Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9XIM3

Protein Details
Accession S9XIM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
822-846VVISQPKKAINKEKLNKDKRPTFTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
559-562KKRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd12299  RRM4_Prp24  
Amino Acid Sequences MNSSGNLEHGSTNMEMDTTVSSESKPSLVSELLEFTLQHPYNYEGHVKLIEELKQHGLKDDLHSARKRFQSLFPLSEDIWIEYLEDEKAVCNTLQDYERIIGLFESAVKDYLSIRLWRLYLDFLLTLVDPSTFSSQNAELQDVVSLQDVHALFKRAYESCKYHFSQSQRIWEQYLEFLEETGENLFENDQTISLQDRMYDFYVERLEIPHSQIEETFSSLSSFVTKNWSQDEYEVIMSNTNKIYEMNLSKFKKIYDNELQLSASNHSLECYMDLLNIESRRSTSIPSYIATLYERAICFYPLVGDLWLEYLAWVSKPDFPPQAFAIAERSVRNCPFVGRLWAIKLLYMIVVGLSNNAIQQEKETCLQMGLLSGFDEYCAFFSEYLKLCIYISSNELDPVLYIKNEIQVIENFMHHHFPGLRDDSLRIESAKINLFISLNDYESAERCWNGLQKDFQKSTQFWIIRYTATSRYNIELAIDSLRKGLYKDVDNPMLLFQFYESVVTLNHDCFTSISQFFDVTQAKKLFVKRSLTSQAQNQEIIPSMKEVQEKPTTSPDHAKKRKPTNGEDIIKKTRLPEKHRNREEFTILVSNLPNDISEKELQQFFKGCGNILQIFIYDDQEGKKIAQIEFSETSEVLAAKTKDLKQIKGHEVSIQIHVDTTLYVTNFPPTFDESKITDLFTKYGRVVQVRFPSLKFDTNRRFCYVQMSTPEEAHHALQLHSTTLGNQYELKVFISDPNKSGARSGAVYEKRELYLTNIDFSIDENQVRNFFQDYGTVESVRLPSRDSKSHMGFGYVVMSTSTEADNALNAAGKVLGKRVLNVVISQPKKAINKEKLNKDKRPTFTKLLNKSTDDSKSRPTTLNQVHSKSLGIINVDQTINEARLRSIFEPYGEIFRVVLHPEHEGAIVEYADIHNAGKAALAVEGMNLSGRELHVTTVNEMMHNNPDHNETLIPTPRPRKASARLGIQKFQNSRNQAETENNAKHDNEDAMQIDPPKTNDDFRRFLFKGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.11
4 0.12
5 0.09
6 0.11
7 0.11
8 0.11
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.16
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.19
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.15
23 0.24
24 0.23
25 0.22
26 0.21
27 0.24
28 0.26
29 0.29
30 0.32
31 0.23
32 0.25
33 0.26
34 0.25
35 0.25
36 0.27
37 0.27
38 0.25
39 0.27
40 0.32
41 0.34
42 0.33
43 0.32
44 0.31
45 0.3
46 0.33
47 0.39
48 0.39
49 0.44
50 0.5
51 0.51
52 0.56
53 0.59
54 0.6
55 0.54
56 0.53
57 0.55
58 0.56
59 0.56
60 0.52
61 0.5
62 0.44
63 0.44
64 0.39
65 0.3
66 0.23
67 0.2
68 0.16
69 0.13
70 0.14
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.19
84 0.18
85 0.2
86 0.18
87 0.17
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.16
99 0.18
100 0.18
101 0.2
102 0.23
103 0.23
104 0.24
105 0.24
106 0.23
107 0.2
108 0.19
109 0.17
110 0.13
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.1
118 0.14
119 0.13
120 0.14
121 0.17
122 0.18
123 0.22
124 0.24
125 0.22
126 0.18
127 0.18
128 0.18
129 0.15
130 0.14
131 0.11
132 0.09
133 0.08
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.17
138 0.19
139 0.17
140 0.19
141 0.24
142 0.21
143 0.25
144 0.29
145 0.32
146 0.34
147 0.42
148 0.42
149 0.44
150 0.47
151 0.49
152 0.52
153 0.53
154 0.59
155 0.56
156 0.56
157 0.52
158 0.47
159 0.43
160 0.36
161 0.31
162 0.24
163 0.19
164 0.17
165 0.16
166 0.14
167 0.14
168 0.11
169 0.1
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.15
185 0.16
186 0.17
187 0.14
188 0.16
189 0.18
190 0.17
191 0.17
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.19
196 0.19
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.2
201 0.18
202 0.18
203 0.16
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.1
211 0.17
212 0.18
213 0.2
214 0.23
215 0.25
216 0.23
217 0.24
218 0.26
219 0.21
220 0.21
221 0.2
222 0.16
223 0.18
224 0.17
225 0.19
226 0.16
