FuNGI

S9X4Q7

Protein Details

Accession

S9X4Q7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-130	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSSREAAQKE	Hydrophilic
774-794	VVKQLYTKKKQGKPLKLSGKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 9.833, mito 7.5, cyto_mito 6.833, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process GO:0051984 P:positive regulation of chromosome segregation GO:0106354 P:tRNA surveillance
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRLLSRKFAKVITPVVEAPTQTLPDGTEVGPDLSLPNPNGEECDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPETEDEMMIAVFEYTDRILAMVRPRKLLYIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSSREAAQKEAELETCIEEAKKQGIPVDEEASKKKAWDSNCITPGTPFMDTLAKSLRYYIINKLNTDPCWRNTRFILSDASVPGEGEHKIMEFIRSQRVKPEYDPNTHHVVYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQQGSTRKTKEERLGLKRLDETSETNKVPVKKPFIWLHVSILREYLEVELYVPNLPFPFDLERAIDDWVFFIFFVGNDFLPHLPSLDIRDGAVERLTEIWRTCLPHMGGYLTLDGSVNLTRAEMILTAVGDQEDDIFKRLKQQEDRRTENQKRRAQREANQNDSSYLDEAVIQRSVKVESSQATVAPSVETSTEDDGRPNKIRKTGGPPPEDLVNLSERASNRSLGATNKDLINNRAANRLGLSNEAATTSSINKIAAANLKSQMISNEVLHAVPIEDVVSSPTPSATDDIASSDPSGLATPIEPAPVSAGMKRKAEDNSTSDEATTDTVRLHEAGYRERYYEQKFGFSVDDTDQLGEAIRHYVHGLCWVLLYYYQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFKNLSSIDVKFDLNQPFRPYEQLLGVLPAASKNNLPEKLQSLMTQNDSEIIDFYPEDFVIDLNGKKFEWQGVALLPFIDENRLLSAVSKVYPSLSEEEARRNTNGSTLLFVSEHHPMYPEVVKQLYTKKKQGKPLKLSGKVGHGIFGKVSNDDSILPNVSVQCPVDVTTADALQKYGNIENNQSLSLQYEVPKSNFVHKSMLLRGVKMPPKVLTPEDVSIVRAERNNTGRRNNNSFRGGGPRRGGFQGYGAQRSSYQSQNYSYNQQTYTGVTNGFANTGSQPPWKQFGNFPRSANAYSARGGYGQSGPSNGNFHMNNRGNSYGYGYSPATGYNGKGAHR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.41
4	0.44
5	0.4
6	0.4
7	0.37
8	0.38
9	0.37
10	0.32
11	0.29
12	0.26
13	0.23
14	0.19
15	0.19
16	0.16
17	0.16
18	0.19
19	0.15
20	0.14
21	0.14
22	0.15
23	0.14
24	0.13
25	0.13
26	0.12
27	0.17
28	0.15
29	0.17
30	0.18
31	0.18
32	0.21
33	0.21
34	0.22
35	0.21
36	0.24
37	0.21
38	0.2
39	0.21
40	0.18
41	0.17
42	0.15
43	0.13
44	0.1
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.13
50	0.18
51	0.21
52	0.23
53	0.29
54	0.36
55	0.4
56	0.44
57	0.44
58	0.43
59	0.41
60	0.41
61	0.35
62	0.29
63	0.23
64	0.2
65	0.16
66	0.11
67	0.1
68	0.07
69	0.05
70	0.04
71	0.05
72	0.05
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.07
77	0.11
78	0.21
79	0.28
80	0.3
81	0.34
82	0.35
83	0.36
84	0.37
85	0.37
86	0.32
87	0.31
88	0.3
89	0.26
90	0.27
91	0.25
92	0.25
93	0.23
94	0.19
95	0.12
96	0.15
97	0.21
98	0.28
99	0.39
100	0.46
101	0.55
102	0.66
103	0.74
104	0.8
105	0.84
106	0.82
107	0.8
108	0.8
109	0.78
110	0.78
111	0.8
112	0.75
