Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9W4X3

Protein Details
Accession S9W4X3    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-144LYNRIKRLCQEKTKRFTPFSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 7.5, cyto_nucl 6.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041505  Dis3_CSD2  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
IPR001900  RNase_II/R  
IPR022966  RNase_II/R_CS  
IPR033771  Rrp44_CSD1  
IPR033770  RRP44_S1  
IPR003029  S1_domain  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:1990251  C:nuclear exosome focus  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0031267  F:small GTPase binding  
GO:0071031  P:nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing  
GO:0033621  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts  
GO:0030847  P:termination of RNA polymerase II transcription, exosome-dependent  
Pfam View protein in Pfam  
PF17849  OB_Dis3  
PF13638  PIN_4  
PF00773  RNB  
PF17216  Rrp44_CSD1  
PF17215  Rrp44_S1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01175  RIBONUCLEASE_II  
PS50126  S1  
CDD cd09862  PIN_Rrp44-like  
Amino Acid Sequences MSAIGYKRPSSSATKDQKPKVFVRAARGKVQKIVRERYLRDDIPCQSKSCPLCLSKLPTDSNGNALEPILSEEPFFLEKFGRHYLIPDTNVFYHCMDALEHPSNFFDVIVLQTVLSEIASKSIPLYNRIKRLCQEKTKRFTPFSNEFFSETYIDKLEGESPNDRNDRAIRAAASWFTGHLAGLGLKVVLITNDRRNAEIAAEQGIQTSTLKDYVQYLPDFEVLLDMISAVADATAANEKAAAETKAIYDPHWSTSRMLTCIKNGEVHKGVLNVSTYNFLEGSINVPGFNKPILISGREYLNRAVQGDVVCVQILPQSQWKSEAGEIASDDEDVLVNASAEPDASRSIDLETPTSKKAHPTGKIVGILKRNWRPYVGHVDNTTVAQSKGGSQQTVLLTPMDRRIPKIRFRTRQAPRLLGQRIVAAIDTWEATSRYPEGHFVRALGEMETKEAETEALLLEYDVQHRPFPKAVLDCLPQEGHNYKVPEDKSDPLWKNRKDLRDLLICSIDPPGCQDIDDALHARVLPNGNFEVGVHIADVTHFVKPKTAMDNEAASRGTTVYLVDKRIDMLPMLLGTDLCSLRPYVERFAFSCLWEMDENADVVNVSFTKSVIASKDAFSYADAQARIDDEKMQDPLTQSMRILLKLSKKIKQKRMDEGALNLASPEVRIQTDSETSDPMDVEIKQLLETNSLVEEFMLLANISVAQKIYDTFPQTAVLRRHAAPPLSNFDSLQDILQVCKGMHLKCDTSKALAKSLDECVDPKEPYFNTLLRILTTRCMLSAEYFCSGTIAAPDFRHYGLATSIYTHFTSPIRRYADVLAHRQLAAAIDYEVLHPSISDKQRLIEISNGINYRHRMAQMAGRASVEYYVGQALKGGIAEEDAYVIKVFKNGFVVFIAKFGLEGIVYTKSMTNMLEPNVEFLEDKYMLKVEIRDPPKPKIVEVQMFQKVRVRVGTVRDEHSGKQKVDIRLVH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.68
3 0.74
4 0.77
5 0.77
6 0.74
7 0.72
8 0.72
9 0.66
10 0.67
11 0.68
12 0.66
13 0.69
14 0.71
15 0.65
16 0.64
17 0.66
18 0.64
19 0.63
20 0.66
21 0.66
22 0.68
23 0.68
24 0.68
25 0.7
26 0.65
27 0.61
28 0.59
29 0.57
30 0.56
31 0.56
32 0.5
33 0.43
34 0.47
35 0.45
36 0.43
37 0.43
38 0.38
39 0.4
40 0.45
41 0.51
42 0.5
43 0.54
44 0.52
45 0.49
46 0.52
47 0.48
48 0.46
49 0.4
50 0.34
51 0.28
52 0.25
53 0.21
54 0.15
55 0.18
56 0.15
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.14
61 0.16
62 0.15
63 0.12
64 0.13
65 0.15
66 0.2
67 0.25
68 0.24
69 0.23
70 0.26
71 0.31
72 0.35
73 0.37
74 0.34
75 0.33
76 0.34
77 0.35
78 0.35
79 0.28
80 0.23
81 0.2
82 0.19
83 0.15
84 0.15
85 0.21
86 0.24
87 0.24
88 0.24
89 0.24
90 0.24
91 0.23
92 0.2
93 0.13
94 0.08
95 0.09
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.1
109 0.14
110 0.15
111 0.21
112 0.3
113 0.36
114 0.45
115 0.49
116 0.53
117 0.54
118 0.62
119 0.65
120 0.67
121 0.71
122 0.72
123 0.76
124 0.79
125 0.8
126 0.76
127 0.71
128 0.69
129 0.67
130 0.62
131 0.6
132 0.54
133 0.49
134 0.45
135 0.42
136 0.35
137 0.27
138 0.24
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.15
143 0.18
144 0.18
