Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9XAK1

Protein Details
Accession S9XAK1    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-132SSPLPAVAPKKQKREKLPYRMIHAAHHydrophilic
695-725DSEENMSSSKKKRQRKKKKKEAKITTSLPVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-104KRPR
111-122PAVAPKKQKREK
704-717KKKRQRKKKKKEAK
783-786KKPK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR012588  Exosome-assoc_fac_Rrp6_N  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR045092  Rrp6-like  
Gene Ontology GO:1990342  C:heterochromatin island  
GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:1990251  C:nuclear exosome focus  
GO:0140602  C:nucleolar ring  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0071046  P:nuclear polyadenylation-dependent ncRNA catabolic process  
GO:0033621  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts  
GO:1902794  P:siRNA-independent facultative heterochromatin formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
PF00570  HRDC  
PF08066  PMC2NT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50967  HRDC  
CDD cd06147  Rrp6p_like_exo  
Amino Acid Sequences MDESKLFKSFMNTTAFCSELEKLDIPFYRSIDSEFSENLKNVSSRVLKNIQLLFSKVDRSRAADFVDIEDIENRWLEVSDTLDILFEKTDHCLDKAKGLLKRPRIESSPLPAVAPKKQKREKLPYRMIHAAHLPKPQLRFQSSPNNDRNLTWFWKLTEKPNALVPLDKLLAQVESDPSLANSLPHPYGTEIKNNRYPPWVYEVTNPTVMGSVDETRPIWVDTEEALKDMLKELQKSDAIAVDLEHHDYRSFRGYVCLMQISNRKYDWVVDTLQLREELQCLNTVFTDPKIIKVLHGANMDIIWLQRDFGLYIVNLFDTYCATKVLGFEGNGLAFLLQKYCDYEADKRYQMADWRIRPLPKDMLSYAQSDTHYLLYIWDHLRNDLLENSVKRKENLLQSVENSSKQIALRKYEVEPYDPVYGLGTDGWRNVLSKFGSAKIIGREAITIFKALHDWRDSTARKEDESVRYVMPNHLLITIAANKPMETLDLLSISKQLTPLVRVYADEIVQVIRDAQNAYNKQIDQEKSFGTDKEAAPLMTSIVSNVEDSDKTAPDVSIFESTKKNATILNKLMAKSSDLFTAKVTFPSTVDDRKEKLSSVTEKISLNVAPSVEHPITTVTEESNLENPTDESLSQAQAATKEEPSIEGRDSDENSIVVRQLGINKKKRLSSAMNTDMPSLDDTINLTDQALPANNDSEENMSSSKKKRQRKKKKKEAKITTSLPVANTEAQESATANEAFDYSNQDNFLLKMDERKRVMRNQSEKSFNPMNRATQVRRNVKELKKPKISEGKSTSFKKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.33
4 0.32
5 0.28
6 0.23
7 0.26
8 0.23
9 0.21
10 0.26
11 0.29
12 0.29
13 0.31
14 0.3
15 0.28
16 0.27
17 0.28
18 0.26
19 0.25
20 0.24
21 0.22
22 0.24
23 0.26
24 0.26
25 0.24
26 0.24
27 0.23
28 0.21
29 0.27
30 0.3
31 0.29
32 0.36
33 0.41
34 0.41
35 0.47
36 0.51
37 0.47
38 0.43
39 0.42
40 0.39
41 0.36
42 0.4
43 0.35
44 0.37
45 0.35
46 0.37
47 0.39
48 0.38
49 0.38
50 0.34
51 0.33
52 0.29
53 0.3
54 0.25
55 0.22
56 0.21
57 0.18
58 0.16
59 0.15
60 0.12
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.08
74 0.08
75 0.1
76 0.14
77 0.16
78 0.17
79 0.23
80 0.23
81 0.29
82 0.34
83 0.38
84 0.39
85 0.46
86 0.54
87 0.56
88 0.63
89 0.63
90 0.63
91 0.6
92 0.62
93 0.58
94 0.57
95 0.56
96 0.49
97 0.44
98 0.42
99 0.41
100 0.43
101 0.48
102 0.48
103 0.52
104 0.59
105 0.67
106 0.74
107 0.81
108 0.84
109 0.84
110 0.87
111 0.82
112 0.82
113 0.8
114 0.71
115 0.63
