Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9VXD4

Protein Details
Accession S9VXD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-81DLGSAPSKKQEPKENKKRRNQPEKTKPVPVKNKDPKGQEPSKKKQKQERKGNETTGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-75SKKQEPKENKKRRNQPEKTKPVPVKNKDPKGQEPSKKKQKQERKG
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007823  RRP8  
IPR042036  RRP8_N  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0106142  F:rRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF05148  Methyltransf_8  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MTDRNSHDRQKIQLFYDIMFQVNWDLGSAPSKKQEPKENKKRRNQPEKTKPVPVKNKDPKGQEPSKKKQKQERKGNETTGDEKKQPSLVHEGEKKLANEGPLTALQKKMKGKLDGAKFRWINERLYTTESEEAVKLFQDSPDMFDVYHAGFRHQIESWPENPVDVFIRFLKERYDKKRRPVSVVDLGCGEAKIAETYEASKYIQVQSFDLVSANKFIVASDISDLPLEDASVDIAIFCLSLMGTNWQSFLREAHRVLKPNTGQLWVAEIKSRFSDKSGKIFAEELPKLGFENTSLVLGNKMFTLFEFVKQPLRQEPQTLPPILNACIYKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.45
3 0.46
4 0.39
5 0.31
6 0.26
7 0.23
8 0.17
9 0.16
10 0.15
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.15
15 0.17
16 0.19
17 0.24
18 0.3
19 0.36
20 0.42
21 0.52
22 0.58
23 0.67
24 0.75
25 0.81
26 0.85
27 0.89
28 0.93
29 0.94
30 0.94
31 0.93
32 0.93
33 0.93
34 0.94
35 0.89
36 0.89
37 0.86
38 0.85
39 0.85
40 0.81
41 0.81
42 0.81
43 0.84
44 0.81
45 0.8
46 0.78
47 0.76
48 0.79
49 0.77
50 0.77
51 0.78
52 0.83
53 0.83
54 0.83
55 0.85
56 0.86
57 0.87
58 0.88
59 0.88
60 0.87
61 0.87
62 0.83
63 0.77
64 0.71
65 0.66
66 0.62
67 0.55
68 0.49
69 0.42
70 0.39
71 0.38
72 0.34
73 0.31
74 0.31
75 0.3
76 0.35
77 0.38
78 0.39
79 0.38
80 0.41
81 0.38
82 0.32
83 0.31
84 0.24
85 0.2
86 0.18
87 0.17
88 0.16
89 0.19
90 0.18
91 0.21
92 0.22
93 0.27
94 0.3
95 0.34
96 0.37
97 0.38
98 0.42
99 0.44
100 0.52
101 0.55
102 0.55
103 0.57
104 0.51
105 0.5
106 0.53
107 0.48
108 0.41
109 0.35
110 0.35
111 0.28
112 0.31
113 0.3
114 0.24
115 0.24
116 0.22
117 0.19
118 0.16
119 0.14
120 0.12
121 0.11
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.09
126 0.09
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.1
134 0.12
135 0.1
136 0.09
137 0.12
138 0.12
139 0.14
140 0.13
141 0.15
142 0.17
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.2
147 0.18
148 0.17
149 0.16
150 0.13
151 0.1
152 0.1
153 0.08
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.15
158 0.21
159 0.28
160 0.37
161 0.47
162 0.5
163 0.59
164 0.68
165 0.66
166 0.65
167 0.62
168 0.6
169 0.57
170 0.53
171 0.44
172 0.35
173 0.33
174 0.27
175 0.22
176 0.15
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.14
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.11
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.15
237 0.16
238 0.2
239 0.22
240 0.28
241 0.33
242 0.38
243 0.39
244 0.45
245 0.42
246 0.44
247 0.44
248 0.38
249 0.34
250 0.28
251 0.32
252 0.25
253 0.24
254 0.22
255 0.21
256 0.2
257 0.23
258 0.26
259 0.21
260 0.23
261 0.32
262 0.31
263 0.39
264 0.42
265 0.39
266 0.38
267 0.39
268 0.39
269 0.39
270 0.35
271 0.28
272 0.24
273 0.24
274 0.23
275 0.22
276 0.19
277 0.1
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.12
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.16
291 0.15
292 0.18
293 0.21
294 0.23
295 0.31
296 0.32
297 0.36
298 0.37
299 0.44
300 0.43
301 0.45
302 0.48
303 0.48
304 0.54
305 0.53
306 0.44
307 0.41
308 0.42
309 0.37
310 0.37
311 0.31