FuNGI

B0DBJ1

Protein Details

Accession

B0DBJ1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-126	RPTNEFLRTRRRIGRRRHPMDPDY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
112-118	RRRIGRR

Subcellular Location(s)

extr 15, nucl 5, plas 2, E.R. 2, golg 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR036053 PABP-dom IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0051028 P:mRNA transport
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_327221 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MFSWRKSVLIIILVATSVAAAPSPKDTRHVRDGSLDNPSFANHAPVWNEGAASEPLIAIEGETPQYEWDLPAMTTLKEERFQELMRIFIGTPQPPKSGVQPARPTNEFLRTRRRIGRRRHPMDPDYQHPQDSDFQGPQPHPYLHDPLLHITNLPSYVSDENLAVAFMTCGPFRPKIPRDSASGLLSGTIEFKFLEKAEKALATLQSRLIPNLQPPVPLVLSPYPPTNPPTPLPPPSALPRLVKHLPPGYTDSQLFDLFRPFGALASARTQTHFGADTGMVEFWNENDARQAEDSLHCADIEGQNIAVQVYQPRRTSGGAIPEFNASAPTFVPSGSMYSPYPTQNLDPDIDSNGLFTHFRQFGMIVSARVMRNENGESRGFGFVSYQTPDQANAAMHAMNGAQLGSKQVVVRLHEPKQLRQEKLAQRFGHNGHPRSSSGATSPTASEVGDYSGWGSPRLLPTSLGSPKGSIYERPERGRRGSGSYYNAALTGTLNLPMRYDDLASLSPVVRKEVLTGELSRRVKKLDIVPAKEINSIVESLVNVSLSEVLQYVEDPGRLQEQVEIIKAKRFKASTPEKSPSRSASASQDSRLLDPNALNATASAPEHPSTPISVSESSSPPRTSSPSGSVPPISERDRIIAAVGKLESTRHSELTDLLMSLPKRDRALCLFNAEYLRTKIADAKMVLDSEDGDEEEDRNPPDSQSTKSAPHTVPVTPQPKKTAPRVVDSPQTPDLSSRGPSANASPLPPTPGSASSTHTLASLSKLPAAEIIRLSNSSSATGLPLPKADPLVVQATDEFIDSLLGKPPQVQKQQLGDKLFKVVKSFGIKGAPKVTIALLDQEDLRALAHLMNSFPSVLKDKALRVAASLAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.11
3	0.09
4	0.06
5	0.05
6	0.05
7	0.05
8	0.07
9	0.14
10	0.18
11	0.19
12	0.26
13	0.33
14	0.39
15	0.49
16	0.51
17	0.47
18	0.51
19	0.54
20	0.51
21	0.55
22	0.48
23	0.39
24	0.36
25	0.34
26	0.28
27	0.25
28	0.26
29	0.17
30	0.2
31	0.21
32	0.22
33	0.25
34	0.22
35	0.22
36	0.17
37	0.19
38	0.16
39	0.15
40	0.13
41	0.1
42	0.09
43	0.1
44	0.1
45	0.07
46	0.07
47	0.08
48	0.09
49	0.09
50	0.1
51	0.09
52	0.11
53	0.11
54	0.11
55	0.1
56	0.11
57	0.11
58	0.14
59	0.16
60	0.14
61	0.17
62	0.2
63	0.22
64	0.24
65	0.26
66	0.26
67	0.29
68	0.29
69	0.33
70	0.31
71	0.29
72	0.25
73	0.26
74	0.22
75	0.23
76	0.28
77	0.25
78	0.29
79	0.31
80	0.33
81	0.33
82	0.35
83	0.35
84	0.4
85	0.42
86	0.46
87	0.52
88	0.57
89	0.62
90	0.62
91	0.61
92	0.55
93	0.58
94	0.56
95	0.52
96	0.57
97	0.55
98	0.62
99	0.67
100	0.73
101	0.72
102	0.76
103	0.82
104	0.82
105	0.83
106	0.85
107	0.84
108	0.78
109	0.79
110	0.75
111	0.7
112	0.68
113	0.63
114	0.55
115	0.46
116	0.44
117	0.39
118	0.36
119	0.34
120	0.28
121	0.28
122	0.33
123	0.33
124	0.34
125	0.33
126	0.3
127	0.29
128	0.32
129	0.35
130	0.32
131	0.36
132	0.33
133	0.32
134	0.34
135	0.3
136	0.26
137	0.21
138	0.2
139	0.17
140	0.15
141	0.12
142	0.13
143	0.13
144	0.14
145	0.14
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.11
150	0.08
151	0.07
152	0.06
153	0.06
154	0.08
155	0.07
156	0.1
157	0.14
158	0.16
159	0.19
160	0.29
161	0.33
162	0.39
163	0.47
164	0.47
165	0.5
166	0.52
167	0.53
168	0.45
169	0.4
170	0.32
171	0.25
172	0.23
173	0.16
174	0.13
175	0.09
176	0.08
177	0.07
178	0.08
179	0.1
180	0.1
181	0.15
182	0.14
183	0.16
184	0.18
185	0.18