116 0.6
117 0.56
118 0.5
119 0.5
120 0.46
121 0.42
122 0.45
123 0.47
124 0.47
125 0.45
126 0.43
127 0.44
128 0.52
129 0.55
130 0.61
131 0.61
132 0.59
133 0.55
134 0.52
135 0.51
136 0.45
137 0.43
138 0.37
139 0.33
140 0.3
141 0.37
142 0.39
143 0.41
144 0.45
145 0.43
146 0.4
147 0.43
148 0.45
149 0.38
150 0.38
151 0.31
152 0.26
153 0.24
154 0.23
155 0.19
156 0.16
157 0.15
158 0.13
159 0.13
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.2
175 0.21
176 0.3
177 0.32
178 0.38
179 0.45
180 0.46
181 0.46
182 0.45
183 0.45
184 0.38
185 0.4
186 0.37
187 0.31
188 0.36
189 0.38
190 0.36
191 0.37
192 0.34
193 0.26
194 0.24
195 0.22
196 0.16
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.11
206 0.09
207 0.1
208 0.09
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.15
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.2
221 0.2
222 0.2
223 0.2
224 0.17
225 0.15
226 0.14
227 0.13
228 0.11
229 0.11
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.14
236 0.16
237 0.16
238 0.14
239 0.16
240 0.17
241 0.18
242 0.2
243 0.2
244 0.15
245 0.19
246 0.25
247 0.24
248 0.26
249 0.24
250 0.23
251 0.22
252 0.24
253 0.22
254 0.19
255 0.18
256 0.18
257 0.2
258 0.2
259 0.2
260 0.18
261 0.16
262 0.13
263 0.13
264 0.11
265 0.09
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.16
274 0.13
275 0.15
276 0.17
277 0.17
278 0.16
279 0.21
280 0.23
281 0.22
282 0.23
283 0.21
284 0.18
285 0.17
286 0.17
287 0.12
288 0.1
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.07
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.09
328 0.12
329 0.17
330 0.21
331 0.25
332 0.26
333 0.25
334 0.25
335 0.25
336 0.26
337 0.29
338 0.32
339 0.3
340 0.34
341 0.37
342 0.37
343 0.37
344 0.37
345 0.35
346 0.3
347 0.3
348 0.26
349 0.26
350 0.27
351 0.27
352 0.24
353 0.21
354 0.19
355 0.16
356 0.17
357 0.13
358 0.12
359 0.1
360 0.09
361 0.07
362 0.1
363 0.11
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.12
369 0.13
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.16
375 0.21
376 0.21
377 0.21
378 0.22
379 0.25
380 0.28
381 0.33
382 0.32
383 0.29
384 0.29
385 0.32
386 0.31
387 0.27
388 0.21
389 0.16
390 0.15
391 0.14
392 0.18
393 0.17
394 0.19
395 0.2
396 0.22
397 0.23
398 0.26
399 0.26
400 0.23
401 0.21
402 0.21
403 0.21
404 0.18
405 0.17
406 0.12
407 0.12
408 0.1
409 0.09
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.1
418 0.1
419 0.12
420 0.13
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.16
425 0.14
426 0.15
427 0.14
428 0.13
429 0.12
430 0.11
431 0.12
432 0.1
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.1
437 0.09
438 0.12
439 0.12
440 0.12
441 0.14
442 0.22
443 0.23
444 0.24
445 0.31
446 0.29
447 0.28
448 0.3
449 0.34
450 0.31
451 0.33
452 0.31
453 0.25
454 0.25
455 0.25
456 0.23
457 0.2
458 0.16
459 0.14
460 0.12
461 0.11
462 0.1
463 0.11
464 0.14
465 0.13
