Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DY84

Protein Details
Accession B0DY84    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-56ASIASGKSPKRSRKPKSSRGGSGPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-51GKSPKRSRKPKSSRG
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_313400  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPSKRGTCLYYSQGQLCPRGLACRFSHETRIASIASGKSPKRSRKPKSSRGGSGPLQEFFNSYHPFVYNSSSSASSEFYRLCDHFHWARDGPDREDAHDTFKDALVKQFNANFGTNADDLTAWQGLCALLDVDPIPDELARCRRIVERTHVNLVDLTDSFTSGKRVTRFKSEGDLSEYTIEHARYFPRKNVHAGNLLKHLLRHIHNPSLKRGWRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.42
3 0.38
4 0.35
5 0.3
6 0.33
7 0.31
8 0.32
9 0.31
10 0.35
11 0.4
12 0.4
13 0.45
14 0.42
15 0.42
16 0.37
17 0.38
18 0.3
19 0.25
20 0.26
21 0.21
22 0.21
23 0.26
24 0.26
25 0.32
26 0.41
27 0.5
28 0.57
29 0.66
30 0.72
31 0.76
32 0.86
33 0.87
34 0.9
35 0.89
36 0.85
37 0.81
38 0.79
39 0.7
40 0.67
41 0.59
42 0.5
43 0.42
44 0.34
45 0.29
46 0.24
47 0.26
48 0.21
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.2
53 0.2
54 0.21
55 0.16
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.12
63 0.14
64 0.13
65 0.12
66 0.15
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.2
71 0.21
72 0.23
73 0.25
74 0.23
75 0.26
76 0.31
77 0.32
78 0.29
79 0.33
80 0.32
81 0.3
82 0.33
83 0.3
84 0.27
85 0.25
86 0.24
87 0.18
88 0.18
89 0.18
90 0.15
91 0.18
92 0.15
93 0.16
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.18
98 0.18
99 0.15
100 0.13
101 0.15
102 0.13
103 0.12
104 0.1
105 0.08
106 0.07
107 0.09
108 0.09
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.04
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.09
126 0.15
127 0.17
128 0.17
129 0.19
130 0.22
131 0.27
132 0.31
133 0.35
134 0.39
135 0.42
136 0.47
137 0.46
138 0.43
139 0.39
140 0.34
141 0.28
142 0.18
143 0.16
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.13
149 0.12
150 0.17
151 0.2
152 0.26
153 0.29
154 0.38
155 0.4
156 0.4
157 0.46
158 0.44
159 0.42
160 0.42
161 0.39
162 0.32
163 0.31
164 0.29
165 0.23
166 0.23
167 0.21
168 0.15
169 0.16
170 0.21
171 0.26
172 0.31
173 0.35
174 0.4
175 0.44
176 0.49
177 0.55
178 0.54
179 0.55
180 0.55
181 0.53
182 0.51
183 0.5
184 0.44
185 0.38
186 0.36
187 0.33
188 0.33
189 0.36
190 0.36
191 0.44
192 0.49
193 0.51
194 0.56
195 0.6
196 0.64