FuNGI

S9X708

Protein Details

Accession

S9X708

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-35	EKKAHYAKHSGPKAEKKKSKKAPNANAESNPKA	Hydrophilic
180-201	LFKKPATLRAAKKRLKHRFWTE	Hydrophilic
499-519	TASFIESRRRRRRNLQKVFYD	Hydrophilic
768-789	LVQARIKRHRWHKKILKTNDPL	Hydrophilic
1022-1045	LPYASRPKEVRPRSKPTYMQKRTV	Hydrophilic
1059-1089	QKVMTLKSDKESKRKAKKAEEHEKYHKKMQK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-25	AKHSGPKAEKKKSKKAP
188-195	RAAKKRLK
1068-1089	KESKRKAKKAEEHEKYHKKMQK
1097-1128	KKRQEKADWFARNGKRLRQDSGATSGGKKSRR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012948 AARP2CN IPR039761 Bms1/Tsr1 IPR037875 Bms1_N IPR007034 BMS1_TSR1_C IPR030387 G_Bms1/Tsr1_dom IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:2000232 P:regulation of rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF08142 AARP2CN PF04950 RIBIOP_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51714 G_BMS1
CDD	cd01882 BMS1

Amino Acid Sequences

MDEKKAHYAKHSGPKAEKKKSKKAPNANAESNPKAFAVASAGRMARQAMRTADLSQKKLHVPMVDRTPDESPPPVIVAVMGPPGTGKSTLIKSLVRRYSKYTVSNITGPITVVAGKSRRITFLECPNDLSSMIDVAKIADLVLLLVDANFGFEMETMEFLNILAPHGMPRIMGVLTHLDLFKKPATLRAAKKRLKHRFWTELYQGAKLFYLSGVLNGRYPDREILNLSRFISVMKFRPLQWRNQHPYLLADRMEDLTLPTEIEENPKVSRTVTLYGYLHGTNLPKHDAPVHIPGVGDFNVADASKLDDPCPPPDADKVRRRRLSEKQKLIYGPMADIGGILFDKDRVYIEVPTSNFSKDDNSEAGVGERMVMQLQEAHQPLGANPSSGIQLFSNTNVIGSEAEQEASDVGRKARRQPTGIVSDDMLHLEENEANDSENESADENDVGYSENIGATKDNEDEAAEEEVPFAESDSDLGDLLDEEESSDLKWKEGMASRATASFIESRRRRRRNLQKVFYDESLSPEQALSEIHGEPLDTVENGSDEGEGDDDDFFKPRKADLETPTRTNEKNSFEEELERYNKKYEDSERLARLKYHFITGSLLDTQEKDEGGADEEENETADFEDLEDEGSTDNNEGGEPSVDNEKSGEPGEDEASDAPDFEEEREENARKKEELKLRFEEEDRGDPEKKDVDWYGEEKEKIARQLEINREAFKDMDPESRAEIEGYRAGAYVRLVFKGVPYEFVEQFDSRYPVVVGGLLPNEQRYGLVQARIKRHRWHKKILKTNDPLIFSLGWRRVQSVPVYSISDSRTRNRMLKYTPEHMHCFATFYGPFIAPNTGFCAVQYVANSFAQAGSFRIAATGTVLDVNQSSEIVKKLKLTGVPYKIFKNTAFIKKMFNSPLEVAKFEGANIRTVSGIRGQVKKAVDKEHGHFRATFEDKVLMSDIVFLRAWYPVQVREFCTTVTNLLEPVKNEWTGMRLTGEVRHELGLKTPLRPNSQYKEIVRPTRHFNPLKVPASLQAQLPYASRPKEVRPRSKPTYMQKRTVLLNADERKARDLLQKVMTLKSDKESKRKAKKAEEHEKYHKKMQKEEQVYVEKKRQEKADWFARNGKRLRQDSGATSGGKKSRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.8
3	0.83
4	0.83
5	0.83
6	0.86
7	0.89
8	0.9
9	0.9
10	0.91
11	0.91
12	0.92
13	0.92
14	0.88
15	0.85
16	0.82
17	0.76
18	0.66
19	0.57
20	0.46
21	0.38
22	0.3
23	0.23
24	0.21
25	0.19
26	0.19
27	0.22
28	0.23
29	0.22
30	0.23
31	0.24
32	0.23
33	0.23
34	0.26
35	0.24
36	0.27
37	0.28
38	0.31
39	0.39
40	0.4
41	0.41
42	0.4
43	0.42
44	0.42
45	0.44
46	0.45
47	0.41
48	0.39
49	0.44
50	0.49
51	0.5
52	0.48
53	0.47
54	0.46
55	0.42
56	0.41
57	0.36
58	0.29
59	0.25
60	0.25
61	0.21
62	0.18
63	0.16
64	0.14
65	0.12
66	0.13
67	0.11
68	0.09
69	0.1
70	0.11
71	0.12
72	0.12
73	0.12
74	0.15
75	0.18
76	0.22
77	0.25
78	0.29
79	0.32
80	0.42
81	0.49
82	0.5
83	0.5
84	0.54
85	0.58
86	0.61
87	0.61
88	0.57
89	0.55
90	0.53
91	0.54
92	0.49
93	0.43
94	0.36
95	0.31
96	0.25
97	0.19
98	0.15
99	0.12
100	0.16
101	0.16
102	0.19