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.14
231 0.17
232 0.21
233 0.24
234 0.33
235 0.35
236 0.37
237 0.38
238 0.38
239 0.39
240 0.36
241 0.4
242 0.4
243 0.44
244 0.44
245 0.44
246 0.43
247 0.36
248 0.36
249 0.29
250 0.21
251 0.15
252 0.13
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.13
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.16
268 0.16
269 0.17
270 0.15
271 0.19
272 0.2
273 0.2
274 0.22
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.16
279 0.13
280 0.15
281 0.15
282 0.14
283 0.14
284 0.13
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.09
289 0.1
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.13
303 0.15
304 0.2
305 0.24
306 0.23
307 0.27
308 0.26
309 0.28
310 0.22
311 0.21
312 0.21
313 0.18
314 0.2
315 0.18
316 0.19
317 0.2
318 0.21
319 0.22
320 0.19
321 0.18
322 0.2
323 0.2
324 0.23
325 0.21
326 0.21
327 0.21
328 0.24
329 0.22
330 0.19
331 0.18
332 0.13
333 0.11
334 0.09
335 0.07
336 0.04
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.08
347 0.1
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.09
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.09
369 0.14
370 0.15
371 0.17
372 0.16
373 0.15
374 0.14
375 0.15
376 0.15
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.1
395 0.13
396 0.13
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.12
402 0.13
403 0.11
404 0.12
405 0.16
406 0.18
407 0.18
408 0.17
409 0.18
410 0.18
411 0.19
412 0.18
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.15
417 0.16
418 0.14
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.11
423 0.14
424 0.12
425 0.11
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.12
431 0.1
432 0.09
433 0.09
434 0.1
435 0.13
436 0.14
437 0.17
438 0.21
439 0.25
440 0.32
441 0.33
442 0.34
443 0.35
444 0.34
445 0.35
446 0.37
447 0.33
448 0.26
449 0.29
450 0.27
451 0.23
452 0.24
453 0.23
454 0.2
455 0.21
456 0.22
457 0.2
458 0.2
459 0.2
460 0.19
461 0.16
462 0.11
463 0.1
464 0.11
465 0.1
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.1
472 0.11
473 0.13
474 0.18
475 0.21
476 0.23
477 0.23
478 0.22
479 0.21
480 0.18
481 0.15
482 0.1
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.14
505 0.15
506 0.13
507 0.18
508 0.18
509 0.19
510 0.22
511 0.25
512 0.25
513 0.28
514 0.32
515 0.28
516 0.33
517 0.38
518 0.38
519 0.37
520 0.37
521 0.36
522 0.32
523 0.32
524 0.26
525 0.2
526 0.19
527 0.18
528 0.13
529 0.1
530 0.1
531 0.12
532 0.15
533 0.14
534 0.18
535 0.23
536 0.24
537 0.25
538 0.3
539 0.3
540 0.29
541 0.37
542 0.4
543 0.46
544 0.52
545 0.57
546 0.59
547 0.67
548 0.72
549 0.7
550 0.67
551 0.66
552 0.68
553 0.67
554 0.63
555 0.59
556 0.57
557 0.51
558 0.46
559 0.4
560 0.37
561 0.39
562 0.43
563 0.48
564 0.54
565 0.64
566 0.72
567 0.74
568 0.72
569 0.68
570 0.62
571 0.52
572 0.43
573 0.35
574 0.27
575 0.23
576 0.18
577 0.15
578 0.12
579 0.12
580 0.09
581 0.07
582 0.07
583 0.09
584 0.1
585 0.11
586 0.13
587 0.16
588 0.17
589 0.17
590 0.18
591 0.16
592 0.19
593 0.19
594 0.16
595 0.15
596 0.18
597 0.17
598 0.16
599 0.15
600 0.11
601 0.12
602 0.12
603 0.12
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.1
609 0.09
610 0.11
611 0.13
612 0.13
613 0.16
614 0.16
615 0.2
616 0.21
617 0.22
618 0.21
619 0.17
620 0.17
621 0.14
622 0.13
623 0.08
624 0.11
