Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9XDQ6

Protein Details
Accession S9XDQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-77VTPAEERPQRGRSRRRLRRRRNLASNPLSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-68PQRGRSRRRLRRRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038886  E3_SLX5/Rfp1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0035861  C:site of double-strand break  
GO:0033768  C:SUMO-targeted ubiquitin ligase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016874  F:ligase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0140082  F:SUMO-ubiquitin ligase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0120290  P:stalled replication fork localization to nuclear periphery  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
CDD cd16449  RING-HC  
Amino Acid Sequences MPLNESIDVNSSDVIDLTRTPSPINEPPQSSAPTVIDVDAIPDDPFTVTPAEERPQRGRSRRRLRRRRNLASNPLSYLEDMVYLGPQVVSRRSSRGSRSLLEIMTRSFPDLGSANAMSPTLFEMLLGRMRYESSHPGRETSASGVNDYFSDYVPETETHSPSIEERKATYVPPKPASQGYTRSFGSETAMACPRCHEELGISKSVEKASVWATKCGHVYCGSCAKVLKTSRRPEAKCSALGCNRYLNTKNAIWELYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.09
4 0.12
5 0.14
6 0.15
7 0.15
8 0.17
9 0.23
10 0.3
11 0.36
12 0.39
13 0.39
14 0.42
15 0.46
16 0.47
17 0.41
18 0.36
19 0.3
20 0.26
21 0.24
22 0.2
23 0.17
24 0.13
25 0.14
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.13
38 0.17
39 0.21
40 0.25
41 0.3
42 0.37
43 0.46
44 0.54
45 0.61
46 0.67
47 0.75
48 0.81
49 0.86
50 0.9
51 0.93
52 0.94
53 0.95
54 0.94
55 0.94
56 0.93
57 0.92
58 0.88
59 0.79
60 0.7
61 0.61
62 0.51
63 0.4
64 0.3
65 0.2
66 0.13
67 0.1
68 0.08
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.07
75 0.09
76 0.11
77 0.13
78 0.16
79 0.19
80 0.24
81 0.27
82 0.33
83 0.34
84 0.33
85 0.36
86 0.35
87 0.33
88 0.3
89 0.26
90 0.2
91 0.18
92 0.17
93 0.13
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.07
105 0.06
106 0.07
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.17
120 0.18
121 0.24
122 0.24
123 0.25
124 0.26
125 0.26
126 0.25
127 0.2
128 0.21
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.12
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.12
143 0.15
144 0.16
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.22
150 0.2
151 0.18
152 0.18
153 0.21
154 0.22
155 0.23
156 0.29
157 0.29
158 0.34
159 0.36
160 0.37
161 0.36
162 0.37
163 0.39
164 0.36
165 0.37
166 0.33
167 0.34
168 0.33
169 0.32
170 0.3
171 0.27
172 0.25
173 0.19
174 0.17
175 0.17
176 0.22
177 0.22
178 0.21
179 0.23
180 0.24
181 0.23
182 0.23
183 0.19
184 0.17
185 0.25
186 0.3
187 0.32
188 0.29
189 0.27
190 0.29
191 0.29
192 0.26
193 0.17
194 0.14
195 0.15
196 0.22
197 0.23
198 0.27
199 0.28
200 0.31
201 0.34
202 0.33
203 0.3
204 0.27
205 0.27
206 0.27
207 0.34
208 0.31
209 0.3
210 0.31
211 0.3
212 0.34
213 0.39
214 0.45
215 0.46
216 0.54
217 0.62
218 0.71
219 0.72
220 0.72
221 0.74
222 0.69
223 0.65
224 0.6
225 0.59
226 0.56
227 0.57
228 0.51
229 0.5
230 0.45
231 0.47
232 0.47
233 0.42
234 0.4
235 0.4
236 0.42
237 0.38