Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JFX6

Protein Details
Accession N1JFX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-104GPSLEKKKLVYERLREQKRRFEAEMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR033133  PUM-HD  
IPR033712  Pumilio_RNA-bd  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
CDD cd07920  Pumilio  
Amino Acid Sequences MSYSNNNSNQIDELRFHKQQSPRSDTTLLGGMASPSRNGPSLHQDNRIVSMRRFTADSLCAPSIASITSQRGGQDAQDYGPSLEKKKLVYERLREQKRRFEAEMQLLDIQQRREEQELAQMQEDLGRSSGTSRQSHQSEPTTPEYRESSSGFPSAFSRPNRYSASSLTSPPGLYNRPTRSGSQITSPQSNNLQPRLVMDEKPPSTSVLGSRSNSDEDDKAEAVRQDPTSHRSTNAPQVRPFQLHCKLQVKLSVLHAQWFAPQNALSISLIIGALRCTKIRVKPALDSSNAQSLVNPCNFISMRHLSSILSNARLMCQIPQTSFNLAYINYINSLNRYSMPVTKSRSGLHEISLDQTNTTRFLFGEDDATTSGGINNYLQMNATEDNFPILVRREDFPGLLSASSAALDLALSQSPGPEPSGWSTLVNRHRPSLSQQNVSINRTRPNGSTTSAKHKTNEATPRSRQSYRHSLDLKYQQTFVVPQENASQVTSPIKNSLNTPTKLTSTFTNNDVQGTRASTNGSSTPNNVSISHAQQYLHNHNASLGRIPPGAVSNRLNREGKTNESVGLRDGQNGGYQSIQSGLHASAPPFGPILTPMSQPPANTPLSPTSQQTYPAQQPFYNMQMLMSGIQNMNMGQTLYSNPYPYSSTQTYITPRVPSQTSPRDNQARVIQQRRQNDGEGNLESLGGEIYTICKDQHGCRYLQKKLEERNPDEVHQIWLETNKHVIELMTDPFGNYLCQKLLEYCNDNERTVLIENASRDLVRIALNQHGTRALQKMIEHITTQGQIETIIAALRYRVVELIQDLNGNHVIQKCLNKLTSHDAQFIFDAVGKHCVDVGTHRHGCCVLQRCIDHADGEQKAWLIRQISNNAYVLVQDPFGNYVVQYILDLNESIFTEPLVAMFKGRVGQLSKQKFSSNVIEKCLRCAQEASKDSLIEEMLQPSELDRLLRDSFANYVIQTALDYANLSMKTRLIEAIRPHLPAIRSTPYGRRIQAKIQGNEGRNTSNNGSTCPNDHNEPTQAPLRHQRGNSNVSSGVFMAPMSGPYLNNYGIPSPTGNNLHPSRPIQAAGPFPSSEQLASPQAGHQSYSYSYSNRPVHVSNDNENGNDVKNEIISDNWL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.38
4 0.43
5 0.46
6 0.51
7 0.59
8 0.63
9 0.59
10 0.62
11 0.61
12 0.54
13 0.5
14 0.46
15 0.36
16 0.27
17 0.23
18 0.19
19 0.19
20 0.2
21 0.17
22 0.14
23 0.16
24 0.18
25 0.19
26 0.22
27 0.29
28 0.38
29 0.43
30 0.48
31 0.5
32 0.5
33 0.54
34 0.58
35 0.52
36 0.44
37 0.45
38 0.41
39 0.39
40 0.39
41 0.35
42 0.33
43 0.32
44 0.34
45 0.33
46 0.31
47 0.29
48 0.27
49 0.26
50 0.21
51 0.17
52 0.16
53 0.13
54 0.16
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.2
60 0.2
61 0.21
62 0.19
63 0.18
64 0.19
65 0.2
66 0.19
67 0.25
68 0.26
69 0.24
70 0.28
71 0.3
72 0.29
73 0.37
74 0.44
75 0.48
76 0.54
77 0.6
78 0.66
79 0.74
80 0.82
81 0.83
82 0.82
83 0.82
84 0.82
85 0.8
86 0.75
87 0.71
88 0.69
89 0.68
90 0.64
91 0.57
92 0.5
93 0.43
94 0.42
95 0.39
96 0.32
97 0.25
98 0.26
99 0.26
100 0.27
101 0.29
102 0.25
103 0.31
104 0.35
105 0.34
106 0.32
107 0.29
108 0.26
109 0.27
110 0.27
111 0.18
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.12
116 0.18
117 0.21
118 0.24
119 0.26
120 0.34
121 0.38
122 0.41
123 0.45
124 0.47
125 0.45
126 0.48
127 0.52
128 0.48
129 0.45
130 0.45
131 0.42
132 0.39
133 0.37
134 0.34
135 0.3
136 0.28
137 0.3
138 0.26
139 0.24
140 0.24
141 0.25
142 0.3
143 0.31
144 0.36
145 0.36
146 0.42
147 0.45
148 0.46
149 0.44
150 0.41
151 0.44
152 0.39
