Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9XJ78

Protein Details
Accession S9XJ78    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-46ETGILRQKSSKQQKGKENVDRNGYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 5, cyto 2, pero 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007955  Bystin  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05291  Bystin  
Amino Acid Sequences MPKAPKPRLQHAPLYKDIADSSETGILRQKSSKQQKGKENVDRNGYMDAKASKRILQLAREQQEELEQEESGENPKALTEEDGFPQMSHEKDTLENPAIEPKDEEDESERFEAASNASDSDEFEEDDEYEELDIDETDRKLFDKFFPENNDQEKNEAPQEQSTNLSDLILQKISEAEARSRGEHVPTAEEEEEETMPPLPPKVIEVYSKVGVLLSKYRSGKIPKAFKIIPSLSNWEEILYITRPDTWTPHACYEATRIFISNLKPIQAQHFLNVILLERVREDIQTNKKLNYHLYMALKKALYKPSAFFKGFLFPLVSENCTLREAAVIGSVLVKVSVPVLHSAAALLRLTEFDVNGASSVFIRILLDKKYALPYKVLDSLVFYFMRWKALDRPLAVLEHQSMLVFAQRYKFDITPEQKDALLEVVRVKGHYSIGPEIRRELVNSASRGEEIPQDMEEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.61
3 0.52
4 0.46
5 0.38
6 0.3
7 0.24
8 0.21
9 0.21
10 0.2
11 0.2
12 0.26
13 0.26
14 0.27
15 0.31
16 0.36
17 0.41
18 0.52
19 0.61
20 0.64
21 0.71
22 0.78
23 0.84
24 0.87
25 0.87
26 0.86
27 0.82
28 0.79
29 0.72
30 0.64
31 0.6
32 0.5
33 0.4
34 0.35
35 0.35
36 0.3
37 0.34
38 0.34
39 0.32
40 0.33
41 0.41
42 0.4
43 0.4
44 0.47
45 0.51
46 0.54
47 0.52
48 0.5
49 0.42
50 0.42
51 0.38
52 0.31
53 0.22
54 0.17
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.14
59 0.14
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.13
66 0.14
67 0.15
68 0.16
69 0.19
70 0.19
71 0.18
72 0.2
73 0.2
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.2
80 0.23
81 0.23
82 0.22
83 0.2
84 0.27
85 0.26
86 0.25
87 0.24
88 0.2
89 0.22
90 0.21
91 0.22
92 0.19
93 0.2
94 0.22
95 0.23
96 0.21
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.12
101 0.14
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.13
108 0.13
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.12
114 0.11
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.13
129 0.15
130 0.2
131 0.23
132 0.28
133 0.35
134 0.38
135 0.42
136 0.46
137 0.47
138 0.4
139 0.39
140 0.35
141 0.31
142 0.29
143 0.26
144 0.22
145 0.21
146 0.22
147 0.21
148 0.22
149 0.2
150 0.19
151 0.16
152 0.15
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.12
157 0.11
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.15
165 0.16
166 0.17
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.19
171 0.18
172 0.16
173 0.15
174 0.18
175 0.16
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.11
181 0.11
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.09
190 0.11
191 0.12
192 0.15
193 0.18
194 0.18
195 0.18
196 0.17
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.12
202 0.17
203 0.18
204 0.19
205 0.23
206 0.27
207 0.32
208 0.36
209 0.42
210 0.4
211 0.45
212 0.45
213 0.42
214 0.45
215 0.41
216 0.35
217 0.28
218 0.3
219 0.24
220 0.25
221 0.23
222 0.16
223 0.15
224 0.12
225 0.12
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.12
233 0.14
234 0.18
235 0.2
236 0.22
237 0.22
238 0.22
239 0.22
240 0.24
241 0.22
242 0.19
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.18
247 0.19
248 0.19
249 0.18
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.22
254 0.24
255 0.23
256 0.19
257 0.2
258 0.19
259 0.19
260 0.18
261 0.14
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.06
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.16
271 0.25
272 0.33
273 0.34
274 0.35
275 0.37
276 0.38
277 0.4
278 0.35
279 0.3
280 0.27
281 0.31
282 0.31
283 0.3
284 0.31
285 0.29
286 0.28
287 0.3
288 0.3
289 0.26
290 0.26
291 0.27
292 0.3
293 0.37
294 0.36
295 0.32
296 0.28
297 0.3
298 0.29
299 0.28
300 0.22
301 0.15
302 0.18
303 0.18
304 0.18
305 0.14
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.07
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.09
352 0.12
353 0.14
354 0.16
355 0.16
356 0.18
357 0.26
358 0.3
359 0.29
360 0.29
361 0.28
362 0.31
363 0.35
364 0.33
365 0.26
366 0.25
367 0.26
368 0.26
369 0.24
370 0.2
371 0.21
372 0.21
373 0.25
374 0.21
375 0.22
376 0.27
377 0.34
378 0.4
379 0.35
380 0.38
381 0.37
382 0.38
383 0.35
384 0.3
385 0.25
386 0.2
387 0.19
388 0.15
389 0.13
390 0.11
391 0.15
392 0.14
393 0.14
394 0.17
395 0.18
396 0.21
397 0.25
398 0.26
399 0.26
400 0.35
401 0.41
402 0.43
403 0.47
404 0.46
405 0.42
406 0.41
407 0.37
408 0.32
409 0.26
410 0.19
411 0.18
412 0.2
413 0.2
414 0.2
415 0.21
416 0.18
417 0.19
418 0.2
419 0.23
420 0.27
421 0.34
422 0.38
423 0.38
424 0.39
425 0.4
426 0.39
427 0.36
428 0.31
429 0.32
430 0.34
431 0.34
432 0.33
433 0.31
434 0.31
435 0.3
436 0.29
437 0.25
438 0.22
439 0.22