Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JDP2

Protein Details
Accession N1JDP2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-91AEAKSKRELKRRKLAEESRRQREERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-61KRR
66-102EAEAKSKRELKRRKLAEESRRQREEREAEEERATRKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR014906  PRP4-like  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF08799  PRP4  
Amino Acid Sequences MDFASLMANAIAVAKAPTVSDDQPKKFVKRSELEAERREKYLAEQRAIESEKAARALQKRRQEDLEAEAKSKRELKRRKLAEESRRQREEREAEEERATRKRLGLPEHEKEKAEEAATDDVTDEELFAGLRAIGQPAKLFGESHKQRLRRLSKLGTIVSTSIIPTTLELLGEEDMKVESVPKDSDGRKFLFRQLASYFTMVMTEWESALNNEKRDTFASKAAHTAMLQSKESMTPLFRKFEKADLDDGILEPIVEIVKAAQERRYVDANDGYLRLSIGKAAWPIGVTMVGIHERSAREKLHENDKGHVMGDEITRKFLQSIKRCLSFAQVRWPPDDIRQLMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.07
4 0.09
5 0.13
6 0.16
7 0.26
8 0.34
9 0.37
10 0.45
11 0.52
12 0.55
13 0.58
14 0.61
15 0.61
16 0.58
17 0.62
18 0.64
19 0.67
20 0.69
21 0.7
22 0.71
23 0.64
24 0.6
25 0.53
26 0.43
27 0.4
28 0.42
29 0.41
30 0.37
31 0.37
32 0.37
33 0.43
34 0.45
35 0.39
36 0.31
37 0.27
38 0.26
39 0.26
40 0.25
41 0.24
42 0.29
43 0.39
44 0.45
45 0.51
46 0.55
47 0.58
48 0.61
49 0.59
50 0.54
51 0.51
52 0.5
53 0.42
54 0.38
55 0.36
56 0.33
57 0.32
58 0.36
59 0.36
60 0.39
61 0.47
62 0.55
63 0.64
64 0.7
65 0.75
66 0.78
67 0.82
68 0.82
69 0.83
70 0.83
71 0.82
72 0.81
73 0.74
74 0.67
75 0.66
76 0.61
77 0.55
78 0.53
79 0.48
80 0.44
81 0.47
82 0.47
83 0.42
84 0.41
85 0.38
86 0.32
87 0.3
88 0.33
89 0.35
90 0.38
91 0.44
92 0.47
93 0.53
94 0.56
95 0.56
96 0.51
97 0.46
98 0.43
99 0.35
100 0.27
101 0.2
102 0.17
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.12
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.07
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.19
129 0.21
130 0.3
131 0.34
132 0.35
133 0.39
134 0.48
135 0.53
136 0.49
137 0.53
138 0.49
139 0.48
140 0.5
141 0.47
142 0.38
143 0.32
144 0.27
145 0.21
146 0.16
147 0.12
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.07
168 0.08
169 0.13
170 0.14
171 0.19
172 0.21
173 0.23
174 0.25
175 0.27
176 0.3
177 0.32
178 0.3
179 0.3
180 0.27
181 0.28
182 0.26
183 0.25
184 0.21
185 0.14
186 0.14
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.15
196 0.17
197 0.16
198 0.18
199 0.18
200 0.19
201 0.21
202 0.24
203 0.19
204 0.23
205 0.24
206 0.24
207 0.25
208 0.25
209 0.23
210 0.2
211 0.21
212 0.2
213 0.21
214 0.2
215 0.19
216 0.19
217 0.18
218 0.19
219 0.16
220 0.14
221 0.17
222 0.2
223 0.24
224 0.24
225 0.29
226 0.3
227 0.35
228 0.38
229 0.34
230 0.34
231 0.3
232 0.3
233 0.26
234 0.24
235 0.19
236 0.13
237 0.1
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.03
244 0.07
245 0.09
246 0.11
247 0.14
248 0.17
249 0.2
250 0.23
251 0.28
252 0.25
253 0.27
254 0.29
255 0.28
256 0.26
257 0.24
258 0.21
259 0.17
260 0.17
261 0.14
262 0.11
263 0.09
264 0.08
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.08
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.13
280 0.14
281 0.18
282 0.22
283 0.22
284 0.25
285 0.33
286 0.38
287 0.46
288 0.52
289 0.51
290 0.51
291 0.53
292 0.5
293 0.42
294 0.36
295 0.27
296 0.22
297 0.24
298 0.27
299 0.23
300 0.26
301 0.26
302 0.26
303 0.27
304 0.28
305 0.34
306 0.35
307 0.45
308 0.49
309 0.53
310 0.53
311 0.52
312 0.57
313 0.55
314 0.5
315 0.51
316 0.5
317 0.48
318 0.51
319 0.53
320 0.46
321 0.45
322 0.5