186	0.18
187	0.2
188	0.24
189	0.21
190	0.22
191	0.22
192	0.24
193	0.24
194	0.24
195	0.24
196	0.21
197	0.22
198	0.27
199	0.26
200	0.22
201	0.22
202	0.25
203	0.23
204	0.21
205	0.21
206	0.17
207	0.2
208	0.2
209	0.22
210	0.19
211	0.21
212	0.25
213	0.24
214	0.25
215	0.23
216	0.29
217	0.32
218	0.35
219	0.38
220	0.35
221	0.35
222	0.37
223	0.41
224	0.37
225	0.35
226	0.33
227	0.36
228	0.38
229	0.36
230	0.37
231	0.37
232	0.34
233	0.33
234	0.37
235	0.33
236	0.32
237	0.31
238	0.27
239	0.25
240	0.24
241	0.22
242	0.17
243	0.17
244	0.14
245	0.14
246	0.14
247	0.11
248	0.1
249	0.11
250	0.11
251	0.1
252	0.13
253	0.15
254	0.14
255	0.15
256	0.16
257	0.15
258	0.16
259	0.16
260	0.12
261	0.12
262	0.12
263	0.12
264	0.11
265	0.11
266	0.09
267	0.08
268	0.08
269	0.06
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.11
274	0.11
275	0.13
276	0.13
277	0.14
278	0.12
279	0.13
280	0.15
281	0.13
282	0.13
283	0.12
284	0.11
285	0.12
286	0.12
287	0.12
288	0.1
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.07
294	0.06
295	0.1
296	0.15
297	0.2
298	0.2
299	0.21
300	0.23
301	0.24
302	0.27
303	0.25
304	0.3
305	0.27
306	0.27
307	0.27
308	0.25
309	0.25
310	0.21
311	0.2
312	0.1
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.07
320	0.09
321	0.09
322	0.11
323	0.1
324	0.11
325	0.14
326	0.14
327	0.15
328	0.14
329	0.14
330	0.15
331	0.17
332	0.16
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.14
337	0.13
338	0.11
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.08
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.16
350	0.17
351	0.11
352	0.11
353	0.15
354	0.15
355	0.15
356	0.17
357	0.12
358	0.14
359	0.16
360	0.17
361	0.16
362	0.17
363	0.16
364	0.17
365	0.17
366	0.14
367	0.12
368	0.11
369	0.1
370	0.11
371	0.12
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.11
377	0.11
378	0.09
379	0.08
380	0.09
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.05
391	0.05
392	0.06
393	0.06
394	0.08
395	0.1
396	0.13
397	0.18
398	0.22
399	0.25
400	0.29
401	0.31
402	0.32
403	0.41
404	0.45
405	0.41
406	0.39
407	0.45
408	0.48
409	0.55
410	0.59
411	0.49
412	0.45
413	0.48
414	0.47
415	0.47
416	0.45
417	0.39
418	0.34
419	0.35
420	0.34
421	0.33
422	0.32
423	0.23
424	0.18
425	0.18
426	0.16
427	0.14
428	0.14
429	0.11
430	0.1
431	0.1
432	0.09
433	0.06
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.09
443	0.11
444	0.13
445	0.12
446	0.11
447	0.12
448	0.18
449	0.2
450	0.2
451	0.18
452	0.17
453	0.17
454	0.19
455	0.19
456	0.15
457	0.19
458	0.26
459	0.31
460	0.35
461	0.4
462	0.4
463	0.42
464	0.44
465	0.4
466	0.37
467	0.36
468	0.36
469	0.35
470	0.33
471	0.3
472	0.26
473	0.24
474	0.18
475	0.14
476	0.1
477	0.08
478	0.06
479	0.08
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.1
485	0.09
486	0.1
487	0.07
488	0.09
489	0.09
490	0.09
491	0.1
492	0.09
493	0.11
494	0.1
495	0.11
496	0.1
497	0.1
498	0.11
499	0.12
500	0.13
501	0.13
502	0.15
503	0.16
504	0.23
505	0.26
506	0.26
507	0.26
508	0.25
509	0.24
510	0.27
511	0.3
512	0.32
513	0.38
514	0.4
515	0.43
516	0.44
517	0.44
518	0.41
519	0.35