153 0.38
154 0.35
155 0.32
156 0.28
157 0.26
158 0.28
159 0.24
160 0.25
161 0.32
162 0.35
163 0.39
164 0.42
165 0.42
166 0.45
167 0.47
168 0.45
169 0.43
170 0.45
171 0.44
172 0.48
173 0.46
174 0.43
175 0.42
176 0.46
177 0.45
178 0.4
179 0.38
180 0.31
181 0.33
182 0.36
183 0.34
184 0.3
185 0.29
186 0.35
187 0.34
188 0.37
189 0.35
190 0.29
191 0.28
192 0.27
193 0.26
194 0.23
195 0.28
196 0.26
197 0.28
198 0.29
199 0.3
200 0.29
201 0.29
202 0.24
203 0.21
204 0.23
205 0.21
206 0.19
207 0.2
208 0.2
209 0.18
210 0.21
211 0.2
212 0.2
213 0.23
214 0.28
215 0.3
216 0.31
217 0.31
218 0.31
219 0.35
220 0.41
221 0.47
222 0.47
223 0.45
224 0.5
225 0.53
226 0.51
227 0.49
228 0.48
229 0.47
230 0.46
231 0.49
232 0.49
233 0.45
234 0.45
235 0.47
236 0.42
237 0.37
238 0.38
239 0.37
240 0.32
241 0.34
242 0.32
243 0.27
244 0.28
245 0.29
246 0.24
247 0.19
248 0.19
249 0.17
250 0.16
251 0.18
252 0.13
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.12
264 0.18
265 0.23
266 0.31
267 0.37
268 0.39
269 0.44
270 0.52
271 0.54
272 0.51
273 0.48
274 0.43
275 0.43
276 0.39
277 0.33
278 0.27
279 0.24
280 0.27
281 0.26
282 0.24
283 0.17
284 0.22
285 0.22
286 0.21
287 0.25
288 0.24
289 0.24
290 0.24
291 0.25
292 0.2
293 0.21
294 0.26
295 0.22
296 0.18
297 0.18
298 0.17
299 0.17
300 0.18
301 0.18
302 0.14
303 0.16
304 0.17
305 0.17
306 0.2
307 0.21
308 0.23
309 0.23
310 0.21
311 0.18
312 0.16
313 0.16
314 0.14
315 0.13
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.12
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.19
326 0.21
327 0.25
328 0.3
329 0.32
330 0.34
331 0.33
332 0.34
333 0.35
334 0.33
335 0.29
336 0.27
337 0.24
338 0.24
339 0.25
340 0.22
341 0.17
342 0.17
343 0.16
344 0.15
345 0.14
346 0.12
347 0.09
348 0.11
349 0.13
350 0.12
351 0.14
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.11
357 0.09
358 0.1
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.12
379 0.13
380 0.15
381 0.16
382 0.16
383 0.15
384 0.15
385 0.14
386 0.12
387 0.11
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.1
407 0.13
408 0.13
409 0.14
410 0.15
411 0.21
412 0.29
413 0.35
414 0.33
415 0.34
416 0.34
417 0.34
418 0.38
419 0.41
420 0.39
421 0.35
422 0.36
423 0.42
424 0.45
425 0.46
426 0.46
427 0.38
428 0.37
429 0.36
430 0.36
431 0.29
432 0.28
433 0.28
434 0.26
435 0.29
436 0.27
437 0.35
438 0.38
439 0.38
440 0.36
441 0.38
442 0.38
443 0.39
444 0.45
445 0.42
446 0.44
447 0.46
448 0.52
449 0.54
450 0.55
451 0.51
452 0.5
453 0.54
454 0.49
455 0.53
456 0.49
457 0.45
458 0.48
459 0.53
460 0.49
461 0.4
462 0.38
463 0.3
464 0.28
465 0.28
466 0.22
467 0.2
468 0.16
469 0.16
470 0.18
471 0.19
472 0.19
473 0.17
474 0.16
475 0.11
476 0.15
477 0.14
478 0.12
479 0.15
480 0.15
481 0.16
482 0.17
483 0.25
484 0.28
485 0.28
486 0.31
487 0.29
488 0.29
489 0.29
490 0.29
491 0.23
492 0.21
493 0.22