103	0.24
104	0.26
105	0.28
106	0.3
107	0.35
108	0.36
109	0.44
110	0.48
111	0.44
112	0.46
113	0.44
114	0.42
115	0.37
116	0.32
117	0.22
118	0.17
119	0.16
120	0.12
121	0.11
122	0.1
123	0.11
124	0.09
125	0.08
126	0.06
127	0.06
128	0.05
129	0.05
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.04
138	0.04
139	0.05
140	0.07
141	0.07
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.1
148	0.08
149	0.09
150	0.09
151	0.08
152	0.1
153	0.11
154	0.11
155	0.08
156	0.09
157	0.1
158	0.09
159	0.09
160	0.1
161	0.11
162	0.12
163	0.14
164	0.14
165	0.13
166	0.14
167	0.17
168	0.17
169	0.18
170	0.18
171	0.23
172	0.3
173	0.38
174	0.47
175	0.55
176	0.64
177	0.65
178	0.73
179	0.77
180	0.81
181	0.81
182	0.81
183	0.8
184	0.79
185	0.79
186	0.79
187	0.72
188	0.68
189	0.61
190	0.54
191	0.46
192	0.36
193	0.31
194	0.23
195	0.18
196	0.11
197	0.12
198	0.09
199	0.11
200	0.13
201	0.14
202	0.15
203	0.16
204	0.18
205	0.17
206	0.19
207	0.19
208	0.18
209	0.19
210	0.22
211	0.27
212	0.3
213	0.31
214	0.31
215	0.28
216	0.27
217	0.25
218	0.24
219	0.22
220	0.22
221	0.25
222	0.27
223	0.28
224	0.39
225	0.41
226	0.48
227	0.53
228	0.6
229	0.62
230	0.65
231	0.65
232	0.55
233	0.57
234	0.52
235	0.46
236	0.36
237	0.28
238	0.24
239	0.23
240	0.22
241	0.17
242	0.13
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.13
250	0.14
251	0.15
252	0.16
253	0.17
254	0.18
255	0.17
256	0.19
257	0.18
258	0.2
259	0.2
260	0.24
261	0.23
262	0.23
263	0.25
264	0.22
265	0.19
266	0.17
267	0.17
268	0.15
269	0.17
270	0.2
271	0.18
272	0.19
273	0.21
274	0.21
275	0.23
276	0.28
277	0.26
278	0.23
279	0.22
280	0.22
281	0.22
282	0.19
283	0.16
284	0.09
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.06
290	0.09
291	0.12
292	0.13
293	0.14
294	0.17
295	0.2
296	0.22
297	0.25
298	0.22
299	0.21
300	0.27
301	0.35
302	0.4
303	0.47
304	0.54
305	0.61
306	0.67
307	0.71
308	0.72
309	0.75
310	0.77
311	0.78
312	0.78
313	0.72
314	0.71
315	0.67
316	0.61
317	0.54
318	0.43
319	0.32
320	0.23
321	0.19
322	0.13
323	0.12
324	0.09
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.08
334	0.1
335	0.11
336	0.13
337	0.17
338	0.17
339	0.19
340	0.2
341	0.19
342	0.17
343	0.16
344	0.18
345	0.14
346	0.17
347	0.16
348	0.16
349	0.16
350	0.15
351	0.15
352	0.13
353	0.11
354	0.08
355	0.07
356	0.06
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.07
362	0.12
363	0.12
364	0.13
365	0.13
366	0.14
367	0.14
368	0.18
369	0.17
370	0.12
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.13
376	0.07
377	0.09
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.07
389	0.08
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.07
396	0.09
397	0.13
398	0.15
399	0.24
400	0.32
401	0.36
402	0.37
403	0.4
404	0.45
405	0.46
406	0.47
407	0.39
408	0.32
409	0.28
410	0.26
411	0.22
412	0.15
413	0.09
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.08
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.09
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.06
