Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9XA28

Protein Details
Accession S9XA28    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-66EEKDVPLKRPRKKIAKFDEERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-60KRPRKKIA
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0031298  C:replication fork protection complex  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0000403  F:Y-form DNA binding  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0007534  P:gene conversion at mating-type locus  
GO:0071515  P:mating-type locus imprinting  
GO:0043388  P:positive regulation of DNA binding  
GO:0043111  P:replication fork arrest  
GO:0031297  P:replication fork processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MAASELSQLSQEKEDKKNSFEKDVLQKETTEKENGNENEGFDLGLEEKDVPLKRPRKKIAKFDEERLASENGIPKLQQLRKKVNLKGKGHELGDLKRILSMYHVWTHELYPRATFDDSIAYLNRLGSMRSVKVRRRGWINEISDESVVGQESLQDLSYDQPFMEPKRFPSNQDSYMENGEDASFVIPDAEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.48
4 0.55
5 0.54
6 0.55
7 0.51
8 0.52
9 0.53
10 0.56
11 0.57
12 0.5
13 0.47
14 0.44
15 0.46
16 0.42
17 0.36
18 0.3
19 0.26
20 0.35
21 0.34
22 0.35
23 0.31
24 0.28
25 0.25
26 0.24
27 0.22
28 0.12
29 0.13
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.06
34 0.06
35 0.12
36 0.13
37 0.15
38 0.24
39 0.33
40 0.4
41 0.5
42 0.59
43 0.65
44 0.72
45 0.79
46 0.81
47 0.83
48 0.79
49 0.75
50 0.74
51 0.64
52 0.57
53 0.5
54 0.4
55 0.29
56 0.27
57 0.26
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.23
63 0.28
64 0.32
65 0.33
66 0.41
67 0.49
68 0.57
69 0.61
70 0.61
71 0.66
72 0.63
73 0.61
74 0.59
75 0.54
76 0.47
77 0.44
78 0.38
79 0.3
80 0.3
81 0.26
82 0.2
83 0.17
84 0.17
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.16
94 0.18
95 0.19
96 0.17
97 0.14
98 0.14
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.13
115 0.15
116 0.22
117 0.29
118 0.33
119 0.42
120 0.46
121 0.49
122 0.53
123 0.55
124 0.54
125 0.56
126 0.54
127 0.49
128 0.48
129 0.44
130 0.36
131 0.31
132 0.25
133 0.17
134 0.13
135 0.09
136 0.07
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.09
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.14
149 0.18
150 0.23
151 0.23
152 0.26
153 0.36
154 0.38
155 0.4
156 0.46
157 0.5
158 0.5
159 0.51
160 0.48
161 0.41
162 0.43
163 0.39
164 0.3
165 0.23
166 0.18
167 0.15
168 0.14
169 0.11
170 0.07
171 0.06
172 0.07