Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9VZ82

Protein Details
Accession S9VZ82    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-217DAHHSSHSSRTRRHRHSDRHRHTHRRHRDKSPRENBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-216HSSRTRRHRHSDRHRHTHRRHRDKSPRE
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNSIRQIERLNELEMDKPLSSSWHMDYKDSAYIYIGNLDYDLNEEDIITVFSEFGEPTDINLVRDKETKKSKGYCFLKYADQRSTILAVDNMTNVKLLDRLVRVDHVASYRVPKKGSEDGAAPSEIGSQNLDALYPPSLPRTELESAERSPAPDEHAEPLDEKDMLDPMHEYIKNEKRRKVDDAHHSSHSSRTRRHRHSDRHRHTHRRHRDKSPREN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.22
4 0.2
5 0.18
6 0.18
7 0.19
8 0.19
9 0.21
10 0.25
11 0.26
12 0.27
13 0.29
14 0.3
15 0.32
16 0.29
17 0.25
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.19
22 0.16
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.14
46 0.15
47 0.15
48 0.2
49 0.21
50 0.2
51 0.26
52 0.27
53 0.29
54 0.38
55 0.42
56 0.45
57 0.51
58 0.53
59 0.58
60 0.61
61 0.58
62 0.53
63 0.5
64 0.52
65 0.5
66 0.5
67 0.42
68 0.39
69 0.35
70 0.32
71 0.31
72 0.23
73 0.18
74 0.14
75 0.11
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.14
97 0.17
98 0.19
99 0.19
100 0.19
101 0.22
102 0.26
103 0.28
104 0.24
105 0.22
106 0.22
107 0.23
108 0.22
109 0.17
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.09
114 0.08
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.15
129 0.17
130 0.18
131 0.21
132 0.22
133 0.23
134 0.25
135 0.25
136 0.2
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.18
142 0.18
143 0.19
144 0.19
145 0.18
146 0.19
147 0.17
148 0.15
149 0.13
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.16
157 0.17
158 0.18
159 0.26
160 0.35
161 0.45
162 0.51
163 0.56
164 0.57
165 0.61
166 0.66
167 0.64
168 0.65
169 0.65
170 0.68
171 0.67
172 0.63
173 0.61
174 0.56
175 0.55
176 0.55
177 0.51
178 0.5
179 0.56
180 0.63
181 0.69
182 0.79
183 0.81
184 0.84
185 0.89
186 0.92
187 0.92
188 0.92
189 0.94
190 0.94
191 0.94
192 0.94
193 0.94
194 0.93
195 0.91
196 0.92
197 0.92