Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JDJ6

Protein Details
Accession N1JDJ6    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-38VVNKQTTQPSRKGKKAWRKNVDVTDIHHydrophilic
282-317MENFKLSSKRPQRKTQAQRNRIKRRKEAERKAKLALHydrophilic
407-435GKFESRRRISFAKKAKRKITEKWTHKDFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-26GKK
290-315KRPQRKTQAQRNRIKRRKEAERKAKL
408-425KFESRRRISFAKKAKRKI
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MSLTQKATKLHVVNKQTTQPSRKGKKAWRKNVDVTDIHIGLEQVRKELIHGGVITEKASEELFRVDTHGDNSVKKKFSSHIKTLKADEIIAQRSFTPVVSSKKRSSEKTSNGIIEPKRQRTHYVSHRELSRLRDIANGRSNNFIHEPTEVDFDIWKGEANRVENTLDDRFSFLEKKKKKVAPVTLSHEPITLVASGRHLPAISKPHGGYSYNPLVTEYTKCLEAIGNREVEAERARNAICEAERVQKEALAKSAAEAEKAEARANLLEWEEDSTWEGCDSDMENFKLSSKRPQRKTQAQRNRIKRRKEAERKAKLALTIKQKNSQVARIKELVKELENRDYDKQQDVVDHSSTDEDFELRRRKLGKVRLPEKNIELVLPDELQDCLRLLKPEGNLLRDRYRSMLMRGKFESRRRISFAKKAKRKITEKWTHKDFVLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.65
3 0.66
4 0.68
5 0.67
6 0.68
7 0.71
8 0.74
9 0.76
10 0.78
11 0.8
12 0.83
13 0.87
14 0.89
15 0.88
16 0.87
17 0.88
18 0.87
19 0.84
20 0.74
21 0.68
22 0.63
23 0.53
24 0.45
25 0.36
26 0.28
27 0.23
28 0.26
29 0.22
30 0.16
31 0.17
32 0.16
33 0.17
34 0.21
35 0.19
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.19
40 0.2
41 0.19
42 0.15
43 0.14
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.17
55 0.22
56 0.22
57 0.25
58 0.31
59 0.36
60 0.37
61 0.36
62 0.37
63 0.37
64 0.45
65 0.49
66 0.54
67 0.56
68 0.61
69 0.64
70 0.65
71 0.64
72 0.54
73 0.46
74 0.41
75 0.37
76 0.34
77 0.31
78 0.27
79 0.23
80 0.23
81 0.23
82 0.18
83 0.16
84 0.18
85 0.25
86 0.33
87 0.39
88 0.43
89 0.51
90 0.57
91 0.59
92 0.62
93 0.65
94 0.64
95 0.65
96 0.65
97 0.59
98 0.55
99 0.56
100 0.49
101 0.48
102 0.49
103 0.51
104 0.5
105 0.49
106 0.53
107 0.5
108 0.58
109 0.58
110 0.6
111 0.57
112 0.57
113 0.59
114 0.57
115 0.55
116 0.51
117 0.47
118 0.39
119 0.34
120 0.36
121 0.34
122 0.38
123 0.42
124 0.4
125 0.34
126 0.38
127 0.38
128 0.34
129 0.34
130 0.28
131 0.21
132 0.19
133 0.19
134 0.15
135 0.18
136 0.15
137 0.13
138 0.13
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.07
144 0.1
145 0.13
146 0.15
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.2
152 0.19
153 0.16
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.15
158 0.19
159 0.19
160 0.28
161 0.32
162 0.37
163 0.46
164 0.49
165 0.54
166 0.58
167 0.63
168 0.6
169 0.63
170 0.65
171 0.61
172 0.59
173 0.52
174 0.43
175 0.34
176 0.26
177 0.2
178 0.13
179 0.09
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.11
188 0.17
189 0.17
190 0.19
191 0.19
192 0.21
193 0.22
194 0.23
195 0.2
196 0.21
197 0.24
198 0.21
199 0.21
200 0.2
201 0.19
202 0.2
203 0.2
204 0.15
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.14
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.14
217 0.14
218 0.15
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.1
227 0.12
228 0.13
229 0.19
230 0.2
231 0.21
232 0.21
233 0.21
234 0.22
235 0.2
236 0.2
237 0.13
238 0.13
239 0.11
240 0.17
241 0.15
242 0.14
243 0.13
244 0.13
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.12
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.16
273 0.19
274 0.19
275 0.27
276 0.34
277 0.43
278 0.5
279 0.59
280 0.67
281 0.75
282 0.84
283 0.85
284 0.86
285 0.86
286 0.89
287 0.9
288 0.92
289 0.89
290 0.87
291 0.85
292 0.83
293 0.84
294 0.86
295 0.86
296 0.86
297 0.87
298 0.82
299 0.77
300 0.7
301 0.63
302 0.58
303 0.53
304 0.53
305 0.52
306 0.51
307 0.54
308 0.54
309 0.56
310 0.53
311 0.55
312 0.53
313 0.48
314 0.5
315 0.49
316 0.49
317 0.44
318 0.44
319 0.39
320 0.33
321 0.36
322 0.34
323 0.36
324 0.36
325 0.37
326 0.38
327 0.38
328 0.38
329 0.35
330 0.33
331 0.27
332 0.28
333 0.28
334 0.28
335 0.26
336 0.24
337 0.21
338 0.21
339 0.2
340 0.17
341 0.14
342 0.11
343 0.11
344 0.19
345 0.26
346 0.25
347 0.31
348 0.32
349 0.39
350 0.47
351 0.56
352 0.57
353 0.6
354 0.69
355 0.73
356 0.77
357 0.75
358 0.69
359 0.64
360 0.55
361 0.45
362 0.37
363 0.28
364 0.25
365 0.2
366 0.17
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.14
374 0.15
375 0.17
376 0.22
377 0.23
378 0.31
379 0.35
380 0.37
381 0.39
382 0.43
383 0.48
384 0.46
385 0.46
386 0.41
387 0.42
388 0.4
389 0.43
390 0.46
391 0.42
392 0.46
393 0.48
394 0.54
395 0.57
396 0.61
397 0.65
398 0.63
399 0.67
400 0.67
401 0.71
402 0.71
403 0.73
404 0.76
405 0.76
406 0.79
407 0.82
408 0.85
409 0.86
410 0.86
411 0.86
412 0.86
413 0.86
414 0.86
415 0.86
416 0.84
417 0.77