Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JEJ4

Protein Details
Accession N1JEJ4    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-111SDSDSKAKSKKSNLKVKSKSKTKITSDKQESSHydrophilic
159-186ESEPKSKKPSDKDTKKLNGNKQKPTKSDHydrophilic
231-254ASKESKTKSKKSEDKKANKSKSVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-100AKSKKSNLKVKSKSK
236-249KTKSKKSEDKKANK
294-312KEDKKEDKKTGKATKKDAK
554-598DRGASGGRGGGGGRGRGGFGDRGGRGGRGGSRGGPRGGRGGSTNR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKTKSSKADGKSKSESKSKALSVKNASIAKSSQTTVAKSKKIAKDVASKVNNKTSKKSKATIVSKKDTTESSTDSGSDSDSDSKAKSKKSNLKVKSKSKTKITSDKQESSDSSDSEDDSDSEAEVSTKKEALVSKSKPNGAVKKNEDSGSDSQSSDSESEPKSKKPSDKDTKKLNGNKQKPTKSDSSDSESDSDSGSESSSSQSVSKTQPKKPIDKSHVTKVQDVVSGSASKESKTKSKKSEDKKANKSKSVDTENKEKQTDSSEDSSSADDSGASESTETDDDESDSESDKKEDKKEDKKTGKATKKDAKASKEDDSDSEESESDSDVSSTGEKSETEAPSKKRKADNEVSAPAKKAKSDGGDSDSKNLFVGNLSWNVDDEWLYREFEEFGEITRANVLTDKASGRSKGFGYVEFSSAESAAAALKAKKGALIDGREANVDFSTPRDASAPKDRAQGRAQKFGDTMNEPSDTLFCGNLSFTADENMVGEAFGAHATVVNVRLPTDMDSGNPKGFGYVTFASVDDAKTAYEAMLGAEIGGRAVRLDYATPKPDRGASGGRGGGGGRGRGGFGDRGGRGGRGGSRGGPRGGRGGSTNRGGFGDFKGQKKTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.7
3 0.68
4 0.63
5 0.64
6 0.63
7 0.62
8 0.61
9 0.62
10 0.61
11 0.62
12 0.64
13 0.59
14 0.54
15 0.49
16 0.44
17 0.4
18 0.35
19 0.31
20 0.3
21 0.3
22 0.33
23 0.39
24 0.45
25 0.46
26 0.48
27 0.57
28 0.57
29 0.6
30 0.62
31 0.59
32 0.61
33 0.64
34 0.69
35 0.67
36 0.66
37 0.65
38 0.69
39 0.7
40 0.64
41 0.65
42 0.65
43 0.67
44 0.69
45 0.68
46 0.66
47 0.7
48 0.76
49 0.77
50 0.77
51 0.75
52 0.71
53 0.68
54 0.63
55 0.54
56 0.48
57 0.42
58 0.38
59 0.31
60 0.29
61 0.27
62 0.25
63 0.23
64 0.2
65 0.16
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.17
70 0.17
71 0.24
72 0.28
73 0.34
74 0.39
75 0.46
76 0.55
77 0.64
78 0.73
79 0.75
80 0.82
81 0.85
82 0.88
83 0.88
84 0.87
85 0.85
86 0.84
87 0.85
88 0.82
89 0.83
90 0.81
91 0.81
92 0.8
93 0.79
94 0.72
95 0.67
96 0.6
97 0.56
98 0.51
99 0.4
100 0.35
101 0.29
102 0.26
103 0.23
104 0.23
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.14
118 0.17
119 0.22
120 0.31
121 0.34
122 0.41
123 0.46
124 0.49
125 0.51
126 0.56
127 0.59
128 0.56
129 0.61
130 0.58
131 0.59
132 0.6
133 0.56
134 0.5
135 0.46
136 0.43
137 0.38
138 0.35
139 0.28
140 0.24
141 0.23
142 0.23
143 0.19
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.24
148 0.26
149 0.3
150 0.36
151 0.41
152 0.47
153 0.5
154 0.6
155 0.63
156 0.71
157 0.75
158 0.78
159 0.8
160 0.82
161 0.83
162 0.82
163 0.82
164 0.8
165 0.82
166 0.81
167 0.81
168 0.75
169 0.72
170 0.69
171 0.63
172 0.61
173 0.55
174 0.53
175 0.47
176 0.45
177 0.41
178 0.35
179 0.29
180 0.23
181 0.19
182 0.12
183 0.1
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.13
193 0.18
194 0.28
195 0.34
196 0.39
197 0.48
198 0.53
199 0.61
200 0.66
201 0.71
202 0.69
203 0.72
204 0.71
205 0.71
206 0.73
207 0.66
208 0.6
209 0.51
210 0.45
211 0.38
212 0.33
213 0.25
214 0.19
215 0.17
216 0.15
217 0.17
218 0.15
219 0.13
220 0.16
221 0.17
222 0.24
223 0.31
224 0.39
225 0.43
226 0.53
227 0.62
228 0.67
229 0.75
230 0.78
231 0.81
232 0.84
233 0.86
234 0.83
235 0.8
236 0.75
237 0.69
238 0.66
239 0.64
240 0.6
241 0.53
242 0.56
243 0.56
244 0.57
245 0.52
246 0.45
247 0.38
248 0.35
249 0.34
250 0.28
251 0.25
252 0.21
253 0.21
254 0.22
255 0.21
256 0.17
257 0.14
258 0.1
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.12
280 0.15
281 0.19
282 0.27
283 0.34
284 0.43
285 0.52
286 0.61
287 0.65
288 0.67
289 0.72
290 0.74
291 0.74
292 0.7
293 0.69
294 0.67
295 0.66
296 0.69
297 0.65
298 0.59
299 0.57
300 0.55
301 0.51
302 0.46
303 0.4
304 0.32
305 0.32
306 0.29
307 0.24
308 0.2
309 0.16
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.07
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.08
324 0.13
325 0.14
326 0.18
327 0.23
328 0.27
329 0.37
330 0.41
331 0.45
332 0.45
333 0.48
334 0.53
335 0.56
336 0.59
337 0.56
338 0.58
339 0.55
340 0.51
341 0.48
342 0.43
343 0.35
344 0.27
345 0.22
346 0.2
347 0.19
348 0.21
349 0.22
350 0.23
351 0.28
352 0.28
353 0.32
354 0.29
355 0.26
356 0.23
357 0.2
358 0.15
359 0.1
360 0.11
361 0.09
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.1
377 0.11
378 0.09
379 0.08
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.12
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.08
389 0.1
390 0.11
391 0.13
392 0.15
393 0.17
394 0.17
395 0.19
396 0.19
397 0.22
398 0.22
399 0.2
400 0.23
401 0.22
402 0.23
403 0.2
404 0.2
405 0.15
406 0.15
407 0.13
408 0.08
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.11
418 0.11
419 0.14
420 0.18
421 0.2
422 0.23
423 0.24
424 0.25
425 0.24
426 0.24
427 0.21
428 0.16
429 0.13
430 0.1
431 0.09
432 0.13
433 0.12
434 0.12
435 0.14
436 0.15
437 0.19
438 0.29
439 0.33
440 0.31
441 0.38
442 0.39
443 0.42
444 0.48
445 0.53
446 0.48
447 0.53
448 0.51
449 0.46
450 0.45
451 0.42
452 0.4
453 0.34
454 0.31
455 0.24
456 0.24
457 0.21
458 0.21
459 0.2
460 0.16
461 0.14
462 0.12
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.09
467 0.1
468 0.1
469 0.09
470 0.11
471 0.11
472 0.1
473 0.11
474 0.11
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.05
485 0.07
486 0.08
487 0.09
488 0.1
489 0.1
490 0.11
491 0.11
492 0.14
493 0.15
494 0.14
495 0.14
496 0.2
497 0.23
498 0.23
499 0.23
500 0.2
501 0.17
502 0.17
503 0.16
504 0.17
505 0.15
506 0.16
507 0.16
508 0.16
509 0.17
510 0.18
511 0.17
512 0.12
513 0.11
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.06
532 0.07
533 0.09
534 0.15
535 0.21
536 0.28
537 0.3
538 0.32
539 0.33
540 0.35
541 0.35
542 0.35
543 0.35
544 0.31
545 0.36
546 0.35
547 0.33
548 0.31
549 0.28
550 0.27
551 0.23
552 0.21
553 0.16
554 0.15
555 0.15
556 0.16
557 0.18
558 0.16
559 0.16
560 0.23
561 0.21
562 0.24
563 0.25
564 0.25
565 0.23
566 0.25
567 0.26
568 0.22
569 0.24
570 0.26
571 0.32
572 0.36
573 0.4
574 0.39
575 0.37
576 0.4
577 0.39
578 0.35
579 0.33
580 0.35
581 0.37
582 0.41
583 0.4
584 0.35
585 0.35
586 0.34
587 0.31
588 0.29
589 0.33
590 0.33
591 0.36