520	0.26
521	0.19
522	0.16
523	0.11
524	0.09
525	0.07
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.06
530	0.05
531	0.06
532	0.05
533	0.06
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.08
543	0.09
544	0.1
545	0.1
546	0.09
547	0.11
548	0.12
549	0.14
550	0.15
551	0.14
552	0.19
553	0.21
554	0.21
555	0.24
556	0.24
557	0.23
558	0.31
559	0.41
560	0.46
561	0.51
562	0.58
563	0.56
564	0.59
565	0.6
566	0.53
567	0.48
568	0.4
569	0.34
570	0.34
571	0.38
572	0.37
573	0.35
574	0.36
575	0.31
576	0.31
577	0.32
578	0.26
579	0.2
580	0.18
581	0.2
582	0.17
583	0.16
584	0.14
585	0.11
586	0.11
587	0.1
588	0.1
589	0.09
590	0.09
591	0.1
592	0.11
593	0.12
594	0.11
595	0.11
596	0.12
597	0.13
598	0.14
599	0.15
600	0.15
601	0.17
602	0.19
603	0.21
604	0.23
605	0.23
606	0.21
607	0.22
608	0.25
609	0.26
610	0.27
611	0.3
612	0.31
613	0.33
614	0.34
615	0.32
616	0.29
617	0.29
618	0.3
619	0.27
620	0.24
621	0.23
622	0.23
623	0.23
624	0.22
625	0.2
626	0.19
627	0.16
628	0.16
629	0.15
630	0.14
631	0.13
632	0.14
633	0.15
634	0.17
635	0.19
636	0.17
637	0.18
638	0.18
639	0.18
640	0.21
641	0.2
642	0.14
643	0.12
644	0.15
645	0.15
646	0.18
647	0.21
648	0.2
649	0.22
650	0.22
651	0.26
652	0.28
653	0.34
654	0.32
655	0.35
656	0.32
657	0.33
658	0.34
659	0.32
660	0.29
661	0.25
662	0.24
663	0.18
664	0.19
665	0.21
666	0.22
667	0.25
668	0.23
669	0.23
670	0.24
671	0.23
672	0.23
673	0.17
674	0.16
675	0.12
676	0.12
677	0.09
678	0.08
679	0.09
680	0.09
681	0.1
682	0.13
683	0.12
684	0.14
685	0.15
686	0.14
687	0.2
688	0.21
689	0.24
690	0.28
691	0.31
692	0.33
693	0.36
694	0.43
695	0.38
696	0.39
697	0.39
698	0.34
699	0.35
700	0.39
701	0.45
702	0.42
703	0.45
704	0.48
705	0.52
706	0.57
707	0.59
708	0.6
709	0.54
710	0.57
711	0.59
712	0.57
713	0.58
714	0.54
715	0.52
716	0.47
717	0.45
718	0.38
719	0.33
720	0.31
721	0.26
722	0.26
723	0.23
724	0.2
725	0.2
726	0.21
727	0.22
728	0.27
729	0.25
730	0.25
731	0.25
732	0.24
733	0.27
734	0.26
735	0.25
736	0.21
737	0.22
738	0.24
739	0.22
740	0.25
741	0.23
742	0.23
743	0.22
744	0.19
745	0.17
746	0.15
747	0.17
748	0.18
749	0.17
750	0.19
751	0.19
752	0.19
753	0.23
754	0.24
755	0.23
756	0.19
757	0.2
758	0.2
759	0.21
760	0.22
761	0.2
762	0.19
763	0.17
764	0.16
765	0.14
766	0.14
767	0.17
768	0.18
769	0.16
770	0.17
771	0.17
772	0.19
773	0.2
774	0.18
775	0.15
776	0.16
777	0.2
778	0.18
779	0.18
780	0.16
781	0.16
782	0.16
783	0.16
784	0.12
785	0.08
786	0.09
787	0.09
788	0.1
789	0.14
790	0.14
791	0.14
792	0.2
793	0.28
794	0.36
795	0.43
796	0.48
797	0.49
798	0.58
799	0.67
800	0.68
801	0.66
802	0.61
803	0.54
804	0.57
805	0.53
806	0.45
807	0.4
808	0.35
809	0.36
810	0.39
811	0.39
812	0.35
813	0.41
814	0.42
815	0.43
816	0.47
817	0.41
818	0.35
819	0.34
820	0.3
821	0.24
822	0.23
823	0.23
824	0.18
825	0.18
826	0.18
827	0.17
828	0.17
829	0.14
830	0.13
831	0.09
832	0.09
833	0.09
834	0.11
835	0.12
836	0.13
837	0.14
838	0.15
839	0.15
840	0.15
841	0.17
842	0.2
843	0.19
844	0.23
845	0.26
846	0.28
847	0.34
848	0.38
849	0.34
850	0.31

B0DBJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer