Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9XG43

Protein Details
Accession S9XG43    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-40AANADKKPSHREKKESSSPMPREHydrophilic
59-85RERTVAKKADQPRRPRRQPQGNEAFIRHydrophilic
100-123DSSSAPTTRRPRRGRENDRRSQTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-75RERTVAKKADQPRRPRR
212-229KKGGASKKNTAKESKPKK
244-259RGGGAARGGRGGPRRG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0051880  F:G-quadruplex DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLFDLLGEETPAANADKKPSHREKKESSSPMPRELVAPTTSSKKRDSNQPTPRERTVAKKADQPRRPRRQPQGNEAFIREGKDARSNNLSHPVDSSSAPTTRRPRRGRENDRRSQTGVVDTTKQVNRGWGDAIQSEQTADVAEDEGNTPSGANTPVPNEEDSVKTLDEFLASRKSTAKPVGRKVETIDNAKPILKGEPEDIFASVKKGGASKKNTAKESKPKKVVLDIEQTFTTRPSRGGGAARGGRGGPRRGNNAPRNQTSAQAQAPPTLSEADFPALA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.13
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.13
8 0.19
9 0.26
10 0.32
11 0.41
12 0.51
13 0.6
14 0.66
15 0.74
16 0.76
17 0.79
18 0.84
19 0.83
20 0.8
21 0.8
22 0.76
23 0.73
24 0.66
25 0.56
26 0.47
27 0.41
28 0.36
29 0.27
30 0.24
31 0.21
32 0.27
33 0.31
34 0.33
35 0.36
36 0.39
37 0.42
38 0.51
39 0.58
40 0.61
41 0.67
42 0.73
43 0.77
44 0.77
45 0.75
46 0.7
47 0.63
48 0.6
49 0.6
50 0.59
51 0.52
52 0.54
53 0.61
54 0.66
55 0.71
56 0.73
57 0.74
58 0.77
59 0.84
60 0.86
61 0.87
62 0.87
63 0.87
64 0.87
65 0.85
66 0.81
67 0.73
68 0.65
69 0.58
70 0.48
71 0.43
72 0.33
73 0.24
74 0.2
75 0.25
76 0.24
77 0.24
78 0.28
79 0.27
80 0.28
81 0.37
82 0.36
83 0.29
84 0.29
85 0.27
86 0.24
87 0.23
88 0.23
89 0.15
90 0.17
91 0.19
92 0.24
93 0.31
94 0.39
95 0.48
96 0.51
97 0.57
98 0.65
99 0.75
100 0.8
101 0.82
102 0.84
103 0.82
104 0.83
105 0.78
106 0.68
107 0.59
108 0.49
109 0.41
110 0.33
111 0.26
112 0.22
113 0.2
114 0.23
115 0.22
116 0.23
117 0.19
118 0.2
119 0.19
120 0.18
121 0.19
122 0.14
123 0.15
124 0.13
125 0.14
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.09
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.17
167 0.19
168 0.22
169 0.29
170 0.35
171 0.36
172 0.45
173 0.53
174 0.52
175 0.51
176 0.5
177 0.51
178 0.48
179 0.46
180 0.4
181 0.33
182 0.33
183 0.33
184 0.3
185 0.22
186 0.21
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.18
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.15
197 0.13
198 0.13
199 0.11
200 0.14
201 0.19
202 0.26
203 0.32
204 0.39
205 0.48
206 0.54
207 0.58
208 0.61
209 0.64
210 0.67
211 0.72
212 0.73
213 0.72
214 0.68
215 0.66
216 0.68
217 0.65
218 0.61
219 0.6
220 0.51
221 0.47
222 0.44
223 0.42
224 0.35
225 0.3
226 0.27
227 0.18
228 0.17
229 0.16
230 0.18
231 0.21
232 0.24
233 0.25
234 0.31
235 0.33
236 0.33
237 0.32
238 0.3
239 0.31
240 0.33
241 0.36
242 0.35
243 0.38
244 0.45
245 0.52
246 0.62
247 0.66
248 0.71
249 0.73
250 0.7
251 0.71
252 0.65
253 0.62
254 0.55
255 0.53
256 0.46
257 0.42
258 0.39
259 0.36
260 0.36
261 0.33
262 0.3
263 0.26
264 0.23
265 0.18
266 0.2