494 0.21
495 0.23
496 0.21
497 0.22
498 0.21
499 0.19
500 0.15
501 0.15
502 0.13
503 0.1
504 0.11
505 0.1
506 0.11
507 0.12
508 0.14
509 0.12
510 0.14
511 0.15
512 0.17
513 0.18
514 0.17
515 0.17
516 0.17
517 0.19
518 0.19
519 0.18
520 0.16
521 0.18
522 0.23
523 0.25
524 0.26
525 0.24
526 0.22
527 0.22
528 0.23
529 0.21
530 0.18
531 0.14
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.1
536 0.11
537 0.11
538 0.13
539 0.15
540 0.19
541 0.22
542 0.26
543 0.26
544 0.24
545 0.29
546 0.28
547 0.28
548 0.26
549 0.24
550 0.22
551 0.21
552 0.21
553 0.17
554 0.18
555 0.15
556 0.13
557 0.13
558 0.11
559 0.11
560 0.12
561 0.11
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.08
566 0.08
567 0.06
568 0.07
569 0.07
570 0.08
571 0.09
572 0.09
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.09
577 0.09
578 0.07
579 0.07
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.1
584 0.14
585 0.14
586 0.14
587 0.15
588 0.17
589 0.16
590 0.16
591 0.17
592 0.17
593 0.19
594 0.2
595 0.2
596 0.18
597 0.18
598 0.2
599 0.2
600 0.22
601 0.24
602 0.26
603 0.27
604 0.24
605 0.26
606 0.26
607 0.26
608 0.23
609 0.17
610 0.14
611 0.12
612 0.12
613 0.11
614 0.09
615 0.07
616 0.06
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.04
624 0.05
625 0.06
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.1
630 0.11
631 0.13
632 0.14
633 0.19
634 0.17
635 0.18
636 0.19
637 0.22
638 0.24
639 0.26
640 0.27
641 0.22
642 0.21
643 0.23
644 0.23
645 0.22
646 0.27
647 0.33
648 0.35
649 0.36
650 0.42
651 0.45
652 0.45
653 0.46
654 0.44
655 0.43
656 0.46
657 0.51
658 0.5
659 0.5
660 0.55
661 0.57
662 0.53
663 0.46
664 0.41
665 0.37
666 0.35
667 0.29
668 0.24
669 0.19
670 0.16
671 0.14
672 0.12
673 0.09
674 0.04
675 0.04
676 0.03
677 0.04
678 0.05
679 0.06
680 0.06
681 0.07
682 0.09
683 0.13
684 0.22
685 0.24
686 0.25
687 0.32
688 0.39
689 0.43
690 0.47
691 0.5
692 0.48
693 0.53
694 0.59
695 0.61
696 0.58
697 0.63
698 0.59
699 0.54
700 0.49
701 0.42
702 0.36
703 0.27
704 0.23
705 0.15
706 0.17
707 0.17
708 0.15
709 0.16
710 0.14
711 0.14
712 0.14
713 0.13
714 0.1
715 0.11
716 0.11
717 0.11
718 0.1
719 0.1
720 0.1
721 0.11
722 0.1
723 0.08
724 0.08
725 0.08
726 0.09
727 0.09
728 0.12
729 0.15
730 0.19
731 0.22
732 0.22
733 0.3
734 0.31
735 0.31
736 0.28
737 0.24
738 0.22
739 0.19
740 0.18
741 0.12
742 0.12
743 0.12
744 0.13
745 0.14
746 0.11
747 0.11
748 0.1
749 0.1
750 0.09
751 0.11
752 0.11
753 0.15
754 0.19
755 0.19
756 0.19
757 0.2
758 0.19
759 0.2
760 0.21
761 0.17
762 0.16
763 0.16
764 0.19
765 0.2
766 0.21
767 0.19
768 0.17
769 0.18
770 0.17
771 0.17
772 0.14
773 0.11
774 0.1
775 0.09
776 0.08
777 0.06
778 0.05
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.06
783 0.06
784 0.06
785 0.07
786 0.06
787 0.07
788 0.09
789 0.12
790 0.11
791 0.12
792 0.12
793 0.14
794 0.14
795 0.13