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.09
449	0.1
450	0.09
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.06
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.05
461	0.05
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.05
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.1
477	0.1
478	0.13
479	0.17
480	0.19
481	0.16
482	0.17
483	0.18
484	0.18
485	0.18
486	0.15
487	0.13
488	0.14
489	0.15
490	0.23
491	0.28
492	0.38
493	0.48
494	0.55
495	0.59
496	0.66
497	0.75
498	0.76
499	0.82
500	0.8
501	0.76
502	0.77
503	0.75
504	0.65
505	0.56
506	0.44
507	0.38
508	0.31
509	0.24
510	0.18
511	0.14
512	0.13
513	0.1
514	0.1
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.05
529	0.05
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.05
538	0.05
539	0.06
540	0.07
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.12
545	0.15
546	0.2
547	0.24
548	0.33
549	0.35
550	0.37
551	0.39
552	0.39
553	0.35
554	0.33
555	0.33
556	0.28
557	0.28
558	0.28
559	0.28
560	0.25
561	0.28
562	0.25
563	0.24
564	0.24
565	0.23
566	0.21
567	0.21
568	0.21
569	0.2
570	0.23
571	0.23
572	0.27
573	0.32
574	0.36
575	0.38
576	0.4
577	0.4
578	0.38
579	0.35
580	0.32
581	0.27
582	0.25
583	0.2
584	0.18
585	0.19
586	0.17
587	0.17
588	0.12
589	0.12
590	0.1
591	0.1
592	0.1
593	0.09
594	0.08
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.05
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.05
626	0.05
627	0.06
628	0.1
629	0.09
630	0.1
631	0.1
632	0.1
633	0.11
634	0.12
635	0.11
636	0.07
637	0.09
638	0.09
639	0.08
640	0.09
641	0.08
642	0.09
643	0.08
644	0.08
645	0.07
646	0.06
647	0.07
648	0.06
649	0.09
650	0.07
651	0.1
652	0.14
653	0.16
654	0.2
655	0.23
656	0.25
657	0.23
658	0.26
659	0.31
660	0.35
661	0.4
662	0.43
663	0.44
664	0.45
665	0.47
666	0.45
667	0.43
668	0.37
669	0.35
670	0.31
671	0.31
672	0.3
673	0.27
674	0.28
675	0.25
676	0.23
677	0.21
678	0.19
679	0.18
680	0.19
681	0.21
682	0.22
683	0.24
684	0.24
685	0.21
686	0.24
687	0.23
688	0.23
689	0.23
690	0.21
691	0.2
692	0.27
693	0.33
694	0.36
695	0.36
696	0.34
697	0.34
698	0.33
699	0.3
700	0.23
701	0.2
702	0.15
703	0.18
704	0.18
705	0.18
706	0.19
707	0.19
708	0.19
709	0.16
710	0.15
711	0.12
712	0.12
713	0.12
714	0.1
715	0.09
716	0.09
717	0.09
718	0.09
719	0.12
720	0.11
721	0.11
722	0.11
723	0.11
724	0.12
725	0.16
726	0.16
727	0.15
728	0.17
729	0.2
730	0.2
731	0.22
732	0.25
733	0.19
734	0.21
735	0.2
736	0.19
737	0.15
738	0.15
739	0.14
740	0.11
741	0.11
742	0.1
743	0.08
744	0.07
745	0.08
746	0.08
747	0.09
748	0.09
749	0.09
750	0.08
751	0.08
752	0.08
753	0.13
754	0.14
755	0.19
756	0.22
757	0.28
758	0.37
759	0.44
760	0.47
761	0.5
762	0.59
763	0.65
764	0.69
765	0.74
766	0.75
767	0.78
768	0.84
769	0.84
770	0.84
771	0.78
772	0.79
773	0.73
774	0.65
775	0.55
776	0.47
777	0.39
778	0.29
779	0.3
780	0.26
781	0.24
782	0.22
783	0.25
784	0.24
785	0.26
786	0.28
787	0.26
788	0.24
789	0.23
790	0.25
791	0.23
792	0.24
793	0.23
794	0.27
795	0.26
796	0.28
797	0.31
798	0.33
799	0.38
