Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DKA6

Protein Details
Accession B0DKA6    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
165-188RYSPEYRRRRSYSRSPPPRGSSPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-142RGGDREKDR
146-191GRENRDWRDRRSPPPSRGGRYSPEYRRRRSYSRSPPPRGSSPPPRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_237463  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12363  RRM_TRA2  
Amino Acid Sequences RQAPNPSNVLGVFGLSIRTQERDLDEEFSRFGRVEKVTIVYDQRQSDRSRGFGFIKMATVEDATRCIQELNGVDLNGRRIRVDYSVTDRPHAPTPGEYMGHRRAGGRDSYHGDRRDHRDSSYRDSHRDRDSGRRGGDREKDRDLYGRENRDWRDRRSPPPSRGGRYSPEYRRRRSYSRSPPPRGSSPPPRRERDYDAPSTAAPAAAADAPRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.1
3 0.12
4 0.11
5 0.13
6 0.14
7 0.16
8 0.19
9 0.21
10 0.23
11 0.25
12 0.25
13 0.24
14 0.24
15 0.23
16 0.21
17 0.17
18 0.16
19 0.18
20 0.17
21 0.18
22 0.19
23 0.21
24 0.21
25 0.24
26 0.27
27 0.25
28 0.29
29 0.31
30 0.32
31 0.33
32 0.34
33 0.38
34 0.36
35 0.36
36 0.33
37 0.34
38 0.33
39 0.33
40 0.33
41 0.27
42 0.26
43 0.22
44 0.2
45 0.17
46 0.15
47 0.12
48 0.1
49 0.11
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.11
56 0.12
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.16
62 0.2
63 0.18
64 0.17
65 0.13
66 0.12
67 0.14
68 0.15
69 0.17
70 0.16
71 0.21
72 0.28
73 0.28
74 0.29
75 0.28
76 0.29
77 0.29
78 0.28
79 0.22
80 0.16
81 0.18
82 0.19
83 0.19
84 0.17
85 0.19
86 0.21
87 0.22
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.19
92 0.21
93 0.17
94 0.16
95 0.19
96 0.23
97 0.28
98 0.31
99 0.31
100 0.34
101 0.39
102 0.42
103 0.39
104 0.37
105 0.39
106 0.39
107 0.44
108 0.49
109 0.44
110 0.45
111 0.48
112 0.51
113 0.47
114 0.48
115 0.44
116 0.44
117 0.49
118 0.49
119 0.47
120 0.46
121 0.45
122 0.47
123 0.53
124 0.5
125 0.47
126 0.46
127 0.45
128 0.42
129 0.45
130 0.41
131 0.41
132 0.42
133 0.43
134 0.42
135 0.46
136 0.48
137 0.54
138 0.56
139 0.54
140 0.57
141 0.57
142 0.63
143 0.67
144 0.73
145 0.68
146 0.73
147 0.74
148 0.7
149 0.69
150 0.65
151 0.6
152 0.58
153 0.62
154 0.62
155 0.64
156 0.67
157 0.68
158 0.72
159 0.74
160 0.75
161 0.74
162 0.75
163 0.76
164 0.79
165 0.83
166 0.82
167 0.83
168 0.82
169 0.81
170 0.77
171 0.75
172 0.75
173 0.75
174 0.77
175 0.78
176 0.78
177 0.77
178 0.76
179 0.77
180 0.76
181 0.73
182 0.69
183 0.63
184 0.58
185 0.51
186 0.47
187 0.38
188 0.27
189 0.19
190 0.13
191 0.11
192 0.12