Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9X295

Protein Details
Accession S9X295    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-240SENVEEQPKKKKRKGPKGPNPLSVRKKKKSASQSAPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-233PKKKKRKGPKGPNPLSVRKKKKS
255-263RRKHRRKRD
Subcellular Location(s) mito 16, mito_nucl 14.166, nucl 10, cyto_nucl 6.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRAKTYRKLMHTYQLVFGFREPYQVLVDADFISDLTKSKMDIRAAISRTVQGDIKPMVTQCCIRQLYSRSQEAKQEIQIAKSFERRRCGHIDEAKSPLECMQSCIDVNGRNKHRYVVATQNTELRDLLRSVPGVPLIYMKRSVVVLEPASRATILEKHAKESSQMGLSKEEKLILSGKRPHSGSEREETEETGKEDDNEASENVEEQPKKKKRKGPKGPNPLSVRKKKKSASQSAPSEGPLPVNIIGDVGQRRKHRRKRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.67
3 0.62
4 0.57
5 0.49
6 0.43
7 0.4
8 0.34
9 0.26
10 0.28
11 0.23
12 0.2
13 0.2
14 0.21
15 0.2
16 0.16
17 0.18
18 0.13
19 0.13
20 0.11
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.15
29 0.21
30 0.22
31 0.25
32 0.29
33 0.35
34 0.36
35 0.38
36 0.34
37 0.31
38 0.31
39 0.29
40 0.26
41 0.18
42 0.21
43 0.19
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.18
48 0.19
49 0.21
50 0.18
51 0.26
52 0.26
53 0.25
54 0.3
55 0.33
56 0.4
57 0.44
58 0.49
59 0.44
60 0.45
61 0.5
62 0.48
63 0.47
64 0.39
65 0.41
66 0.35
67 0.33
68 0.34
69 0.31
70 0.3
71 0.35
72 0.39
73 0.35
74 0.42
75 0.42
76 0.44
77 0.47
78 0.49
79 0.49
80 0.5
81 0.52
82 0.47
83 0.48
84 0.44
85 0.39
86 0.34
87 0.27
88 0.23
89 0.17
90 0.17
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.17
97 0.22
98 0.27
99 0.31
100 0.32
101 0.32
102 0.33
103 0.33
104 0.3
105 0.29
106 0.31
107 0.31
108 0.32
109 0.32
110 0.34
111 0.32
112 0.31
113 0.27
114 0.18
115 0.14
116 0.12
117 0.12
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.08
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.11
144 0.12
145 0.19
146 0.19
147 0.23
148 0.24
149 0.24
150 0.24
151 0.23
152 0.22
153 0.19
154 0.21
155 0.19
156 0.23
157 0.24
158 0.24
159 0.23
160 0.22
161 0.17
162 0.16
163 0.19
164 0.16
165 0.22
166 0.28
167 0.31
168 0.34
169 0.35
170 0.36
171 0.38
172 0.42
173 0.39
174 0.38
175 0.38
176 0.37
177 0.37
178 0.36
179 0.32
180 0.29
181 0.26
182 0.21
183 0.18
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.17
195 0.17
196 0.18
197 0.29
198 0.38
199 0.48
200 0.55
201 0.63
202 0.68
203 0.78
204 0.87
205 0.88
206 0.9
207 0.91
208 0.91
209 0.91
210 0.87
211 0.86
212 0.85
213 0.84
214 0.83
215 0.8
216 0.81
217 0.78
218 0.8
219 0.8
220 0.81
221 0.8
222 0.8
223 0.79
224 0.75
225 0.71
226 0.62
227 0.54
228 0.43
229 0.35
230 0.25
231 0.21
232 0.16
233 0.16
234 0.14
235 0.12
236 0.13
237 0.16
238 0.22
239 0.24
240 0.3
241 0.38
242 0.49
243 0.59