Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PD99

Protein Details
Accession A0A1D8PD99    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-126RVDVAKRRDRKPQEGNERQEKSHBasic
289-309EPEKKEESSHPKKKSNRQEPFBasic
645-671KEMIARNQNKDNSKKRKRDDNEEEDNGHydrophilic
674-710ESTSKGKKFGSSDKKQKKARKGSQKKGNMNKGAPKSEHydrophilic
722-741LSENVKKIIGLKRKRRKSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-118AKRRDRKPQEG
641-662RRREKEMIARNQNKDNSKKRKR
678-741KGKKFGSSDKKQKKARKGSQKKGNMNKGAPKSEESQKEPTNKSGLSENVKKIIGLKRKRRKSKK
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034809  Nop4_RRM4  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0070180  F:large ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG cal:CAALFM_C104390CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12677  RRM4_Nop4p  
Amino Acid Sequences MSEEDVNKSNVMVESVDLKQESVKNQDDGLDRKTLFVRSIPFEATSEELSEFFSQFVPVKHAVIVTDNERKSRGFGFVSFTLDDDCLTALVESRKTKFKDRLLRVDVAKRRDRKPQEGNERQEKSHVEPIEKRRARLIIRNLPWSCKKPDELKKIFSKYGAVFDAYIPKKKGGQMCGFAFVIMKKNSAAEKAVEGCQGLKIDGREVAVDFAVEKSKWEQMKDEEVEEEEDNESSEEEEEADSTNKDENDEEEEDKDDESDNDDASSEFDELNEVNSDKELDSFDEEMEEPEKKEESSHPKKKSNRQEPFSIFVRNIPYDADTESLKEHFSTFGTVKYALPVVDKETGLAKGSAFVAFAKEDAYLDCLDNAPTVASTSMLIADDVSPSYVYQGRILSIASAVDRDSASKLADRNSLKRKEALGKAPGEKDKRNLFLLNEGRITENSKLAQYISKTDLELREKSYKLRTQQLKKNPTLHLSLTRLAIRNLPRAMNAKALKALGRKAVVQFATEVKEGKRQPLSKEEVNRSVKFKHSIYGADAEEEIAKSKNSKHKGVVKQAKVIMEVKGSGEIGRSRGYGFIEFRDHKAALMGLRWLNAHEVSIPEILEGLTDEEKKLAELEGLNKRRLIVEFAIENAQVVKRRREKEMIARNQNKDNSKKRKRDDNEEEDNGDAESTSKGKKFGSSDKKQKKARKGSQKKGNMNKGAPKSEESQKEPTNKSGLSENVKKIIGLKRKRRKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.2
4 0.18
5 0.17
6 0.21
7 0.24
8 0.28
9 0.3
10 0.34
11 0.32
12 0.33
13 0.38
14 0.39
15 0.4
16 0.39
17 0.39
18 0.34
19 0.36
20 0.38
21 0.35
22 0.31
23 0.3
24 0.32
25 0.3
26 0.34
27 0.33
28 0.31
29 0.3
30 0.3
31 0.28
32 0.24
33 0.21
34 0.18
35 0.16
36 0.17
37 0.18
38 0.16
39 0.14
40 0.13
41 0.14
42 0.15
43 0.17
44 0.19
45 0.19
46 0.2
47 0.2
48 0.21
49 0.19
50 0.2
51 0.23
52 0.23
53 0.31
54 0.31
55 0.33
56 0.34
57 0.33
58 0.33
59 0.32
60 0.31
61 0.25
62 0.25
63 0.3
64 0.3
65 0.34
66 0.31
67 0.28
68 0.25
69 0.22
70 0.2
71 0.14
72 0.12
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.09
77 0.13
78 0.18
79 0.22
80 0.25
81 0.33
82 0.37
83 0.46
84 0.51
85 0.57
86 0.63
87 0.67
88 0.75
89 0.73
90 0.76
91 0.73
92 0.73
93 0.7
94 0.68
95 0.68
96 0.65
97 0.63
98 0.68
99 0.7
100 0.71
101 0.74
102 0.77
103 0.79
104 0.82
105 0.86
106 0.86
107 0.82
108 0.72
109 0.67
110 0.6
111 0.54
112 0.52
113 0.45
114 0.41
115 0.46
116 0.53
117 0.59
118 0.59
119 0.54
120 0.52
121 0.56
122 0.55
123 0.55
124 0.57
125 0.56
126 0.58
127 0.67
128 0.63
129 0.63
130 0.65
131 0.61
132 0.56
133 0.5
134 0.51
135 0.52
136 0.61
137 0.65
138 0.64
139 0.67
140 0.71
141 0.72
142 0.68
143 0.59
144 0.54
145 0.44
146 0.43
147 0.37
148 0.28
149 0.23
150 0.22
151 0.31
152 0.28
153 0.32
154 0.29
155 0.28
156 0.31
157 0.35
158 0.4
159 0.38
160 0.42
161 0.43
162 0.43
163 0.45
164 0.42
165 0.37
166 0.32
167 0.26
168 0.26
169 0.2
170 0.2
171 0.16
172 0.19
173 0.2
174 0.21
175 0.21
176 0.15
177 0.18
178 0.2
179 0.21
180 0.19
181 0.18
182 0.16
183 0.17
184 0.16
185 0.13
186 0.13
187 0.11
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.17
203 0.19
204 0.2
205 0.23
206 0.25
207 0.33
208 0.34
209 0.32
210 0.27
211 0.26
212 0.28
213 0.24
214 0.21
215 0.13
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.16
236 0.18
237 0.18
238 0.17
239 0.18
240 0.18
241 0.18
242 0.17
243 0.12
244 0.09
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.1
