Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DGP1

Protein Details
Accession B0DGP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-27LNSTPLQPRLPKRPRINNQNDSPLPSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_300403  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
Amino Acid Sequences MLNSTPLQPRLPKRPRINNQNDSPLPSLTSPSPSTPIAIRPPFLTLNQNLSYTTPQRPLASQKSRKIYRNGYESKPKTPSYTPYKLNNPGHPRQHAFAFSNFQKLPAMETISARRWNELAISEGVLKVGQHLRDYQVEASNIILSRWWDLCVIAPTGAGKSLLWVLPLLAQRKAIAVVIIPYTSLGFQGEQRHSGSNIKCTFLHSGANSKAELEEIARGGEKHVIYTCVEMLETPGVAQVLHSASFQAQLSGVYIDEAHVLHESHSWRPGYARLNILRTIIGTDAPLVCISATLPKRYRNSLQIFAGLRPDYYLINLGNFRPELSTIISHMQHPASSFLDLAFVLPWNSTAESIQQTIIYSDDLDVLTSMFWWFHARLGSINLPVTLIDILHAGLSEKHQKLCTADFIAGKSRILLGSDKIGAGMDFPHVTLVVQYRCRGLTIVRWEQRRGRGGRRDGITALGVILVEKSMTGDDDNDNLSTQCPKSEDPGMLDLIQTEGCQEAVVDVWLENPPRETLALCGRCSNCNPALCLSTNYSWVMEDPRPHKERA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.85
3 0.89
4 0.91
5 0.9
6 0.88
7 0.88
8 0.8
9 0.75
10 0.67
11 0.56
12 0.48
13 0.39
14 0.35
15 0.26
16 0.3
17 0.26
18 0.26
19 0.29
20 0.27
21 0.28
22 0.27
23 0.31
24 0.35
25 0.35
26 0.34
27 0.32
28 0.35
29 0.36
30 0.36
31 0.37
32 0.3
33 0.35
34 0.35
35 0.35
36 0.31
37 0.31
38 0.35
39 0.33
40 0.35
41 0.32
42 0.33
43 0.34
44 0.37
45 0.44
46 0.48
47 0.55
48 0.59
49 0.62
50 0.7
51 0.76
52 0.79
53 0.79
54 0.78
55 0.75
56 0.77
57 0.75
58 0.73
59 0.76
60 0.73
61 0.72
62 0.68
63 0.62
64 0.57
65 0.54
66 0.55
67 0.54
68 0.58
69 0.57
70 0.58
71 0.65
72 0.69
73 0.71
74 0.72
75 0.71
76 0.71
77 0.73
78 0.72
79 0.67
80 0.6
81 0.58
82 0.53
83 0.48
84 0.43
85 0.42
86 0.37
87 0.41
88 0.38
89 0.35
90 0.32
91 0.29
92 0.28
93 0.24
94 0.26
95 0.2
96 0.23
97 0.27
98 0.3
99 0.36
100 0.33
101 0.31
102 0.28
103 0.27
104 0.26
105 0.22
106 0.2
107 0.15
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.17
119 0.2
120 0.22
121 0.25
122 0.24
123 0.23
124 0.23
125 0.21
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.14
130 0.13
131 0.1
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.11
136 0.11
137 0.13
138 0.14
139 0.15
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.1
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.12
154 0.17
155 0.18
156 0.16
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.18
161 0.13
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.09
175 0.16
176 0.18
177 0.2
178 0.21
179 0.22
180 0.23
181 0.29
182 0.28
183 0.29
184 0.29
185 0.29
186 0.28
187 0.29
188 0.31
189 0.25
190 0.27
191 0.19
192 0.23
193 0.23
194 0.25
195 0.22
196 0.19
197 0.18
198 0.15
199 0.14
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.09
216 0.09
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.09
250 0.11
251 0.11
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.15
256 0.19
257 0.2
258 0.21
259 0.25
260 0.24
261 0.27
262 0.27
263 0.27
264 0.22
265 0.19
266 0.16
267 0.11
268 0.09
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.11
279 0.12
280 0.16
281 0.19
282 0.25
283 0.28
284 0.32
285 0.35
286 0.37
287 0.41
288 0.41
289 0.39
290 0.39
291 0.38
292 0.34
293 0.34
294 0.25
295 0.2
296 0.15
297 0.15
298 0.1
299 0.09
300 0.11
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.14
315 0.15
316 0.14
317 0.16
318 0.15
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.09
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.1
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.05
359 0.07
360 0.07
361 0.09
362 0.11
363 0.11
364 0.12
365 0.16
366 0.18
367 0.17
368 0.17
369 0.15
370 0.14
371 0.13
372 0.13
373 0.09
374 0.07
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.09
383 0.17
384 0.19
385 0.21
386 0.22
387 0.24
388 0.26
389 0.28
390 0.29
391 0.23
392 0.24
393 0.23
394 0.24
395 0.28
396 0.27
397 0.24
398 0.2
399 0.19
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.12
404 0.14
405 0.15
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.11
410 0.1
411 0.09
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.14
420 0.17
421 0.2
422 0.21
423 0.23
424 0.23
425 0.24
426 0.23
427 0.19
428 0.22
429 0.29
430 0.38
431 0.42
432 0.45
433 0.5
434 0.55
435 0.61
436 0.62
437 0.59
438 0.59
439 0.63
440 0.67
441 0.7
442 0.66
443 0.61
444 0.53
445 0.49
446 0.4
447 0.3
448 0.22
449 0.15
450 0.12
451 0.08
452 0.08
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.09
461 0.1
462 0.12
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.14
468 0.17
469 0.16
470 0.17
471 0.19
472 0.19
473 0.24
474 0.29
475 0.3
476 0.29
477 0.31
478 0.31
479 0.28
480 0.27
481 0.22
482 0.18
483 0.16
484 0.11
485 0.09
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.06
490 0.05
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.06
495 0.08
496 0.11
497 0.13
498 0.14
499 0.15
500 0.15
501 0.16
502 0.17
503 0.16
504 0.18
505 0.27
506 0.31
507 0.31
508 0.37
509 0.38
510 0.42
511 0.44
512 0.47
513 0.42
514 0.4
515 0.42
516 0.38
517 0.41
518 0.38
519 0.39
520 0.37
521 0.33
522 0.32
523 0.31
524 0.28
525 0.24
526 0.24
527 0.26
528 0.25
529 0.31
530 0.33
531 0.42