Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B0CZX1

Protein Details
Accession B0CZX1    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-35TPEPQSSPILKRKRKVEENFDSDTHydrophilic
56-79PVLSHAERRRQKKEAKAKGKLEASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-87ERRRQKKEAKAKGKLEASLAKKRKLK
333-358KTKPVDGAAPKKGRRPLSAGYKPKRP
398-423DKRTSRGEKDGVRHKGPRTRPKPGAA
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_311395  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSSSASSSSPTPEPQSSPILKRKRKVEENFDSDTDEVDSDASDEEEAAPAILGEPVLSHAERRRQKKEAKAKGKLEASLAKKRKLKDGSAVAVPVSAKRQNSVWVGNMSFKTTQENLRTFFDGCGEITRINMPTKAPAGPGLIPENRGFAYVDFSTPEGKAAAIARSEQPLVGRKLLIKDGDDFAGRPLAPGVDVKTNDSALAQRTHSKTAQKILRAQKQPPAPTLFIGNLGFETTDDAIRQLFEAHRVVSKNKEVKEEEGEEKKTKDVWIRKVRMGTFEDSGLCKGFAFVDFTSIDHATSVLINPKNHHLNGRDLVVQYAGADAVRRGAVKTKPVDGAAPKKGRRPLSAGYKPKRPQLQGEYSSADKEPTRKHRETKPVEDDSASSKVKRENPDEDKRTSRGEKDGVRHKGPRTRPKPGAALALAKRESAAIIPSQGQKITF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.42
4 0.44
5 0.49
6 0.56
7 0.61
8 0.65
9 0.69
10 0.75
11 0.77
12 0.81
13 0.82
14 0.83
15 0.83
16 0.81
17 0.79
18 0.71
19 0.63
20 0.53
21 0.44
22 0.35
23 0.24
24 0.17
25 0.12
26 0.11
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.06
37 0.05
38 0.06
39 0.06
40 0.05
41 0.04
42 0.04
43 0.06
44 0.09
45 0.09
46 0.13
47 0.18
48 0.28
49 0.37
50 0.45
51 0.51
52 0.57
53 0.66
54 0.73
55 0.79
56 0.8
57 0.83
58 0.84
59 0.82
60 0.81
61 0.77
62 0.68
63 0.61
64 0.58
65 0.54
66 0.55
67 0.55
68 0.55
69 0.55
70 0.56
71 0.61
72 0.59
73 0.57
74 0.56
75 0.58
76 0.55
77 0.53
78 0.51
79 0.41
80 0.36
81 0.32
82 0.24
83 0.21
84 0.2
85 0.18
86 0.18
87 0.2
88 0.23
89 0.27
90 0.29
91 0.28
92 0.27
93 0.28
94 0.31
95 0.31
96 0.28
97 0.25
98 0.23
99 0.24
100 0.23
101 0.28
102 0.3
103 0.33
104 0.33
105 0.35
106 0.36
107 0.32
108 0.3
109 0.26
110 0.2
111 0.17
112 0.17
113 0.15
114 0.13
115 0.13
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.14
121 0.16
122 0.18
123 0.18
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.16
128 0.18
129 0.2
130 0.19
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.17
135 0.17
136 0.16
137 0.11
138 0.14
139 0.12
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.13
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.13
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.17
159 0.19
160 0.18
161 0.18
162 0.18
163 0.2
164 0.23
165 0.22
166 0.17
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.16
171 0.14
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.1
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.13
189 0.11
190 0.13
191 0.12
192 0.17
193 0.19
194 0.22
195 0.24
196 0.27
197 0.27
198 0.32
199 0.36
200 0.33
201 0.4
202 0.45
203 0.51
204 0.52
205 0.52
206 0.5
207 0.51
208 0.5
209 0.45
210 0.41
211 0.32
212 0.28
213 0.28
214 0.22
215 0.19
216 0.17
217 0.13
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.06
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.13
236 0.15
237 0.16
238 0.19
239 0.26
240 0.29
241 0.3
242 0.35
243 0.34
244 0.35
245 0.39
246 0.39
247 0.37
248 0.37
249 0.38
250 0.34
251 0.34
252 0.32
253 0.28
254 0.26
255 0.29
256 0.31
257 0.38
258 0.46
259 0.5
260 0.52
261 0.56
262 0.55
263 0.52
264 0.48
265 0.4
266 0.31
267 0.27
268 0.25
269 0.21
270 0.21
271 0.16
272 0.13
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.1
278 0.09
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.1
286 0.1
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.13
291 0.17
292 0.18
293 0.2
294 0.26
295 0.31
296 0.31
297 0.35
298 0.31
299 0.34
300 0.35
301 0.36
302 0.33
303 0.28
304 0.27
305 0.22
306 0.2
307 0.13
308 0.1
309 0.08
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.14
318 0.17
319 0.24
320 0.27
321 0.3
322 0.31
323 0.31
324 0.35
325 0.35
326 0.4
327 0.42
328 0.48
329 0.47
330 0.51
331 0.58
332 0.58
333 0.56
334 0.54
335 0.53
336 0.55
337 0.63
338 0.67
339 0.66
340 0.71
341 0.71
342 0.73
343 0.73
344 0.66
345 0.64
346 0.63
347 0.67
348 0.61
349 0.62
350 0.57
351 0.5
352 0.49
353 0.4
354 0.33
355 0.25
356 0.27
357 0.32
358 0.39
359 0.48
360 0.53
361 0.6
362 0.67
363 0.76
364 0.79
365 0.8
366 0.78
367 0.75
368 0.7
369 0.64
370 0.56
371 0.5
372 0.48
373 0.39
374 0.31
375 0.29
376 0.33
377 0.39
378 0.46
379 0.48
380 0.51
381 0.59
382 0.69
383 0.71
384 0.7
385 0.69
386 0.64
387 0.65
388 0.61
389 0.56
390 0.52
391 0.54
392 0.55
393 0.58
394 0.65
395 0.65
396 0.67
397 0.69
398 0.69
399 0.7
400 0.74
401 0.76
402 0.75
403 0.77
404 0.77
405 0.78
406 0.77
407 0.72
408 0.7
409 0.62
410 0.62
411 0.55
412 0.56
413 0.5
414 0.42
415 0.38
416 0.31
417 0.28
418 0.2
419 0.19
420 0.13
421 0.15
422 0.2
423 0.24
424 0.27