796 0.14
797 0.13
798 0.14
799 0.16
800 0.21
801 0.21
802 0.24
803 0.27
804 0.25
805 0.27
806 0.32
807 0.36
808 0.34
809 0.37
810 0.33
811 0.32
812 0.31
813 0.28
814 0.22
815 0.17
816 0.16
817 0.12
818 0.16
819 0.15
820 0.15
821 0.15
822 0.15
823 0.13
824 0.16
825 0.21
826 0.25
827 0.3
828 0.3
829 0.3
830 0.31
831 0.31
832 0.34
833 0.36
834 0.31
835 0.32
836 0.32
837 0.34
838 0.37
839 0.37
840 0.31
841 0.25
842 0.27
843 0.22
844 0.23
845 0.21
846 0.18
847 0.18
848 0.17
849 0.18
850 0.14
851 0.17
852 0.22
853 0.27
854 0.28
855 0.31
856 0.31
857 0.28
858 0.25
859 0.22
860 0.18
861 0.13
862 0.12
863 0.09
864 0.09
865 0.1
866 0.11
867 0.1
868 0.08
869 0.09
870 0.08
871 0.08
872 0.08
873 0.07
874 0.07
875 0.08
876 0.08
877 0.07
878 0.08
879 0.09
880 0.09
881 0.08
882 0.07
883 0.08
884 0.07
885 0.08
886 0.09
887 0.09
888 0.09
889 0.09
890 0.1
891 0.12
892 0.12
893 0.15
894 0.16
895 0.23
896 0.32
897 0.4
898 0.43
899 0.43
900 0.45
901 0.43
902 0.44
903 0.47
904 0.47
905 0.42
906 0.45
907 0.5
908 0.48
909 0.52
910 0.53
911 0.45
912 0.37
913 0.38
914 0.37
915 0.4
916 0.43
917 0.43
918 0.39
919 0.38
920 0.36
921 0.33
922 0.29
923 0.2
924 0.18
925 0.14
926 0.12
927 0.12
928 0.12
929 0.11
930 0.13
931 0.12
932 0.11
933 0.1
934 0.14
935 0.15
936 0.16
937 0.16
938 0.16
939 0.17
940 0.18
941 0.19
942 0.14
943 0.14
944 0.13
945 0.12
946 0.11
947 0.11
948 0.09
949 0.08
950 0.09
951 0.08
952 0.12
953 0.13
954 0.14
955 0.14
956 0.15
957 0.16
958 0.16
959 0.19
960 0.17
961 0.22
962 0.25
963 0.32
964 0.34
965 0.34
966 0.34
967 0.35
968 0.34
969 0.31
970 0.33
971 0.3
972 0.31
973 0.33
974 0.4
975 0.43
976 0.48
977 0.5
978 0.51
979 0.5
980 0.54
981 0.59
982 0.61
983 0.57
984 0.59
985 0.63
986 0.59
987 0.58
988 0.53
989 0.48
990 0.4
991 0.43
992 0.37
993 0.35
994 0.33
995 0.32
996 0.33
997 0.31
998 0.33
999 0.33
1000 0.33
1001 0.32
1002 0.34
1003 0.36
1004 0.37
1005 0.36
1006 0.37
1007 0.4
1008 0.38
1009 0.39
1010 0.46
1011 0.47
1012 0.49
1013 0.51
1014 0.54
1015 0.55
1016 0.6
1017 0.56
1018 0.5
1019 0.46
1020 0.4
1021 0.38
1022 0.31
1023 0.24
1024 0.17
1025 0.15
1026 0.12
1027 0.1
1028 0.1
1029 0.11
1030 0.11
1031 0.11
1032 0.13
1033 0.17
1034 0.16
1035 0.17
1036 0.18
1037 0.18
1038 0.17
1039 0.19
1040 0.19
1041 0.17
1042 0.22
1043 0.26
1044 0.25
1045 0.32
1046 0.34
1047 0.36
1048 0.4
1049 0.41
1050 0.39
1051 0.37
1052 0.37
1053 0.32
1054 0.34
1055 0.36
1056 0.35
1057 0.35
1058 0.31
1059 0.29
1060 0.3
1061 0.28
1062 0.24
1063 0.19
1064 0.19
1065 0.19
1066 0.2
1067 0.2
1068 0.2
1069 0.25
1070 0.25
1071 0.25
1072 0.21
1073 0.21
1074 0.22
1075 0.26
1076 0.26
1077 0.23
1078 0.26
1079 0.34
1080 0.39
1081 0.38
1082 0.4
1083 0.38
1084 0.41
1085 0.46
1086 0.49
1087 0.46
1088 0.49
1089 0.48
1090 0.44
1091 0.44
1092 0.4
1093 0.33
1094 0.28
1095 0.22
1096 0.16
1097 0.15
1098 0.16
1099 0.14