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.13
470 0.13
471 0.11
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.1
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.09
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.13
488 0.12
489 0.14
490 0.14
491 0.13
492 0.11
493 0.1
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.06
499 0.07
500 0.08
501 0.1
502 0.17
503 0.19
504 0.21
505 0.24
506 0.23
507 0.25
508 0.3
509 0.3
510 0.25
511 0.26
512 0.25
513 0.25
514 0.26
515 0.24
516 0.21
517 0.25
518 0.22
519 0.23
520 0.23
521 0.19
522 0.18
523 0.18
524 0.15
525 0.1
526 0.1
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.08
534 0.1
535 0.12
536 0.11
537 0.11
538 0.12
539 0.11
540 0.1
541 0.11
542 0.12
543 0.15
544 0.16
545 0.17
546 0.19
547 0.21
548 0.23
549 0.22
550 0.21
551 0.19
552 0.23
553 0.28
554 0.28
555 0.34
556 0.34
557 0.34
558 0.35
559 0.32
560 0.3
561 0.24
562 0.22
563 0.21
564 0.19
565 0.19
566 0.19
567 0.22
568 0.2
569 0.2
570 0.21
571 0.15
572 0.15
573 0.19
574 0.21
575 0.23
576 0.27
577 0.29
578 0.3
579 0.34
580 0.35
581 0.31
582 0.3
583 0.32
584 0.33
585 0.33
586 0.34
587 0.33
588 0.32
589 0.32
590 0.31
591 0.24
592 0.2
593 0.17
594 0.14
595 0.12
596 0.12
597 0.18
598 0.16
599 0.16
600 0.15
601 0.15
602 0.16
603 0.16
604 0.16
605 0.1
606 0.12
607 0.13
608 0.15
609 0.17
610 0.16
611 0.15
612 0.15
613 0.15
614 0.15
615 0.15
616 0.13
617 0.12
618 0.13
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.14
623 0.14
624 0.17
625 0.16
626 0.15
627 0.16
628 0.15
629 0.17
630 0.18
631 0.2
632 0.18
633 0.16
634 0.18
635 0.21
636 0.23
637 0.22
638 0.2
639 0.18
640 0.17
641 0.17
642 0.15
643 0.12
644 0.11
645 0.1
646 0.17
647 0.26
648 0.35
649 0.43
650 0.5
651 0.55
652 0.58
653 0.6
654 0.59
655 0.58
656 0.57
657 0.58
658 0.59
659 0.59
660 0.56
661 0.54
662 0.46
663 0.39
664 0.32
665 0.24
666 0.16
667 0.12
668 0.12
669 0.14
670 0.14
671 0.13
672 0.12
673 0.11
674 0.11
675 0.13
676 0.14
677 0.13
678 0.13
679 0.15
680 0.15
681 0.15
682 0.15
683 0.16
684 0.15
685 0.15
686 0.16
687 0.17
688 0.23
689 0.29
690 0.38
691 0.45
692 0.54
693 0.63
694 0.72
695 0.81
696 0.86
697 0.92
698 0.93
699 0.95
700 0.96
701 0.97
702 0.97
703 0.95
704 0.93
705 0.86
706 0.8
707 0.74
708 0.65
709 0.54
710 0.46
711 0.39
712 0.31
713 0.27
714 0.23
715 0.19
716 0.17
717 0.17
718 0.15
719 0.13
720 0.15
721 0.14
722 0.13
723 0.13
724 0.13
725 0.12
726 0.13
727 0.19
728 0.16
729 0.19
730 0.2
731 0.2
732 0.2
733 0.2
734 0.23
735 0.19
736 0.18
737 0.25
738 0.3
739 0.38
740 0.41
741 0.48
742 0.52
743 0.58
744 0.67
745 0.68
746 0.72
747 0.73
748 0.78
749 0.79
750 0.74
751 0.72
752 0.71
753 0.62
754 0.61
755 0.56
756 0.53
757 0.51
758 0.57
759 0.56
760 0.55
761 0.64
762 0.66
763 0.65
764 0.67
765 0.7
766 0.71
767 0.76
768 0.77
769 0.77
770 0.77
771 0.76
772 0.79
773 0.8
774 0.75
775 0.75
776 0.73
777 0.72
778 0.71