145 0.21
146 0.24
147 0.25
148 0.32
149 0.35
150 0.34
151 0.32
152 0.33
153 0.34
154 0.32
155 0.32
156 0.26
157 0.25
158 0.27
159 0.24
160 0.23
161 0.18
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.08
177 0.13
178 0.19
179 0.25
180 0.26
181 0.27
182 0.28
183 0.28
184 0.26
185 0.24
186 0.19
187 0.16
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.14
200 0.16
201 0.2
202 0.19
203 0.19
204 0.19
205 0.2
206 0.19
207 0.15
208 0.13
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.04
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.17
236 0.18
237 0.22
238 0.24
239 0.24
240 0.22
241 0.28
242 0.3
243 0.29
244 0.31
245 0.28
246 0.28
247 0.31
248 0.31
249 0.31
250 0.29
251 0.32
252 0.3
253 0.3
254 0.28
255 0.25
256 0.24
257 0.2
258 0.2
259 0.14
260 0.13
261 0.15
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.08
278 0.12
279 0.14
280 0.15
281 0.17
282 0.17
283 0.22
284 0.23
285 0.24
286 0.21
287 0.23
288 0.22
289 0.2
290 0.19
291 0.16
292 0.15
293 0.15
294 0.14
295 0.12
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.14
303 0.16
304 0.17
305 0.19
306 0.2
307 0.2
308 0.2
309 0.21
310 0.16
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.1
316 0.1
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.09
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.14
338 0.16
339 0.18
340 0.19
341 0.18
342 0.2
343 0.26
344 0.31
345 0.33
346 0.36
347 0.38
348 0.4
349 0.44
350 0.43
351 0.41
352 0.38
353 0.38
354 0.4
355 0.42
356 0.42
357 0.39
358 0.38
359 0.36
360 0.36
361 0.43
362 0.38
363 0.35
364 0.32
365 0.33
366 0.31
367 0.3
368 0.25
369 0.16
370 0.12
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.15
375 0.15
376 0.15
377 0.14
378 0.18
379 0.18
380 0.19
381 0.17
382 0.12
383 0.11
384 0.12
385 0.16
386 0.16
387 0.16
388 0.19
389 0.26
390 0.31
391 0.39
392 0.48
393 0.55
394 0.58
395 0.64
396 0.71
397 0.71
398 0.74
399 0.7
400 0.64
401 0.57
402 0.57
403 0.53
404 0.44
405 0.37
406 0.29
407 0.25
408 0.2
409 0.17
410 0.09
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.13
423 0.15
424 0.17
425 0.17
426 0.16
427 0.17
428 0.16
429 0.16
430 0.12
431 0.11
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.04
446 0.04
447 0.06
448 0.08
449 0.08
450 0.1
451 0.11
452 0.13
453 0.13
454 0.14
455 0.16
456 0.15
457 0.17
458 0.19
459 0.2
460 0.18
461 0.19
462 0.19
463 0.15
464 0.17
465 0.16
466 0.15
467 0.17
468 0.17
469 0.16
470 0.21
471 0.21
472 0.22
473 0.23
474 0.22
475 0.23
476 0.31
477 0.33
478 0.36
479 0.45
480 0.43
481 0.48
482 0.52
483 0.53
484 0.48
485 0.49
486 0.46
487 0.44
488 0.43
489 0.37
490 0.33
491 0.28
492 0.24
493 0.22
494 0.18
495 0.11
496 0.11
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.09
510 0.1
511 0.09
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.1
517 0.09
518 0.08
519 0.08
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.08
525 0.07
526 0.08
527 0.09
528 0.09
529 0.11
530 0.13
531 0.15
532 0.18
533 0.18
534 0.18
535 0.19
536 0.22
537 0.21
538 0.22
539 0.19
540 0.15
541 0.14
542 0.12
543 0.1
544 0.07
545 0.07
546 0.1
547 0.11
548 0.13
549 0.13
550 0.13
551 0.14
552 0.14
553 0.14
554 0.1
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.06
560 0.05
561 0.05
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.08
566 0.08
567 0.09
568 0.12
569 0.14
570 0.16
571 0.18
572 0.2
573 0.2
574 0.25
575 0.25
