Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9VWP2

Protein Details
Accession S9VWP2    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-33QGNAAPSQYNQRSRKNKKSWRKHIDLEDVEHydrophilic
63-86LGDDRVAKRSRKKIKPLKVDEILQHydrophilic
264-294ETHGKVEPKRKTKSQRNKERKRKEELAKLEABasic
333-357GTTEIRLKKRKFGKHKLPENPLELKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-78KRSRKKIKP
269-292VEPKRKTKSQRNKERKRKEELAKL
340-348KKRKFGKHK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MGIQGNAAPSQYNQRSRKNKKSWRKHIDLEDVEGGLQAAGEEEIRGDNLAKKSNDALFVVDTLGDDRVAKRSRKKIKPLKVDEILQNKSAIGELSSKPKSNGFGLSMDNKGKVMSKNELNRLKSLVHRNPLGPTASAAAASLKSQEKEPIEYDVWESTAESTIPVKRPSSLSKAPENLADNAELVPNVEVADPGMSYNPDANAWMGLIDRKGSGEIKKEKERLHEIEVQKMISLKMNEDKGLISDENERSGDEENTTEAEKQIETHGKVEPKRKTKSQRNKERKRKEELAKLEAAKKQEQLLKMVDKAPSISKTLNNKEENEEKSLVDSNNSGTTEIRLKKRKFGKHKLPENPLELKLGDELTSSLRELKPEGNLFKDRFISLQRRAIIPPSVPASKRARYGTKLKEKYSHKDFHLQKTGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.65
3 0.75
4 0.84
5 0.85
6 0.88
7 0.9
8 0.94
9 0.95
10 0.94
11 0.92
12 0.9
13 0.88
14 0.88
15 0.8
16 0.74
17 0.65
18 0.54
19 0.45
20 0.36
21 0.27
22 0.16
23 0.13
24 0.07
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.08
34 0.14
35 0.18
36 0.25
37 0.25
38 0.27
39 0.31
40 0.34
41 0.35
42 0.29
43 0.28
44 0.21
45 0.22
46 0.2
47 0.15
48 0.12
49 0.11
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.17
55 0.23
56 0.29
57 0.37
58 0.47
59 0.58
60 0.67
61 0.77
62 0.8
63 0.84
64 0.89
65 0.89
66 0.88
67 0.83
68 0.78
69 0.75
70 0.72
71 0.64
72 0.54
73 0.46
74 0.36
75 0.31
76 0.26
77 0.18
78 0.11
79 0.13
80 0.14
81 0.22
82 0.25
83 0.26
84 0.27
85 0.29
86 0.3
87 0.28
88 0.29
89 0.23
90 0.23
91 0.25
92 0.27
93 0.29
94 0.28
95 0.26
96 0.23
97 0.21
98 0.22
99 0.22
100 0.24
101 0.25
102 0.31
103 0.38
104 0.47
105 0.54
106 0.52
107 0.5
108 0.48
109 0.44
110 0.44
111 0.47
112 0.45
113 0.43
114 0.43
115 0.43
116 0.43
117 0.43
118 0.38
119 0.27
120 0.21
121 0.18
122 0.15
123 0.14
124 0.12
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.13
132 0.18
133 0.18
134 0.21
135 0.22
136 0.23
137 0.22
138 0.22
139 0.23
140 0.18
141 0.17
142 0.14
143 0.13
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.09
149 0.12
150 0.15
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.21
155 0.25
156 0.31
157 0.33
158 0.34
159 0.38
160 0.4
161 0.39
162 0.39
163 0.37
164 0.31
165 0.26
166 0.22
167 0.16
168 0.14
169 0.13
170 0.1
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.08
200 0.1
201 0.17
202 0.24
203 0.29
204 0.36
205 0.41
206 0.42
207 0.45
208 0.5
209 0.46
210 0.44
211 0.46
212 0.41
213 0.42
214 0.41
215 0.35
216 0.29
217 0.26
218 0.21
219 0.16
220 0.16
221 0.12
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.16
226 0.15
227 0.13
228 0.15
229 0.13
230 0.1
231 0.15
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.16
236 0.14
237 0.16
238 0.15
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.12
250 0.16
251 0.17
252 0.18
253 0.22
254 0.27
255 0.32
256 0.39
257 0.44
258 0.47
259 0.52
260 0.6
261 0.66
262 0.72
263 0.78
264 0.81
265 0.84
266 0.87
267 0.92
268 0.94
269 0.95
270 0.92
271 0.9
272 0.89
273 0.86
274 0.85
275 0.8
276 0.75
277 0.7
278 0.64
279 0.61
280 0.54
281 0.48
282 0.41
283 0.35
284 0.35
285 0.33
286 0.32
287 0.3
288 0.32
289 0.31
290 0.31
291 0.33
292 0.29
293 0.25
294 0.26
295 0.26
296 0.23
297 0.23
298 0.23
299 0.25
300 0.33
301 0.41
302 0.47
303 0.47
304 0.48
305 0.5
306 0.55
307 0.52
308 0.48
309 0.42
310 0.33
311 0.32
312 0.34
313 0.29
314 0.23
315 0.21
316 0.17
317 0.2
318 0.2
319 0.19
320 0.15
321 0.17
322 0.24
323 0.3
324 0.37
325 0.42
326 0.44
327 0.52
328 0.62
329 0.7
330 0.73
331 0.77
332 0.79
333 0.81
334 0.89
335 0.9
336 0.89
337 0.85
338 0.8
339 0.75
340 0.65
341 0.57
342 0.46
343 0.38
344 0.3
345 0.24
346 0.18
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.17
353 0.16
354 0.18
355 0.2
356 0.22
357 0.27
358 0.32
359 0.35
360 0.37
361 0.43
362 0.43
363 0.45
364 0.44
365 0.38
366 0.34
367 0.38
368 0.41
369 0.41
370 0.46
371 0.45
372 0.45
373 0.46
374 0.48
375 0.45
376 0.37
377 0.36
378 0.34
379 0.38
380 0.36
381 0.41
382 0.44
383 0.45
384 0.5
385 0.52
386 0.54
387 0.54
388 0.64
389 0.67
390 0.71
391 0.74
392 0.73
393 0.75
394 0.75
395 0.78
396 0.78
397 0.75
398 0.69
399 0.71
400 0.72
401 0.74