Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9XHK1

Protein Details
Accession S9XHK1    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-62VSKPVPPSKKLMRKLRKAGKIDKEGNWHydrophilic
67-87LEEAKKKEEKRLKKIETKYGSBasic
305-328VARTDDHSEKRRKNFDPRDIRPGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-61PPSKKLMRKLRKAGKIDKEGN
68-80EEAKKKEEKRLKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034226  Nop13/Rnp24_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12397  RRM2_Nop13p_fungi  
Amino Acid Sequences MMSASEEDIEKREVKEESKEGSKKSSKDEEEIEIDVSKPVPPSKKLMRKLRKAGKIDKEGNWTPQALEEAKKKEEKRLKKIETKYGSGEETQESKRSPWGIWIGNLSFFTTPAILKEFLVREAKESVEQNDEISFDFTPEHITRIHMPMSKEHRNQNKGFAYIDFDSEEALKVALLCTEKPLNGRNVLIKSSNDYQGRPSKSASMPSKTIARQESKNPPSAVIFVGNLPFDATEDLLREHFGQAGNIRRVRLMTFEDSGKCKGFGFVDFHDVETSMKAMTMGHESWRLEYGEDRSKRGRKASASVARTDDHSEKRRKNFDPRDIRPGASLANAARGSIGIKEPTGTKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.33
3 0.36
4 0.39
5 0.46
6 0.5
7 0.48
8 0.55
9 0.59
10 0.55
11 0.57
12 0.61
13 0.55
14 0.56
15 0.57
16 0.53
17 0.49
18 0.47
19 0.4
20 0.31
21 0.27
22 0.23
23 0.2
24 0.16
25 0.15
26 0.19
27 0.24
28 0.26
29 0.33
30 0.43
31 0.53
32 0.61
33 0.69
34 0.74
35 0.79
36 0.87
37 0.89
38 0.88
39 0.86
40 0.86
41 0.85
42 0.84
43 0.8
44 0.75
45 0.73
46 0.66
47 0.63
48 0.56
49 0.46
50 0.37
51 0.32
52 0.3
53 0.24
54 0.26
55 0.28
56 0.3
57 0.34
58 0.41
59 0.41
60 0.48
61 0.55
62 0.61
63 0.64
64 0.7
65 0.74
66 0.77
67 0.83
68 0.83
69 0.79
70 0.72
71 0.66
72 0.58
73 0.51
74 0.42
75 0.37
76 0.29
77 0.28
78 0.26
79 0.25
80 0.23
81 0.22
82 0.24
83 0.24
84 0.22
85 0.23
86 0.27
87 0.26
88 0.26
89 0.29
90 0.26
91 0.26
92 0.26
93 0.22
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.14
104 0.14
105 0.17
106 0.21
107 0.2
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.2
112 0.2
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.17
117 0.16
118 0.16
119 0.13
120 0.13
121 0.11
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.11
129 0.13
130 0.15
131 0.17
132 0.21
133 0.19
134 0.2
135 0.26
136 0.33
137 0.4
138 0.42
139 0.47
140 0.53
141 0.56
142 0.56
143 0.57
144 0.52
145 0.45
146 0.41
147 0.34
148 0.3
149 0.24
150 0.23
151 0.15
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.14
169 0.15
170 0.16
171 0.17
172 0.19
173 0.2
174 0.21
175 0.21
176 0.18
177 0.2
178 0.21
179 0.26
180 0.23
181 0.22
182 0.26
183 0.31
184 0.34
185 0.32
186 0.3
187 0.29
188 0.29
189 0.37
190 0.37
191 0.33
192 0.32
193 0.32
194 0.36
195 0.32
196 0.36
197 0.32
198 0.32
199 0.31
200 0.37
201 0.46
202 0.44
203 0.49
204 0.45
205 0.41
206 0.38
207 0.36
208 0.29
209 0.2
210 0.17
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.11
228 0.1
229 0.11
230 0.14
231 0.22
232 0.27
233 0.28
234 0.29
235 0.27
236 0.28
237 0.27
238 0.26
239 0.23
240 0.2
241 0.21
242 0.24
243 0.26
244 0.28
245 0.3
246 0.28
247 0.24
248 0.2
249 0.2
250 0.18
251 0.18
252 0.2
253 0.19
254 0.24
255 0.24
256 0.24
257 0.23
258 0.22
259 0.19
260 0.15
261 0.14
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.08
267 0.12
268 0.12
269 0.14
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.23
274 0.22
275 0.18
276 0.21
277 0.24
278 0.29
279 0.31
280 0.34
281 0.41
282 0.47
283 0.51
284 0.55
285 0.56
286 0.51
287 0.56
288 0.62
289 0.62
290 0.59
291 0.58
292 0.54
293 0.48
294 0.45
295 0.44
296 0.4
297 0.4
298 0.46
299 0.52
300 0.57
301 0.66
302 0.73
303 0.75
304 0.79
305 0.81
306 0.82
307 0.84
308 0.82
309 0.82
310 0.76
311 0.7
312 0.6
313 0.52
314 0.42
315 0.33
316 0.3
317 0.2
318 0.24
319 0.23
320 0.21
321 0.19
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.19
326 0.14
327 0.14
328 0.16
329 0.18
330 0.21
331 0.25