576 0.22
577 0.22
578 0.17
579 0.17
580 0.16
581 0.15
582 0.11
583 0.11
584 0.1
585 0.08
586 0.08
587 0.05
588 0.05
589 0.06
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.08
597 0.08
598 0.11
599 0.12
600 0.12
601 0.14
602 0.14
603 0.13
604 0.13
605 0.15
606 0.14
607 0.16
608 0.15
609 0.14
610 0.14
611 0.15
612 0.15
613 0.12
614 0.13
615 0.11
616 0.13
617 0.14
618 0.14
619 0.15
620 0.15
621 0.19
622 0.19
623 0.18
624 0.16
625 0.2
626 0.2
627 0.19
628 0.2
629 0.19
630 0.24
631 0.31
632 0.36
633 0.38
634 0.47
635 0.56
636 0.64
637 0.69
638 0.7
639 0.71
640 0.74
641 0.72
642 0.65
643 0.57
644 0.54
645 0.44
646 0.37
647 0.27
648 0.19
649 0.14
650 0.12
651 0.1
652 0.06
653 0.06
654 0.07
655 0.08
656 0.1
657 0.13
658 0.14
659 0.14
660 0.14
661 0.14
662 0.14
663 0.13
664 0.12
665 0.11
666 0.1
667 0.1
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.12
672 0.12
673 0.12
674 0.12
675 0.11
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.07
680 0.07
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.06
693 0.07
694 0.09
695 0.12
696 0.15
697 0.16
698 0.17
699 0.2
700 0.2
701 0.26
702 0.27
703 0.28
704 0.28
705 0.28
706 0.32
707 0.33
708 0.34
709 0.31
710 0.31
711 0.34
712 0.34
713 0.34
714 0.3
715 0.27
716 0.28
717 0.25
718 0.21
719 0.16
720 0.13
721 0.13
722 0.14
723 0.14
724 0.1
725 0.15
726 0.19
727 0.17
728 0.21
729 0.24
730 0.26
731 0.29
732 0.35
733 0.31
734 0.32
735 0.37
736 0.34
737 0.36
738 0.34
739 0.32
740 0.29
741 0.31
742 0.29
743 0.24
744 0.23
745 0.22
746 0.25
747 0.24
748 0.21
749 0.24
750 0.22
751 0.24
752 0.27
753 0.24
754 0.22
755 0.25
756 0.25
757 0.2
758 0.23
759 0.21
760 0.2
761 0.21
762 0.18
763 0.15
764 0.16
765 0.15
766 0.16
767 0.18
768 0.18
769 0.18
770 0.18
771 0.17
772 0.17
773 0.16
774 0.13
775 0.12
776 0.12
777 0.13
778 0.13
779 0.16
780 0.17
781 0.17
782 0.18
783 0.16
784 0.15
785 0.14
786 0.15
787 0.13
788 0.14
789 0.16
790 0.17
791 0.17
792 0.16
793 0.17
794 0.17
795 0.24
796 0.25
797 0.31
798 0.33
799 0.33
800 0.35
801 0.37
802 0.43
803 0.42
804 0.45
805 0.41
806 0.38
807 0.38
808 0.35
809 0.32
810 0.24
811 0.19
812 0.13
813 0.1
814 0.09
815 0.09
816 0.1
817 0.1
818 0.09
819 0.08
820 0.07
821 0.1
822 0.17
823 0.21
824 0.25
825 0.25
826 0.26
827 0.31
828 0.32
829 0.32
830 0.28
831 0.28
832 0.26
833 0.31
834 0.31
835 0.28
836 0.31
837 0.31
838 0.3
839 0.3
840 0.28
841 0.25
842 0.26
843 0.31
844 0.34
845 0.35
846 0.33
847 0.3
848 0.29
849 0.27
850 0.25
851 0.19
852 0.12
853 0.1
854 0.11
855 0.11
856 0.11
857 0.11
858 0.11
859 0.1
860 0.1
861 0.09
862 0.06
863 0.07
864 0.08
865 0.07
866 0.08
867 0.07
868 0.08
869 0.08
870 0.09
871 0.08
872 0.11
873 0.12
874 0.12
875 0.18
876 0.17
877 0.18
878 0.19
879 0.22
880 0.18
881 0.19
882 0.18
883 0.12
884 0.12
885 0.11
886 0.1
887 0.07
888 0.07
889 0.08
890 0.1
891 0.11
892 0.12
893 0.13
894 0.13
895 0.15
896 0.15
897 0.16
898 0.18
899 0.2
900 0.24
901 0.23
902 0.25
903 0.24
904 0.24
905 0.21
906 0.18
907 0.22
908 0.19
909 0.19
910 0.18
911 0.18
912 0.18
913 0.2
914 0.23
915 0.22
916 0.3
917 0.35
918 0.41
919 0.46
920 0.51
921 0.57
922 0.55
923 0.53
924 0.53
925 0.56
926 0.56
927 0.55
928 0.58
929 0.58
930 0.58
931 0.57
932 0.54
933 0.47
934 0.42
935 0.41
936 0.37
937 0.33
938 0.39
939 0.47
940 0.45
941 0.47
942 0.49
943 0.49
944 0.48
945 0.52
946 0.53
947 0.44
948 0.48
949 0.52
950 0.52