113	0.68
114	0.65
115	0.59
116	0.51
117	0.44
118	0.34
119	0.25
120	0.21
121	0.19
122	0.16
123	0.15
124	0.13
125	0.11
126	0.13
127	0.15
128	0.16
129	0.16
130	0.19
131	0.21
132	0.25
133	0.27
134	0.3
135	0.29
136	0.31
137	0.34
138	0.33
139	0.3
140	0.27
141	0.29
142	0.29
143	0.29
144	0.36
145	0.41
146	0.47
147	0.51
148	0.52
149	0.47
150	0.43
151	0.43
152	0.36
153	0.29
154	0.2
155	0.16
156	0.19
157	0.19
158	0.21
159	0.24
160	0.22
161	0.21
162	0.23
163	0.25
164	0.24
165	0.26
166	0.32
167	0.36
168	0.37
169	0.39
170	0.43
171	0.45
172	0.43
173	0.49
174	0.45
175	0.4
176	0.46
177	0.46
178	0.44
179	0.42
180	0.48
181	0.42
182	0.4
183	0.39
184	0.32
185	0.33
186	0.29
187	0.28
188	0.21
189	0.18
190	0.16
191	0.14
192	0.13
193	0.1
194	0.1
195	0.08
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.13
200	0.16
201	0.25
202	0.28
203	0.28
204	0.35
205	0.38
206	0.4
207	0.4
208	0.48
209	0.44
210	0.48
211	0.53
212	0.49
213	0.52
214	0.49
215	0.44
216	0.35
217	0.29
218	0.22
219	0.2
220	0.16
221	0.09
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.05
227	0.03
228	0.02
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.05
233	0.07
234	0.08
235	0.11
236	0.13
237	0.13
238	0.18
239	0.2
240	0.24
241	0.25
242	0.27
243	0.25
244	0.28
245	0.27
246	0.23
247	0.25
248	0.25
249	0.27
250	0.3
251	0.3
252	0.31
253	0.35
254	0.42
255	0.44
256	0.48
257	0.54
258	0.56
259	0.63
260	0.6
261	0.59
262	0.55
263	0.49
264	0.42
265	0.35
266	0.31
267	0.29
268	0.34
269	0.31
270	0.3
271	0.32
272	0.34
273	0.37
274	0.39
275	0.41
276	0.37
277	0.44
278	0.47
279	0.48
280	0.49
281	0.45
282	0.43
283	0.4
284	0.38
285	0.31
286	0.27
287	0.23
288	0.18
289	0.17
290	0.12
291	0.09
292	0.07
293	0.08
294	0.07
295	0.08
296	0.09
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.1
303	0.12
304	0.12
305	0.13
306	0.14
307	0.15
308	0.15
309	0.17
310	0.14
311	0.1
312	0.1
313	0.09
314	0.08
315	0.06
316	0.06
317	0.05
318	0.04
319	0.06
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.09
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.11
331	0.12
332	0.12
333	0.11
334	0.12
335	0.12
336	0.12
337	0.12
338	0.09
339	0.07
340	0.09
341	0.1
342	0.11
343	0.11
344	0.13
345	0.14
346	0.17
347	0.17
348	0.2
349	0.2
350	0.2
351	0.2
352	0.18
353	0.17
354	0.15
355	0.15
356	0.09
357	0.09
358	0.07
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.05
379	0.05
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.17
384	0.21
385	0.27
386	0.35
387	0.45
388	0.54
389	0.61
390	0.68
391	0.67
392	0.73
393	0.76
394	0.76
395	0.76
396	0.73
397	0.73
398	0.72
399	0.74
400	0.7
401	0.69
402	0.71
403	0.68
404	0.69