800	0.39
801	0.43
802	0.41
803	0.48
804	0.5
805	0.53
806	0.55
807	0.54
808	0.54
809	0.5
810	0.49
811	0.39
812	0.35
813	0.27
814	0.26
815	0.21
816	0.18
817	0.18
818	0.15
819	0.16
820	0.14
821	0.17
822	0.13
823	0.13
824	0.16
825	0.15
826	0.15
827	0.14
828	0.16
829	0.14
830	0.16
831	0.16
832	0.13
833	0.14
834	0.15
835	0.15
836	0.11
837	0.11
838	0.1
839	0.09
840	0.09
841	0.08
842	0.08
843	0.08
844	0.08
845	0.08
846	0.07
847	0.08
848	0.07
849	0.06
850	0.07
851	0.07
852	0.07
853	0.07
854	0.08
855	0.07
856	0.07
857	0.07
858	0.08
859	0.12
860	0.13
861	0.14
862	0.16
863	0.18
864	0.21
865	0.24
866	0.28
867	0.34
868	0.4
869	0.43
870	0.44
871	0.45
872	0.45
873	0.45
874	0.39
875	0.37
876	0.38
877	0.42
878	0.44
879	0.42
880	0.45
881	0.45
882	0.51
883	0.48
884	0.41
885	0.36
886	0.33
887	0.39
888	0.35
889	0.33
890	0.28
891	0.25
892	0.24
893	0.2
894	0.24
895	0.17
896	0.19
897	0.19
898	0.18
899	0.17
900	0.17
901	0.18
902	0.16
903	0.22
904	0.24
905	0.28
906	0.29
907	0.34
908	0.36
909	0.41
910	0.41
911	0.41
912	0.43
913	0.44
914	0.47
915	0.53
916	0.53
917	0.49
918	0.45
919	0.41
920	0.43
921	0.41
922	0.38
923	0.28
924	0.29
925	0.27
926	0.27
927	0.27
928	0.18
929	0.14
930	0.18
931	0.17
932	0.16
933	0.16
934	0.14
935	0.13
936	0.14
937	0.15
938	0.13
939	0.15
940	0.18
941	0.23
942	0.27
943	0.29
944	0.32
945	0.32
946	0.3
947	0.3
948	0.26
949	0.22
950	0.21
951	0.18
952	0.16
953	0.18
954	0.2
955	0.19
956	0.22
957	0.24
958	0.22
959	0.22
960	0.21
961	0.2
962	0.19
963	0.19
964	0.16
965	0.14
966	0.15
967	0.19
968	0.22
969	0.22
970	0.22
971	0.22
972	0.22
973	0.21
974	0.24
975	0.26
976	0.25
977	0.28
978	0.33
979	0.37
980	0.42
981	0.47
982	0.52
983	0.51
984	0.57
985	0.6
986	0.58
987	0.62
988	0.65
989	0.68
990	0.67
991	0.64
992	0.65
993	0.66
994	0.72
995	0.66
996	0.61
997	0.62
998	0.65
999	0.65
1000	0.58
1001	0.5
1002	0.45
1003	0.46
1004	0.44
1005	0.36
1006	0.29
1007	0.26
1008	0.26
1009	0.26
1010	0.26
1011	0.27
1012	0.27
1013	0.3
1014	0.3
1015	0.38
1016	0.48
1017	0.57
1018	0.63
1019	0.66
1020	0.74
1021	0.77
1022	0.82
1023	0.82
1024	0.83
1025	0.84
1026	0.81
1027	0.8
1028	0.76
1029	0.73
1030	0.67
1031	0.64
1032	0.58
1033	0.51
1034	0.53
1035	0.5
1036	0.49
1037	0.49
1038	0.46
1039	0.44
1040	0.4
1041	0.4
1042	0.38
1043	0.38
1044	0.4
1045	0.41
1046	0.45
1047	0.44
1048	0.46
1049	0.47
1050	0.42
1051	0.39
1052	0.38
1053	0.43
1054	0.44
1055	0.52
1056	0.59
1057	0.66
1058	0.74
1059	0.8
1060	0.83
1061	0.85
1062	0.88
1063	0.89
1064	0.9
1065	0.88
1066	0.87
1067	0.89
1068	0.9
1069	0.84
1070	0.84
1071	0.79
1072	0.73
1073	0.74
1074	0.74
1075	0.74
1076	0.71
1077	0.71
1078	0.7
1079	0.75
1080	0.74
1081	0.72
1082	0.69
1083	0.65
1084	0.63
1085	0.63
1086	0.61
1087	0.58
1088	0.62
1089	0.63
1090	0.66
1091	0.67
1092	0.67
1093	0.71
1094	0.72
1095	0.72
1096	0.7
1097	0.69
1098	0.69
1099	0.66
1100	0.66
1101	0.62
1102	0.6
1103	0.56
1104	0.57
1105	0.53
1106	0.45
1107	0.43
1108	0.44

S9X708

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer