMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047134  RNF4-like  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0033768  C:SUMO-targeted ubiquitin ligase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016874  F:ligase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0140082  F:SUMO-ubiquitin ligase activity  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0120290  P:stalled replication fork localization to nuclear periphery  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MPPTPRSGSQRYVPYDVRIPRSPREAAAVAAARRQNRRSSEVSYSTEEAPHESPSEHGDIRGVADRDVDEVFNNHGLQQNTYPGLSEASSVPRSVRSLAHNESLGSLERSRNEWSAELDNLDDLDVLEDISPLQEVSQCRDPSGNSMSAYDDVIDLTEAEQKLSQPKQRNRKQKPSSEAAPGIASVNNSQRLADYKCVICLDNPENLSATPCGHIFCNFCILSALGNSSATQKCPVCRRKVHPKNVICLEMMLGSEQNNKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.54
3 0.55
4 0.55
5 0.54
6 0.53
7 0.52
8 0.56
9 0.53
10 0.46
11 0.46
12 0.4
13 0.33
14 0.35
15 0.34
16 0.29
17 0.32
18 0.34
19 0.34
20 0.39
21 0.42
22 0.43
23 0.44
24 0.49
25 0.48
26 0.5
27 0.53
28 0.53
29 0.53
30 0.5
31 0.47
32 0.42
33 0.39
34 0.33
35 0.28
36 0.23
37 0.21
38 0.17
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.2
43 0.17
44 0.16
45 0.15
46 0.14
47 0.16
48 0.21
49 0.18
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.14
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.15
63 0.16
64 0.17
65 0.17
66 0.19
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.13
71 0.13
72 0.11
73 0.11
74 0.09
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.15
81 0.15
82 0.17
83 0.16
84 0.22
85 0.24
86 0.26
87 0.25
88 0.24
89 0.23
90 0.21
91 0.18
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.12
96 0.15
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.16
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.1
108 0.09
109 0.06
110 0.04
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.06
122 0.06
123 0.11
124 0.18
125 0.18
126 0.18
127 0.2
128 0.2
129 0.21
130 0.23
131 0.22
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.12
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.15
150 0.2
151 0.26
152 0.32
153 0.41
154 0.51
155 0.6
156 0.71
157 0.75
158 0.81
159 0.84
160 0.83
161 0.82
162 0.78
163 0.73
164 0.69
165 0.6
166 0.5
167 0.41
168 0.33
169 0.26
170 0.2
171 0.17
172 0.12
173 0.15
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.19
179 0.22
180 0.24
181 0.23
182 0.21
183 0.23
184 0.24
185 0.24
186 0.21
187 0.24
188 0.22
189 0.24
190 0.24
191 0.22
192 0.22
193 0.22
194 0.23
195 0.18
196 0.16
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.22
205 0.2
206 0.2
207 0.2
208 0.19
209 0.17
210 0.16
211 0.17
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.16
216 0.17
217 0.18
218 0.22
219 0.23
220 0.29
221 0.39
222 0.47
223 0.51
224 0.59
225 0.67
226 0.73
227 0.81
228 0.86
229 0.86
230 0.84
231 0.84
232 0.81
233 0.75
234 0.64
235 0.54
236 0.44
237 0.35
238 0.28
239 0.2
240 0.14
241 0.13