Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9VTS2

Protein Details
Accession S9VTS2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-39DVNDSSSYYHRKRKHYHHFREHDGPIKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
IPR044449  Rnt1/Pac1_DSRM_fungi  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
GO:0000182  F:rDNA binding  
GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0035613  F:RNA stem-loop binding  
GO:0106410  P:box C/D RNA 5'-end processing  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0030847  P:termination of RNA polymerase II transcription, exosome-dependent  
GO:0034474  P:U2 snRNA 3'-end processing  
GO:0034475  P:U4 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00035  dsrm  
PF00636  Ribonuclease_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
PS00517  RNASE_3_1  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd19876  DSRM_RNT1p-like  
cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MAKRHRAADSGSDVNDSSSYYHRKRKHYHHFREHDGPIKNVCILERKTQKLTACIKHLLEETKRSTKDDITAVLPGYVYGRLEGIYETLANRNEEFQSQSSQLPNSPTINVDQALPVSENNTANQEKEDGEYPPQLPDLRSDKLRRQVFTHISRAYELYPNQSNPSELLDIHNERLEFLGDSFFNMFTTRLIFKSFPQMDEGNLSKLRAKFVGNECADQFARLYGFDKRLVLSYSAEKDQLRKSQKVIADTFEAYVGALILDDQEEAAFNWVGNLLKPKIKNTIVQGPIDKLAKSKLFHKYSTQGHIEYRWVDGAGGSSEGYIIACIFNGKEVARAWGANQKDAGSRAAMEALKVLAKEKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.28
3 0.21
4 0.17
5 0.19
6 0.27
7 0.33
8 0.42
9 0.49
10 0.59
11 0.68
12 0.76
13 0.81
14 0.84
15 0.88
16 0.9
17 0.9
18 0.88
19 0.87
20 0.82
21 0.79
22 0.71
23 0.63
24 0.55
25 0.49
26 0.43
27 0.35
28 0.31
29 0.31
30 0.3
31 0.36
32 0.42
33 0.45
34 0.48
35 0.53
36 0.53
37 0.54
38 0.6
39 0.57
40 0.54
41 0.54
42 0.5
43 0.48
44 0.49
45 0.47
46 0.43
47 0.43
48 0.44
49 0.47
50 0.48
51 0.47
52 0.47
53 0.42
54 0.42
55 0.38
56 0.34
57 0.27
58 0.27
59 0.25
60 0.22
61 0.19
62 0.15
63 0.13
64 0.11
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.12
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.18
82 0.2
83 0.18
84 0.19
85 0.2
86 0.22
87 0.22
88 0.22
89 0.22
90 0.22
91 0.24
92 0.21
93 0.2
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.15
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.09
104 0.08
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.14
114 0.15
115 0.16
116 0.12
117 0.14
118 0.17
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.16
123 0.15
124 0.19
125 0.21
126 0.21
127 0.26
128 0.3
129 0.34
130 0.42
131 0.46
132 0.42
133 0.41
134 0.46
135 0.48
136 0.49
137 0.51
138 0.43
139 0.39
140 0.39
141 0.37
142 0.3
143 0.26
144 0.21
145 0.19
146 0.2
147 0.2
148 0.21
149 0.21
150 0.19
151 0.16
152 0.18
153 0.14
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.22
182 0.23
183 0.21
184 0.23
185 0.23
186 0.21
187 0.24
188 0.24
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.18
193 0.18
194 0.19
195 0.17
196 0.17
197 0.2
198 0.24
199 0.33
200 0.3
201 0.3
202 0.29
203 0.31
204 0.3
205 0.24
206 0.2
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.11
211 0.11
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.15
216 0.16
217 0.17
218 0.17
219 0.15
220 0.17
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.2
225 0.23
226 0.27
227 0.33
228 0.35
229 0.34
230 0.36
231 0.39
232 0.42
233 0.44
234 0.4
235 0.34
236 0.32
237 0.3
238 0.28
239 0.22
240 0.18
241 0.13
242 0.11
243 0.08
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.14
262 0.15
263 0.2
264 0.22
265 0.24
266 0.31
267 0.33
268 0.37
269 0.38
270 0.45
271 0.44
272 0.46
273 0.45
274 0.39
275 0.41
276 0.38
277 0.32
278 0.24
279 0.26
280 0.27
281 0.27
282 0.32
283 0.38
284 0.41
285 0.44
286 0.48
287 0.51
288 0.52
289 0.58
290 0.54
291 0.47
292 0.45
293 0.44
294 0.42
295 0.35
296 0.31
297 0.25
298 0.2
299 0.18
300 0.15
301 0.15
302 0.12
303 0.11
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.1
317 0.1
318 0.13
319 0.14
320 0.18
321 0.19
322 0.19
323 0.2
324 0.25
325 0.27
326 0.26
327 0.27
328 0.25
329 0.26
330 0.28
331 0.28
332 0.22
333 0.21
334 0.19
335 0.23
336 0.21
337 0.18
338 0.17
339 0.17
340 0.17
341 0.17