Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9XK96

Protein Details
Accession S9XK96    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
399-429REEIASLKRREENRRRHSKKGAVPYEKEREKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
378-425VRRIARHRHVPSVVKKAGEIKREEIASLKRREENRRRHSKKGAVPYEK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 11.166, cyto_nucl 10.333, mito 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007287  Sof1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MKVKTITRGTSLTRLNDQNPVQRNLDPALHPFERAREYTRALNATKMDRMFAAPFLGQMGQGHQDGVYALARDTNSLIDCSSGSGDGVVKLWNAGEREERWSTKAHDGIVRGLVFSQNGDVLSCASDKYVNLYDKHDGSVKKSFIGDASLLDIDSCKKGHTFATSGANVSIWDINRDTPVSKFDWGVDTLPVVKFNYAEASVLASAGIDRSIVIYDLRTSSPLTKLVTNLRTNSISWNPIEPFNFIAGSEDHNIYMHDMRNLKRALHVYKDHVSAVTSVDFSPTGQEFVSGSYDKTIRIYNAREGHSRDVYHTKRMQRVTSVRFSMDSQYVFSGSDDSNVRLWRSKASSRASIRSTREENRLKYLDALRDRYKHIPEVRRIARHRHVPSVVKKAGEIKREEIASLKRREENRRRHSKKGAVPYEKEREKHVVALQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.52
6 0.54
7 0.54
8 0.5
9 0.46
10 0.47
11 0.42
12 0.42
13 0.36
14 0.33
15 0.36
16 0.33
17 0.34
18 0.32
19 0.34
20 0.34
21 0.35
22 0.36
23 0.33
24 0.37
25 0.41
26 0.46
27 0.46
28 0.42
29 0.44
30 0.43
31 0.42
32 0.44
33 0.38
34 0.33
35 0.28
36 0.3
37 0.26
38 0.23
39 0.22
40 0.16
41 0.15
42 0.16
43 0.15
44 0.13
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.13
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.09
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.16
83 0.17
84 0.24
85 0.28
86 0.29
87 0.28
88 0.3
89 0.33
90 0.35
91 0.36
92 0.32
93 0.31
94 0.31
95 0.32
96 0.33
97 0.29
98 0.22
99 0.2
100 0.18
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.12
116 0.18
117 0.2
118 0.22
119 0.25
120 0.28
121 0.28
122 0.29
123 0.3
124 0.25
125 0.26
126 0.32
127 0.29
128 0.27
129 0.26
130 0.25
131 0.21
132 0.22
133 0.18
134 0.11
135 0.12
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.11
147 0.14
148 0.15
149 0.17
150 0.23
151 0.23
152 0.23
153 0.22
154 0.2
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.11
178 0.12
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.02
196 0.02
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.15
213 0.2
214 0.26
215 0.26
216 0.26
217 0.26
218 0.26
219 0.26
220 0.28
221 0.24
222 0.2
223 0.18
224 0.2
225 0.18
226 0.19
227 0.2
228 0.17
229 0.16
230 0.14
231 0.14
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.12
244 0.13
245 0.17
246 0.18
247 0.24
248 0.25
249 0.24
250 0.25
251 0.3
252 0.29
253 0.32
254 0.34
255 0.33
256 0.35
257 0.37
258 0.33
259 0.28
260 0.25
261 0.2
262 0.18
263 0.13
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.1
276 0.13
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.14
285 0.18
286 0.21
287 0.26
288 0.32
289 0.35
290 0.37
291 0.4
292 0.43
293 0.42
294 0.39
295 0.36
296 0.39
297 0.39
298 0.43
299 0.46
300 0.47
301 0.5
302 0.54
303 0.52
304 0.51
305 0.57
306 0.55
307 0.56
308 0.52
309 0.46
310 0.43
311 0.42
312 0.37
313 0.32
314 0.26
315 0.2
316 0.18
317 0.18
318 0.17
319 0.16
320 0.14
321 0.11
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.18
326 0.19
327 0.21
328 0.23
329 0.24
330 0.26
331 0.31
332 0.35
333 0.39
334 0.43
335 0.51
336 0.52
337 0.58
338 0.56
339 0.58
340 0.58
341 0.57
342 0.59
343 0.55
344 0.6
345 0.61
346 0.6
347 0.6
348 0.58
349 0.51
350 0.51
351 0.5
352 0.49
353 0.48
354 0.51
355 0.49
356 0.51
357 0.55
358 0.56
359 0.54
360 0.54
361 0.56
362 0.59
363 0.6
364 0.67
365 0.7
366 0.72
367 0.73
368 0.74
369 0.73
370 0.74
371 0.71
372 0.69
373 0.68
374 0.68
375 0.72
376 0.72
377 0.67
378 0.58
379 0.54
380 0.55
381 0.55
382 0.53
383 0.49
384 0.42
385 0.44
386 0.44
387 0.43
388 0.39
389 0.42
390 0.44
391 0.46
392 0.48
393 0.5
394 0.57
395 0.68
396 0.72
397 0.74
398 0.77
399 0.81
400 0.83
401 0.85
402 0.88
403 0.87
404 0.85
405 0.85
406 0.85
407 0.83
408 0.83
409 0.83
410 0.83
411 0.8
412 0.72
413 0.66
414 0.63
415 0.56
416 0.56