Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JFT9

Protein Details
Accession N1JFT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-238QDPMAPPKFKHKKIPRGPPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-241PPKFKHKKIPRGPPSPPP
386-405REKARAERRREEERKLRQSR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12, cyto 9, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0060090  F:molecular adaptor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MTSIAIGLAQSLPSPRYTGEEEDIPLHAQQRGPRILGAGVLEESQLVLKKKPGPPPYGERNGWRPRGQEDFGDGGAFPEIFIAQYPLDMGKKSQGSSTALAVQVDAKGKVKYDAIARQGHNEKRIVHTSFKELIPLRQRADIGDINLDRPTQEEVATSTERTRDALAKLVNGAVAAQKPKNVNVSARKEPTYVRYTPANQMGDNTKKKDRIMKIVERQQDPMAPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRALMQQRLAEKEKAQKEEHLRMLAQKAREERAQVDSSRRNPRIRSRSNSYSDSQSSSGDDENEEVREREKARAERRREEERKLRQSRMGAERRVQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTQSSEGMFDSRLFNRTSGFDTGFNEDQAYDKPLFAAQDAISSIYRPRQSDDWDDDEEAADTELGKIQRNQRFGDALGKGTFKGSGDVEARDGPVQFEKDLGDVFNVDDFLNKVGEGSSSKRQFGLQTDDDRTTKRSRVEDEDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.18
4 0.22
5 0.26
6 0.27
7 0.29
8 0.3
9 0.3
10 0.31
11 0.28
12 0.25
13 0.23
14 0.21
15 0.21
16 0.24
17 0.31
18 0.33
19 0.33
20 0.32
21 0.31
22 0.29
23 0.28
24 0.25
25 0.18
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.13
33 0.14
34 0.15
35 0.2
36 0.29
37 0.36
38 0.45
39 0.52
40 0.54
41 0.59
42 0.66
43 0.7
44 0.71
45 0.68
46 0.65
47 0.67
48 0.7
49 0.7
50 0.66
51 0.59
52 0.54
53 0.58
54 0.54
55 0.46
56 0.42
57 0.38
58 0.34
59 0.32
60 0.26
61 0.19
62 0.18
63 0.15
64 0.09
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.1
74 0.12
75 0.12
76 0.13
77 0.18
78 0.21
79 0.21
80 0.23
81 0.24
82 0.26
83 0.27
84 0.29
85 0.26
86 0.24
87 0.24
88 0.22
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.18
97 0.18
98 0.18
99 0.23
100 0.27
101 0.31
102 0.38
103 0.38
104 0.43
105 0.51
106 0.52
107 0.5
108 0.48
109 0.44
110 0.43
111 0.49
112 0.45
113 0.42
114 0.4
115 0.42
116 0.42
117 0.4
118 0.4
119 0.35
120 0.38
121 0.41
122 0.44
123 0.39
124 0.38
125 0.38
126 0.33
127 0.37
128 0.32
129 0.25
130 0.27
131 0.25
132 0.23
133 0.23
134 0.22
135 0.17
136 0.16
137 0.17
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.12
142 0.17
143 0.18
144 0.18
145 0.16
146 0.17
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.17
151 0.17
152 0.22
153 0.21
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.17
158 0.13
159 0.13
160 0.09
161 0.11
162 0.13
163 0.13
164 0.16
165 0.18
166 0.2
167 0.24
168 0.25
169 0.29
170 0.35
171 0.42
172 0.47
173 0.49
174 0.49
175 0.45
176 0.45
177 0.44
178 0.41
179 0.34
180 0.3
181 0.31
182 0.32
183 0.36
184 0.41
185 0.36
186 0.3
187 0.31
188 0.35
189 0.38
190 0.41
191 0.4
192 0.38
193 0.4
194 0.42
195 0.49
196 0.47
197 0.48
198 0.52
199 0.57
200 0.6
201 0.65
202 0.69
203 0.62
204 0.6
205 0.51
206 0.46
207 0.38
208 0.38
209 0.35
210 0.3
211 0.29
212 0.38
213 0.46
214 0.46
215 0.56
216 0.57
217 0.63
218 0.7
219 0.81