269 0.11
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.09
280 0.11
281 0.17
282 0.26
283 0.36
284 0.45
285 0.51
286 0.59
287 0.67
288 0.76
289 0.8
290 0.81
291 0.79
292 0.74
293 0.76
294 0.71
295 0.68
296 0.6
297 0.51
298 0.4
299 0.33
300 0.33
301 0.24
302 0.21
303 0.16
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.12
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.1
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.06
375 0.08
376 0.08
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.09
383 0.07
384 0.07
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.19
398 0.21
399 0.27
400 0.35
401 0.4
402 0.39
403 0.41
404 0.42
405 0.43
406 0.46
407 0.45
408 0.42
409 0.41
410 0.43
411 0.44
412 0.46
413 0.43
414 0.4
415 0.4
416 0.39
417 0.38
418 0.37
419 0.34
420 0.29
421 0.34
422 0.35
423 0.32
424 0.28
425 0.25
426 0.24
427 0.22
428 0.25
429 0.17
430 0.16
431 0.14
432 0.14
433 0.13
434 0.13
435 0.15
436 0.13
437 0.16
438 0.16
439 0.16
440 0.17
441 0.19
442 0.23
443 0.25
444 0.25
445 0.27
446 0.3
447 0.29
448 0.32
449 0.37
450 0.37
451 0.37
452 0.45
453 0.5
454 0.53
455 0.62
456 0.69
457 0.71
458 0.71
459 0.74
460 0.67
461 0.61
462 0.55
463 0.49
464 0.45
465 0.39
466 0.35
467 0.31
468 0.31
469 0.29
470 0.26
471 0.28
472 0.25
473 0.28
474 0.28
475 0.27
476 0.26
477 0.29
478 0.3
479 0.33
480 0.31
481 0.26
482 0.26
483 0.26
484 0.26
485 0.25
486 0.26
487 0.22
488 0.22
489 0.22
490 0.22
491 0.26
492 0.23
493 0.21
494 0.2
495 0.18
496 0.2
497 0.19
498 0.19
499 0.15
500 0.22
501 0.23
502 0.27
503 0.33
504 0.33
505 0.37
506 0.43
507 0.49
508 0.47
509 0.55
510 0.55
511 0.57
512 0.6
513 0.59
514 0.54
515 0.51
516 0.5
517 0.46
518 0.4
519 0.34
520 0.3
521 0.29
522 0.28
523 0.3
524 0.26
525 0.22
526 0.21
527 0.18
528 0.16
529 0.15
530 0.13
531 0.09
532 0.09
533 0.1
534 0.17
535 0.25
536 0.3
537 0.35
538 0.41
539 0.5
540 0.59
541 0.68
542 0.72
543 0.67
544 0.68
545 0.67
546 0.61
547 0.54
548 0.47
549 0.37
550 0.28
551 0.25
552 0.18
553 0.16
554 0.15
555 0.12
556 0.13
557 0.13
558 0.13
559 0.14
560 0.14
561 0.13
562 0.15
563 0.17
564 0.18
565 0.18
566 0.2
567 0.26
568 0.27
569 0.3
570 0.32
571 0.31
572 0.27
573 0.26
574 0.25
575 0.18
576 0.18
577 0.19
578 0.15
579 0.16
580 0.16
581 0.16
582 0.17
583 0.15
584 0.14
585 0.11
586 0.11
587 0.13
588 0.14
589 0.13
590 0.1
591 0.1
592 0.09
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.1
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.12
601 0.12
602 0.12
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.19
607 0.28
608 0.33
609 0.34
610 0.34
611 0.34
612 0.35
613 0.34
614 0.31
615 0.23
616 0.24
617 0.23
618 0.24
619 0.26
620 0.23
621 0.21
622 0.18
623 0.18
624 0.2
625 0.23
626 0.31
627 0.38
628 0.42
629 0.49
630 0.54
631 0.59
632 0.64
633 0.71
634 0.72
635 0.74
636 0.79
637 0.78
638 0.79
639 0.78
640 0.76
641 0.74
642 0.74
643 0.75
644 0.77
645 0.82
646 0.82
647 0.86
648 0.86
649 0.88
650 0.88
651 0.86
652 0.85
653 0.79
654 0.72
655 0.62
656 0.54
657 0.43
658 0.32
659 0.22
660 0.13
661 0.1
662 0.11
663 0.15
664 0.16
665 0.18
666 0.19
667 0.25
668 0.3
669 0.39
670 0.48
671 0.55
672 0.64
673 0.73
674 0.81
675 0.85
676 0.89
677 0.89
678 0.89
679 0.89
680 0.9
681 0.9
682 0.91
683 0.93
684 0.94
685 0.93
686 0.92
687 0.92
688 0.9
689 0.86
690 0.84
691 0.82
692 0.77
693 0.7
694 0.63
695 0.58
696 0.59
697 0.59
698 0.55
699 0.56
700 0.57
701 0.63
702 0.63
703 0.62
704 0.6
705 0.52
706 0.48
707 0.46
708 0.46
709 0.46
710 0.51
711 0.5
712 0.49
713 0.49
714 0.47
715 0.47
716 0.49
717 0.51
718 0.53
719 0.59
720 0.65
721 0.76