405	0.62
406	0.57
407	0.48
408	0.42
409	0.36
410	0.25
411	0.17
412	0.1
413	0.09
414	0.1
415	0.1
416	0.11
417	0.1
418	0.09
419	0.1
420	0.1
421	0.09
422	0.09
423	0.1
424	0.09
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.12
429	0.11
430	0.11
431	0.09
432	0.08
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.09
438	0.1
439	0.1
440	0.13
441	0.14
442	0.18
443	0.23
444	0.25
445	0.25
446	0.29
447	0.31
448	0.33
449	0.4
450	0.44
451	0.46
452	0.45
453	0.44
454	0.4
455	0.4
456	0.36
457	0.28
458	0.21
459	0.14
460	0.12
461	0.11
462	0.12
463	0.11
464	0.14
465	0.15
466	0.14
467	0.13
468	0.13
469	0.15
470	0.14
471	0.17
472	0.15
473	0.15
474	0.16
475	0.18
476	0.18
477	0.18
478	0.21
479	0.2
480	0.2
481	0.22
482	0.21
483	0.19
484	0.19
485	0.18
486	0.14
487	0.12
488	0.12
489	0.08
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.07
499	0.08
500	0.08
501	0.09
502	0.13
503	0.13
504	0.14
505	0.15
506	0.15
507	0.15
508	0.15
509	0.14
510	0.11
511	0.12
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.09
517	0.09
518	0.06
519	0.05
520	0.05
521	0.04
522	0.03
523	0.03
524	0.05
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.08
532	0.06
533	0.07
534	0.06
535	0.08
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.05
544	0.05
545	0.04
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.08
553	0.08
554	0.1
555	0.15
556	0.18
557	0.19
558	0.2
559	0.22
560	0.23
561	0.26
562	0.27
563	0.24
564	0.27
565	0.27
566	0.27
567	0.24
568	0.22
569	0.19
570	0.16
571	0.14
572	0.08
573	0.07
574	0.07
575	0.07
576	0.08
577	0.08
578	0.09
579	0.1
580	0.15
581	0.19
582	0.2
583	0.21
584	0.22
585	0.27
586	0.28
587	0.33
588	0.29
589	0.27
590	0.26
591	0.27
592	0.26
593	0.22
594	0.2
595	0.15
596	0.16
597	0.13
598	0.13
599	0.11
600	0.1
601	0.1
602	0.08
603	0.07
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.11
611	0.11
612	0.1
613	0.1
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.1
618	0.08
619	0.09
620	0.1
621	0.1
622	0.11
623	0.11
624	0.16
625	0.18
626	0.18
627	0.21
628	0.21
629	0.26
630	0.29
631	0.32
632	0.29
633	0.26
634	0.25
635	0.22
636	0.23
637	0.21
638	0.18
639	0.17
640	0.15
641	0.15
642	0.2
643	0.19
644	0.17
645	0.16
646	0.15
647	0.17
648	0.19
649	0.18
650	0.14
651	0.2
652	0.26
653	0.26
654	0.28
655	0.29
656	0.29
657	0.3
658	0.32
659	0.27
660	0.22
661	0.21
662	0.19
663	0.16
664	0.15
665	0.14
666	0.12
667	0.11
668	0.1
669	0.09
670	0.09
671	0.09
672	0.11
673	0.18
674	0.2
675	0.21
676	0.22
677	0.24
678	0.26
679	0.27
680	0.25
681	0.22
682	0.23
683	0.24
684	0.22
685	0.19
686	0.19
687	0.18
688	0.16
689	0.13
690	0.11
