Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9VMI6

Protein Details
Accession S9VMI6    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-121SPTPNKRKTRDPAQPKRPPTHydrophilic
238-263MSSPITASRKQNKKKRSSNNAAAESQHydrophilic
276-305AEPNPSPSAGKRDKKKRRKSSVNPNSAPTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
283-294SAGKRDKKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAEEHGNLQKLSSSISKLEDAFKLALGACQDIKEYLPVLIAEKGDVSKPQGKASKNENSKQNVNKESSTAAAKDTTTVEAPVPSISAVQAGSSVNEPVASVSPTPNKRKTRDPAQPKRPPTAYNLFQKSQRSEIKDSLGEKGNDVKEVNKAMHEKWTSLSETDRKPFEEEASKLRETYEAEMSAFQASRESVSSPAPAAAADGESQEANSIAVSMPTTPANNNYIEFSETRPLAQASMSSPITASRKQNKKKRSSNNAAAESQTQPDDASTSAEKAEPNPSPSAGKRDKKKRRKSSVNPNSAPTAATASI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.26
4 0.25
5 0.29
6 0.27
7 0.27
8 0.24
9 0.22
10 0.2
11 0.18
12 0.18
13 0.15
14 0.16
15 0.14
16 0.13
17 0.14
18 0.13
19 0.14
20 0.14
21 0.13
22 0.11
23 0.12
24 0.11
25 0.13
26 0.14
27 0.14
28 0.12
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.18
34 0.22
35 0.24
36 0.3
37 0.35
38 0.37
39 0.42
40 0.49
41 0.53
42 0.55
43 0.61
44 0.61
45 0.62
46 0.67
47 0.69
48 0.69
49 0.65
50 0.61
51 0.55
52 0.49
53 0.44
54 0.38
55 0.33
56 0.25
57 0.2
58 0.17
59 0.16
60 0.16
61 0.16
62 0.15
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.08
71 0.07
72 0.06
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.07
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.1
89 0.18
90 0.25
91 0.32
92 0.4
93 0.46
94 0.49
95 0.58
96 0.63
97 0.65
98 0.69
99 0.73
100 0.75
101 0.79
102 0.84
103 0.79
104 0.78
105 0.7
106 0.62
107 0.57
108 0.54
109 0.5
110 0.5
111 0.51
112 0.45
113 0.47
114 0.49
115 0.45
116 0.43
117 0.42
118 0.39
119 0.38
120 0.38
121 0.38
122 0.37
123 0.36
124 0.32
125 0.32
126 0.26
127 0.23
128 0.26
129 0.23
130 0.21
131 0.21
132 0.18
133 0.16
134 0.18
135 0.17
136 0.15
137 0.16
138 0.15
139 0.22
140 0.21
141 0.2
142 0.19
143 0.21
144 0.19
145 0.18
146 0.2
147 0.19
148 0.21
149 0.24
150 0.24
151 0.23
152 0.24
153 0.24
154 0.24
155 0.24
156 0.22
157 0.23
158 0.28
159 0.27
160 0.25
161 0.24
162 0.23
163 0.19
164 0.2
165 0.18
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.12
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.11
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.19
216 0.18
217 0.18
218 0.18
219 0.17
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.1
224 0.15
225 0.15
226 0.14
227 0.13
228 0.17
229 0.21
230 0.24
231 0.31
232 0.36
233 0.47
234 0.57
235 0.66
236 0.72
237 0.79
238 0.85
239 0.87
240 0.88
241 0.88
242 0.89
243 0.89
244 0.85
245 0.76
246 0.67
247 0.59
248 0.5
249 0.41
250 0.32
251 0.22
252 0.16
253 0.15
254 0.14
255 0.11
256 0.13
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.17
263 0.23
264 0.23
265 0.26
266 0.27
267 0.28
268 0.32
269 0.34
270 0.42
271 0.45
272 0.51
273 0.57
274 0.66
275 0.76
276 0.81
277 0.9
278 0.91
279 0.92
280 0.95
281 0.95
282 0.95
283 0.95
284 0.95
285 0.88
286 0.81
287 0.74
288 0.63
289 0.53
290 0.42