625 0.1
626 0.11
627 0.16
628 0.18
629 0.25
630 0.28
631 0.32
632 0.34
633 0.42
634 0.46
635 0.45
636 0.44
637 0.38
638 0.4
639 0.37
640 0.34
641 0.27
642 0.21
643 0.17
644 0.16
645 0.13
646 0.09
647 0.09
648 0.07
649 0.06
650 0.08
651 0.08
652 0.12
653 0.12
654 0.12
655 0.13
656 0.15
657 0.18
658 0.18
659 0.21
660 0.18
661 0.22
662 0.22
663 0.22
664 0.2
665 0.19
666 0.19
667 0.17
668 0.18
669 0.15
670 0.17
671 0.19
672 0.2
673 0.21
674 0.26
675 0.31
676 0.33
677 0.34
678 0.31
679 0.34
680 0.34
681 0.39
682 0.35
683 0.38
684 0.44
685 0.5
686 0.54
687 0.53
688 0.51
689 0.45
690 0.5
691 0.44
692 0.38
693 0.36
694 0.38
695 0.35
696 0.34
697 0.34
698 0.28
699 0.26
700 0.21
701 0.18
702 0.14
703 0.13
704 0.14
705 0.14
706 0.12
707 0.12
708 0.11
709 0.1
710 0.13
711 0.14
712 0.13
713 0.13
714 0.14
715 0.15
716 0.16
717 0.15
718 0.12
719 0.12
720 0.17
721 0.2
722 0.21
723 0.2
724 0.24
725 0.24
726 0.24
727 0.24
728 0.2
729 0.18
730 0.17
731 0.18
732 0.22
733 0.26
734 0.28
735 0.29
736 0.29
737 0.28
738 0.27
739 0.26
740 0.21
741 0.25
742 0.24
743 0.23
744 0.21
745 0.21
746 0.2
747 0.21
748 0.21
749 0.14
750 0.15
751 0.14
752 0.16
753 0.17
754 0.18
755 0.18
756 0.16
757 0.14
758 0.14
759 0.15
760 0.16
761 0.21
762 0.22
763 0.21
764 0.19
765 0.2
766 0.23
767 0.22
768 0.2
769 0.16
770 0.22
771 0.27
772 0.32
773 0.35
774 0.4
775 0.42
776 0.46
777 0.44
778 0.39
779 0.34
780 0.29
781 0.26
782 0.19
783 0.15
784 0.1
785 0.1
786 0.09
787 0.09
788 0.09
789 0.07
790 0.07
791 0.07
792 0.07
793 0.07
794 0.07
795 0.07
796 0.06
797 0.07
798 0.07
799 0.08
800 0.09
801 0.1
802 0.15
803 0.14
804 0.15
805 0.18
806 0.2
807 0.2
808 0.2
809 0.25
810 0.3
811 0.31
812 0.31
813 0.31
814 0.33
815 0.38
816 0.44
817 0.48
818 0.48
819 0.58
820 0.66
821 0.75
822 0.8
823 0.85
824 0.86
825 0.85
826 0.84
827 0.81
828 0.8
829 0.76
830 0.72
831 0.72
832 0.73
833 0.73
834 0.72
835 0.69
836 0.64
837 0.6
838 0.59
839 0.58
840 0.53
841 0.47
842 0.47
843 0.48
844 0.48
845 0.49
846 0.45
847 0.48
848 0.51
849 0.57
850 0.56
851 0.54
852 0.53
853 0.5
854 0.48
855 0.4
856 0.34
857 0.26
858 0.22
859 0.2
860 0.19
861 0.22
862 0.21
863 0.19
864 0.18
865 0.18
866 0.18
867 0.17
868 0.16
869 0.13
870 0.15
871 0.2
872 0.19
873 0.22
874 0.22
875 0.21
876 0.24
877 0.25
878 0.28
879 0.24
880 0.23
881 0.18
882 0.18
883 0.19
884 0.18
885 0.18
886 0.15
887 0.16
888 0.16
889 0.17
890 0.16
891 0.15
892 0.13
893 0.13
894 0.11
895 0.09
896 0.09
897 0.08
898 0.09
899 0.09
900 0.08
901 0.07
902 0.07
903 0.07
904 0.07
905 0.07
906 0.07
907 0.07
908 0.07
909 0.06
910 0.06
911 0.07
912 0.06
913 0.07
914 0.06
915 0.07
916 0.08
917 0.08
918 0.1
919 0.11
920 0.12
921 0.16
922 0.18
923 0.19
924 0.22
925 0.23
926 0.21
927 0.21
928 0.22
929 0.24
930 0.24
931 0.24
932 0.21
933 0.24
934 0.24
935 0.25
936 0.24
937 0.19
938 0.25
939 0.3
940 0.32
941 0.37
942 0.44
943 0.49
944 0.53
945 0.56
946 0.58
947 0.6
948 0.67
949 0.66
950 0.69
951 0.72
952 0.73
953 0.74
954 0.72
955 0.71
956 0.66
957 0.65
958 0.63
959 0.59
960 0.58
961 0.57
962 0.54
963 0.49
964 0.5
965 0.5
966 0.5
967 0.49
968 0.48
969 0.45
970 0.42
971 0.4
972 0.37
973 0.34
974 0.26
975 0.25
976 0.23
977 0.22
978 0.25
979 0.26
980 0.25
981 0.25
982 0.26
983 0.27
984 0.28
985 0.34
986 0.41
987 0.45
988 0.48
989 0.48
990 0.57