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.08
695	0.07
696	0.08
697	0.07
698	0.06
699	0.07
700	0.1
701	0.1
702	0.11
703	0.12
704	0.12
705	0.13
706	0.14
707	0.14
708	0.13
709	0.13
710	0.13
711	0.14
712	0.15
713	0.14
714	0.13
715	0.12
716	0.1
717	0.1
718	0.09
719	0.07
720	0.07
721	0.08
722	0.08
723	0.08
724	0.09
725	0.1
726	0.11
727	0.11
728	0.11
729	0.1
730	0.1
731	0.11
732	0.13
733	0.14
734	0.15
735	0.18
736	0.19
737	0.26
738	0.3
739	0.31
740	0.3
741	0.28
742	0.26
743	0.26
744	0.27
745	0.2
746	0.19
747	0.17
748	0.18
749	0.16
750	0.17
751	0.16
752	0.17
753	0.17
754	0.15
755	0.16
756	0.14
757	0.18
758	0.2
759	0.19
760	0.17
761	0.18
762	0.19
763	0.21
764	0.3
765	0.37
766	0.4
767	0.48
768	0.55
769	0.61
770	0.7
771	0.77
772	0.79
773	0.78
774	0.82
775	0.83
776	0.79
777	0.79
778	0.71
779	0.67
780	0.6
781	0.52
782	0.45
783	0.36
784	0.3
785	0.25
786	0.25
787	0.2
788	0.17
789	0.17
790	0.14
791	0.13
792	0.14
793	0.15
794	0.14
795	0.15
796	0.14
797	0.15
798	0.16
799	0.16
800	0.16
801	0.15
802	0.13
803	0.12
804	0.13
805	0.13
806	0.12
807	0.13
808	0.12
809	0.14
810	0.14
811	0.14
812	0.13
813	0.12
814	0.13
815	0.14
816	0.16
817	0.2
818	0.21
819	0.24
820	0.27
821	0.28
822	0.27
823	0.25
824	0.21
825	0.17
826	0.17
827	0.16
828	0.15
829	0.19
830	0.23
831	0.23
832	0.28
833	0.28
834	0.36
835	0.38
836	0.38
837	0.37
838	0.36
839	0.41
840	0.4
841	0.48
842	0.4
843	0.37
844	0.39
845	0.43
846	0.46
847	0.43
848	0.42
849	0.34
850	0.37
851	0.4
852	0.37
853	0.33
854	0.32
855	0.31
856	0.31
857	0.3
858	0.27
859	0.24
860	0.24
861	0.23
862	0.21
863	0.22
864	0.26
865	0.33
866	0.4
867	0.45
868	0.53
869	0.59
870	0.64
871	0.71
872	0.71
873	0.71
874	0.67
875	0.62
876	0.55
877	0.57
878	0.54
879	0.52
880	0.51
881	0.45
882	0.45
883	0.46
884	0.45
885	0.35
886	0.33
887	0.34
888	0.32
889	0.34
890	0.31
891	0.3
892	0.29
893	0.33
894	0.34
895	0.32
896	0.32
897	0.31
898	0.35
899	0.4
900	0.43
901	0.46
902	0.46
903	0.45
904	0.42
905	0.4
906	0.38
907	0.34
908	0.34
909	0.28
910	0.24
911	0.19
912	0.21
913	0.19
914	0.18
915	0.15
916	0.13
917	0.13
918	0.16
919	0.18
920	0.22
921	0.24
922	0.27
923	0.32
924	0.33
925	0.33
926	0.39
927	0.47
928	0.5
929	0.53
930	0.51
931	0.52
932	0.54
933	0.53
934	0.48
935	0.42
936	0.36
937	0.32
938	0.32
939	0.27
940	0.23
941	0.22
942	0.21
943	0.2
944	0.21
945	0.2
946	0.21
947	0.21
948	0.23
949	0.26
950	0.24
951	0.27
952	0.25
953	0.26
954	0.35
955	0.4
956	0.4
957	0.42
958	0.44
959	0.39
960	0.38
961	0.41
962	0.33
963	0.28
964	0.29
965	0.24
966	0.22
967	0.21
968	0.21
969	0.19
970	0.18
971	0.18
972	0.2

S9X4Q7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer