Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JC29

Protein Details
Accession N1JC29    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
923-946DAENLWKRPVPRWRRCTRCTAVSEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 3, plas 3, mito 1, pero 1, golg 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021665  Mediator_Med16  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF11635  Med16  
Amino Acid Sequences MIFQGTQEARSTVQDELFGDGGALNMTPGVLTEELHQRIDELRTGGCCQQIAWSKSGSIASVASDGYTLEIRHLRSHPEDGTWGLSRSNASNFNSSQDGGPIRHLVWSPTGSELAVIDSVGRVTILAMFASLNKLNIVKSCHIDSVEDLQTVVGSYWLPLAAYPPGRPTFLNGPAIKEGSSYRYEASQAPVMGPCHPNHNKSAFIFVTTNGLLKLLWPQSNGKWGDVHTELESIVSSDDLITHAAICPDKSQSPHGILMIAFATASKQLRTARALIDWNIPKTEKLPASLNTLNPTIRTRHLAVANWASKSPSNLSSNTDQDLSMTQLSYLEFLPPVTDSNAKLTSPIILTIRSYIPESDSHFNSEVHTVFDQWEVREKPQSLNPAFEQLGLQQSTTGTVPNTISVLEKIQSYLVDKIIIGLEVINLGKIIFLAYSDGSVEYRERTNFNETFNDNDINKVWHLSQIGYVYAEEEPCMTPPNSFTSLTKKVLQVVLSPTTASLIYLNNHGKLKWNQLKHNHTDISDNAERAIYAARIAALSILCSTAVMRNSNYDDLLALAVRYLSPQLAYDWLIELARILKLQADYSDDSHHDLLVRNITIQLCLSIQSSLGFRGDFKPRDFGGKNAWIILQLRNIVVLTTMAANLVIPGSSPNEKLLPLEDPEIITALTGSVRWVLDLLAWLIDSLLSLPRTIPSNINLTEASKLSLPQLEAHLYSSKDNSLHLLLASTTRGFLTAICRRLQHLDYIAVKAIIVPSASSGNHTPISDPLRTAYREIAALTSSATVRLEIILTLLHSVSSTIRNINANHTSPQGTPVSTEKVRNLLEIKMLFGGPFPEIFKAVIAELYMEDGLLETLREDIDEGQLFFCDFGILELDENEMSISKRRHMNMTIDCFKKQWIQNPQEKLTDNLGSIDGSVIDLDAENLWKRPVPRWRRCTRCTAVSEEISMQRQSLQWLVLQQRRCFCSGYWCILGPGETVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.21
4 0.2
5 0.17
6 0.15
7 0.13
8 0.12
9 0.1
10 0.09
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.04
15 0.04
16 0.08
17 0.07
18 0.08
19 0.12
20 0.21
21 0.24
22 0.25
23 0.24
24 0.22
25 0.26
26 0.28
27 0.27
28 0.21
29 0.21
30 0.23
31 0.26
32 0.28
33 0.27
34 0.24
35 0.21
36 0.27
37 0.34
38 0.34
39 0.33
40 0.32
41 0.3
42 0.33
43 0.33
44 0.26
45 0.18
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.11
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.09
56 0.12
57 0.16
58 0.18
59 0.24
60 0.26
61 0.31
62 0.34
63 0.4
64 0.37
65 0.36
66 0.36
67 0.32
68 0.35
69 0.31
70 0.28
71 0.22
72 0.22
73 0.21
74 0.21
75 0.25
76 0.26
77 0.26
78 0.31
79 0.32
80 0.33
81 0.34
82 0.32
83 0.28
84 0.26
85 0.26
86 0.22
87 0.24
88 0.23
89 0.21
90 0.24
91 0.24
92 0.21
93 0.23
94 0.23
95 0.21
96 0.21
97 0.21
98 0.17
99 0.17
100 0.15
101 0.12
102 0.11
103 0.09
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.04
110 0.04
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.11
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.14
123 0.17
124 0.22
125 0.22
126 0.25
127 0.27
128 0.29
129 0.28
130 0.28
131 0.27
132 0.29
133 0.28
134 0.24
135 0.21
136 0.18
137 0.18
138 0.17
139 0.14
140 0.08
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.08
148 0.12
149 0.14
150 0.15
151 0.2
152 0.22
153 0.24
154 0.24
155 0.27
156 0.29
157 0.33
158 0.4
159 0.35
160 0.38
161 0.39
162 0.4
163 0.34
164 0.29
165 0.24
166 0.2
167 0.22
168 0.19
169 0.17
170 0.18
171 0.2
172 0.2
173 0.23
174 0.22
175 0.2
176 0.2
177 0.23
178 0.22
179 0.24
180 0.26
181 0.22
182 0.28
183 0.33
184 0.34
185 0.37
186 0.4
187 0.4
188 0.37
189 0.44
190 0.34
191 0.32
192 0.3
193 0.25
194 0.26
195 0.22
196 0.21
197 0.15
198 0.15
199 0.11
200 0.1
201 0.17
202 0.17
203 0.18
204 0.2
205 0.23
206 0.25
207 0.34
208 0.34
209 0.29
210 0.26
211 0.25
212 0.28
213 0.27
214 0.27
215 0.19
216 0.19
217 0.17
218 0.16
219 0.15
220 0.1
221 0.08
222 0.06
223 0.05
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.13
236 0.15
237 0.17
238 0.21
239 0.23
240 0.26
241 0.27
242 0.26
243 0.24
244 0.21
245 0.2
246 0.16
247 0.12
248 0.08
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.12
255 0.15
256 0.19
257 0.22
258 0.24
259 0.22
260 0.25
261 0.27
262 0.25
263 0.31
264 0.31
265 0.3
266 0.3
267 0.29
268 0.26
269 0.24
270 0.29
271 0.22
272 0.22
273 0.25
274 0.24
275 0.31
276 0.34
277 0.34
278 0.3
279 0.3
280 0.28
281 0.25
282 0.25
283 0.21
284 0.2
285 0.23
286 0.22
287 0.26
288 0.29
289 0.29
290 0.31
291 0.37
292 0.37
293 0.34
294 0.31
295 0.28
296 0.25
297 0.26
298 0.24
299 0.21
300 0.22
301 0.22
302 0.26
303 0.29
304 0.3
305 0.29
306 0.27
307 0.21
308 0.19
309 0.18
310 0.16
311 0.13
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.09
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.09
325 0.11
326 0.11
327 0.15
328 0.17
329 0.16
330 0.16
331 0.15
332 0.15
333 0.13
334 0.15
335 0.11
336 0.1
337 0.11
338 0.12
339 0.13
340 0.12
341 0.13
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.18
346 0.19
347 0.2
348 0.22
349 0.22
350 0.22
351 0.22
352 0.22
353 0.18
354 0.16
355 0.15
356 0.13
357 0.12
358 0.14
359 0.14
360 0.12
361 0.2
362 0.19
363 0.2
364 0.25
365 0.26
366 0.26
367 0.29
368 0.37
369 0.31
370 0.32
371 0.31
372 0.3
373 0.29
374 0.27
375 0.23
376 0.15
377 0.18
378 0.15
379 0.14
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.06
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.09
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.03
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.06
427 0.06
428 0.07
429 0.09
430 0.1
431 0.11
432 0.14
433 0.2
434 0.21
435 0.22
436 0.25
437 0.24
438 0.26
439 0.27
440 0.27
441 0.2
442 0.2
443 0.18
444 0.16
445 0.15
446 0.13
447 0.11
448 0.1
449 0.11
450 0.1
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.08
458 0.08
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.09
467 0.13
468 0.15
469 0.15
470 0.16
471 0.21
472 0.26
473 0.28
474 0.3
475 0.26
476 0.26
477 0.26
478 0.26
479 0.21
480 0.19
481 0.18
482 0.16
483 0.15
484 0.13
485 0.12
486 0.11
487 0.09
488 0.07
489 0.06
490 0.07
491 0.12
492 0.13
493 0.15
494 0.16
495 0.15
496 0.2
497 0.22
498 0.31
499 0.33
500 0.37
501 0.41
502 0.5
503 0.56
504 0.55
505 0.59
506 0.5
507 0.44
508 0.42
509 0.36
510 0.35
511 0.29
512 0.24
513 0.19
514 0.17
515 0.16
516 0.14
517 0.14
518 0.06
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.04
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.04
530 0.04
531 0.05
532 0.07
533 0.09
534 0.1
535 0.1
536 0.12
537 0.14
538 0.15
539 0.15
540 0.12
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.07
545 0.05
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.05
554 0.05
555 0.07
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.09
560 0.08
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.05
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.08
571 0.11
572 0.12
573 0.13
574 0.15
575 0.14
576 0.16
577 0.16
578 0.15
579 0.13
580 0.12
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.11
585 0.13
586 0.12
587 0.12
588 0.11
589 0.1
590 0.07
591 0.08
592 0.09
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.08
597 0.08
598 0.09
599 0.08
600 0.08
601 0.13
602 0.2
603 0.22
604 0.23
605 0.27
606 0.26
607 0.34
608 0.34
609 0.32
610 0.32
611 0.34
612 0.33
613 0.29
614 0.29
615 0.23
616 0.24
617 0.23
618 0.19
619 0.14
620 0.13
621 0.13
622 0.13
623 0.11
624 0.1
625 0.08
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.03
635 0.03
636 0.04
637 0.07
638 0.08
639 0.09
640 0.11
641 0.12
642 0.12
643 0.12
644 0.13
645 0.13
646 0.13
647 0.14
648 0.14
649 0.13
650 0.13
651 0.13
652 0.11
653 0.08
654 0.07
655 0.05
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.07
666 0.07
667 0.05
668 0.05
669 0.05
670 0.05
671 0.05
672 0.04
673 0.04
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.09
679 0.12
680 0.14
681 0.15
682 0.15
683 0.2
684 0.21
685 0.23
686 0.22
687 0.2
688 0.21
689 0.19
690 0.18
691 0.13
692 0.12
693 0.12
694 0.13
695 0.13
696 0.12
697 0.14
698 0.15
699 0.15
700 0.17
701 0.19
702 0.17
703 0.18
704 0.18
705 0.17
706 0.16
707 0.16
708 0.16
709 0.14
710 0.14
711 0.12
712 0.12
713 0.1
714 0.11
715 0.12
716 0.09
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.08
721 0.08
722 0.15
723 0.21
724 0.24
725 0.25
726 0.26
727 0.28
728 0.33
729 0.33
730 0.29
731 0.26
732 0.29
733 0.29
734 0.3
735 0.29
736 0.24
737 0.22
738 0.19
739 0.16
740 0.1
741 0.08
742 0.06
743 0.07
744 0.09
745 0.09
746 0.12
747 0.12
748 0.15
749 0.17
750 0.17
751 0.17
752 0.2
753 0.24
754 0.23
755 0.22
756 0.21
757 0.24
758 0.25
759 0.26
760 0.23
761 0.2
762 0.2
763 0.2
764 0.18
765 0.14
766 0.13
767 0.11
768 0.11
769 0.09
770 0.09
771 0.09
772 0.08
773 0.08
774 0.08
775 0.08
776 0.06
777 0.07
778 0.06
779 0.06
780 0.07
781 0.07
782 0.06
783 0.06
784 0.07
785 0.08
786 0.11
787 0.12
788 0.13
789 0.16
790 0.2
791 0.21
792 0.27
793 0.32
794 0.31
795 0.32
796 0.33
797 0.33
798 0.29
799 0.32
800 0.27
801 0.21
802 0.21
803 0.22
804 0.27
805 0.27
806 0.3
807 0.28
808 0.33
809 0.33
810 0.34
811 0.33
812 0.28
813 0.3
814 0.28
815 0.27
816 0.22
817 0.21
818 0.18
819 0.16
820 0.16
821 0.11
822 0.12
823 0.12
824 0.11
825 0.12
826 0.12
827 0.12
828 0.12
829 0.11
830 0.1
831 0.09
832 0.09
833 0.08
834 0.09
835 0.08
836 0.07
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.04
843 0.05
844 0.05
845 0.05
846 0.06
847 0.07
848 0.11
849 0.13
850 0.14
851 0.13
852 0.14
853 0.14
854 0.13
855 0.12
856 0.08
857 0.06
858 0.06
859 0.08
860 0.08
861 0.08
862 0.08
863 0.1
864 0.09
865 0.09
866 0.09
867 0.08
868 0.09
869 0.15
870 0.17
871 0.22
872 0.29
873 0.32
874 0.38
875 0.42
876 0.5
877 0.52
878 0.6
879 0.63
880 0.59
881 0.58
882 0.52
883 0.5
884 0.49
885 0.45
886 0.45
887 0.47
888 0.54
889 0.61
890 0.68
891 0.7
892 0.68
893 0.64
894 0.59
895 0.53
896 0.47
897 0.39
898 0.32
899 0.28
900 0.21
901 0.2
902 0.16
903 0.11
904 0.08
905 0.08
906 0.06
907 0.05
908 0.05
909 0.06
910 0.06
911 0.09
912 0.11
913 0.12
914 0.14
915 0.17
916 0.19
917 0.27
918 0.37
919 0.45
920 0.55
921 0.64
922 0.73
923 0.8
924 0.83
925 0.85
926 0.83
927 0.81
928 0.75
929 0.72
930 0.69
931 0.61
932 0.58
933 0.52
934 0.49
935 0.43
936 0.38
937 0.31
938 0.26
939 0.24
940 0.25
941 0.23
942 0.2
943 0.18
944 0.25
945 0.34
946 0.38
947 0.44
948 0.46
949 0.51
950 0.54
951 0.53
952 0.49
953 0.41
954 0.45
955 0.45
956 0.46
957 0.42
958 0.39
959 0.38
960 0.37
961 0.37