220 0.8
221 0.79
222 0.79
223 0.78
224 0.76
225 0.71
226 0.65
227 0.56
228 0.52
229 0.48
230 0.49
231 0.49
232 0.49
233 0.47
234 0.48
235 0.5
236 0.45
237 0.42
238 0.42
239 0.41
240 0.39
241 0.36
242 0.34
243 0.32
244 0.32
245 0.3
246 0.28
247 0.21
248 0.16
249 0.18
250 0.19
251 0.27
252 0.3
253 0.38
254 0.42
255 0.47
256 0.52
257 0.49
258 0.49
259 0.42
260 0.41
261 0.37
262 0.4
263 0.37
264 0.37
265 0.39
266 0.35
267 0.32
268 0.32
269 0.28
270 0.19
271 0.17
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.15
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.11
286 0.12
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.16
301 0.25
302 0.3
303 0.32
304 0.33
305 0.32
306 0.38
307 0.41
308 0.41
309 0.34
310 0.33
311 0.32
312 0.36
313 0.38
314 0.32
315 0.3
316 0.35
317 0.38
318 0.39
319 0.36
320 0.37
321 0.41
322 0.46
323 0.46
324 0.4
325 0.35
326 0.33
327 0.37
328 0.34
329 0.29
330 0.26
331 0.26
332 0.27
333 0.28
334 0.27
335 0.24
336 0.26
337 0.28
338 0.26
339 0.3
340 0.34
341 0.4
342 0.48
343 0.51
344 0.5
345 0.52
346 0.61
347 0.64
348 0.66
349 0.66
350 0.65
351 0.68
352 0.7
353 0.68
354 0.6
355 0.55
356 0.48
357 0.44
358 0.36
359 0.28
360 0.23
361 0.21
362 0.2
363 0.14
364 0.13
365 0.11
366 0.11
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.1
371 0.14
372 0.16
373 0.19
374 0.26
375 0.33
376 0.42
377 0.51
378 0.58
379 0.62
380 0.68
381 0.74
382 0.72
383 0.73
384 0.73
385 0.75
386 0.78
387 0.76
388 0.73
389 0.67
390 0.66
391 0.65
392 0.65
393 0.62
394 0.56
395 0.53
396 0.54
397 0.51
398 0.49
399 0.41
400 0.32
401 0.33
402 0.37
403 0.37
404 0.37
405 0.35
406 0.39
407 0.4
408 0.41
409 0.34
410 0.27
411 0.24
412 0.19
413 0.19
414 0.16
415 0.14
416 0.12
417 0.14
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.14
424 0.15
425 0.14
426 0.17
427 0.17
428 0.17
429 0.18
430 0.2
431 0.21
432 0.23
433 0.21
434 0.18
435 0.18
436 0.2
437 0.22
438 0.22
439 0.22
440 0.21
441 0.23
442 0.28
443 0.27
444 0.25
445 0.22
446 0.18
447 0.18
448 0.17
449 0.19
450 0.14
451 0.13
452 0.13
453 0.14
454 0.15
455 0.14
456 0.15
457 0.11
458 0.13
459 0.13
460 0.15
461 0.14
462 0.14
463 0.16
464 0.19
465 0.23
466 0.22
467 0.25
468 0.28
469 0.33
470 0.4
471 0.44
472 0.43
473 0.42
474 0.42
475 0.39
476 0.35
477 0.3
478 0.22
479 0.16
480 0.11
481 0.08
482 0.07
483 0.11
484 0.11
485 0.14
486 0.19
487 0.28
488 0.34
489 0.38
490 0.4
491 0.4
492 0.41
493 0.4
494 0.43
495 0.36
496 0.33
497 0.32
498 0.3
499 0.27
500 0.25
501 0.25
502 0.17
503 0.18
504 0.15
505 0.18
506 0.2
507 0.21
508 0.22
509 0.22
510 0.23
511 0.22
512 0.22
513 0.18
514 0.21
515 0.21
516 0.19
517 0.19
518 0.18
519 0.18
520 0.18
521 0.17
522 0.13
523 0.11
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.12
531 0.11
532 0.1
533 0.1
534 0.09
535 0.11
536 0.13
537 0.18
538 0.27
539 0.31
540 0.32
541 0.33
542 0.35
543 0.37
544 0.4
545 0.43
546 0.4
547 0.43
548 0.47
549 0.51
550 0.51
551 0.49
552 0.48
553 0.46
554 0.45
555 0.44
556 0.46
557 0.47