Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S9W2A5

Protein Details
Accession S9W2A5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
202-221KPPLNKTRSKRRNSRSMIRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-216RKKGGKPPLNKTRSKRRNSR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0005721  C:pericentric heterochromatin  
GO:0110129  C:SHREC2 complex  
GO:0031508  P:pericentric heterochromatin formation  
GO:0000183  P:rDNA heterochromatin formation  
GO:0030466  P:silent mating-type cassette heterochromatin formation  
GO:0031048  P:small ncRNA-mediated heterochromatin formation  
GO:0031509  P:subtelomeric heterochromatin formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd18637  CD_Swi6_like  
cd18657  CSD_Swi6  
Amino Acid Sequences MVKAASLNLMSNLIMKGESTSSGKNSNTFSGEVNDLASTSSNSGAEEVEKSFELDDPAANSAVFQRDEKEVQEPQDFLTPSTSYKIQSTSISNESNALKHKENPESKAETNQSQSPSKHDSPSLPLLGSRDSEDAEDSDESDEEYIVEAILDARLKEDGSGYQYYLKWEGYDDPEDNTWNEEEDCVGCQELVNEFWRKKGGKPPLNKTRSKRRNSRSMIRSSSLSTSEDDDPQPSISTYSRKRRRSSSILRRPEDNTDFKFSKSPTANSKTPTIDSFLNLRKKSNFNPPFNESSWEDLVDRVETVQKLKNGKILVKLHWKNGQQSTHDNVVVHQKCPLHIIRFYEDHLSFQEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.14
6 0.15
7 0.18
8 0.2
9 0.26
10 0.27
11 0.29
12 0.31
13 0.32
14 0.32
15 0.3
16 0.28
17 0.26
18 0.27
19 0.23
20 0.21
21 0.17
22 0.14
23 0.14
24 0.13
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.15
53 0.19
54 0.21
55 0.22
56 0.25
57 0.25
58 0.28
59 0.3
60 0.28
61 0.25
62 0.3
63 0.28
64 0.24
65 0.24
66 0.21
67 0.19
68 0.22
69 0.22
70 0.17
71 0.18
72 0.2
73 0.18
74 0.21
75 0.23
76 0.25
77 0.28
78 0.28
79 0.26
80 0.28
81 0.27
82 0.27
83 0.28
84 0.27
85 0.25
86 0.28
87 0.34
88 0.4
89 0.44
90 0.45
91 0.47
92 0.49
93 0.48
94 0.5
95 0.47
96 0.41
97 0.4
98 0.4
99 0.38
100 0.37
101 0.36
102 0.34
103 0.38
104 0.38
105 0.37
106 0.35
107 0.33
108 0.33
109 0.37
110 0.33
111 0.25
112 0.23
113 0.22
114 0.21
115 0.2
116 0.16
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.13
150 0.14
151 0.15
152 0.16
153 0.15
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.15
159 0.15
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.14
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.19
184 0.19
185 0.22
186 0.29
187 0.37
188 0.41
189 0.49
190 0.58
191 0.65
192 0.71
193 0.75
194 0.73
195 0.74
196 0.76
197 0.77
198 0.77
199 0.74
200 0.77
201 0.78
202 0.82
203 0.78
204 0.77
205 0.73
206 0.64
207 0.58
208 0.5
209 0.44
210 0.36
211 0.29
212 0.21
213 0.2
214 0.19
215 0.2
216 0.19
217 0.17
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.19
225 0.26
226 0.37
227 0.46
228 0.53
229 0.57
230 0.63
231 0.69
232 0.72
233 0.75
234 0.76
235 0.77
236 0.8
237 0.77
238 0.73
239 0.68
240 0.65
241 0.6
242 0.55
243 0.49
244 0.46
245 0.45
246 0.42
247 0.44
248 0.36
249 0.38
250 0.36
251 0.36
252 0.38
253 0.44
254 0.47
255 0.46
256 0.5
257 0.44
258 0.42
259 0.39
260 0.33
261 0.27
262 0.26
263 0.3
264 0.32
265 0.38
266 0.37
267 0.4
268 0.42
269 0.47
270 0.5
271 0.54
272 0.56
273 0.54
274 0.6
275 0.62
276 0.63
277 0.59
278 0.58
279 0.49
280 0.45
281 0.39
282 0.34
283 0.28
284 0.23
285 0.23
286 0.19
287 0.17
288 0.12
289 0.15
290 0.15
291 0.18
292 0.22
293 0.26
294 0.3
295 0.32
296 0.36
297 0.35
298 0.38
299 0.44
300 0.43
301 0.46
302 0.52
303 0.55
304 0.56
305 0.6
306 0.61
307 0.6
308 0.63
309 0.62
310 0.56
311 0.58
312 0.57
313 0.55
314 0.53
315 0.45
316 0.39
317 0.44
318 0.41
319 0.36
320 0.34
321 0.3
322 0.29
323 0.34
324 0.39
325 0.33
326 0.35
327 0.4
328 0.41
329 0.42
330 0.44
331 0.46
332 0.4
333 0.37