Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JME4

Protein Details
Accession N1JME4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
460-482EAIDKVPTKKEQKKKVEAKVNEAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQQQQPYLAPPQGSGSPSLSDASSGTQPLFSSFANKRPRLSPNNSQPSSPYASQSPYTHPPSAQSTHSPHFANVSIPPQAYTTPYSNGHNNPSINISQVHTTNQNGHQHSSAHPTNKNSFSQQPSFNSNYTMGSGTMGPPSKPVEKPKEESIDVMDVLGGTGVNLREEEQYTFQLYNESFNSMVTGSHSGTISSSYSFTQFPPSDEASFYGAGPANAIGEIDTKSQDEYIQKAADKAWRDAARNLHVSRQRELDNPFLHVHLVHAKLRKMASEHGIELNTDNKGMMGIMTRPHAFSERDMKVQTAVGPDGILVTTNGNFLPYDSMLVDQLALLSIATKYRLQGLVEDAIKLARGRRTGAHGSIPQEWADVVVPYNYEGSTNAGEDSVRFGWESAVSPYPNPLKRKITNEVILALRRQAVKEREAEETRLRKRLARTTGVNPISRQASVAPGTPGSVAPEAIDKVPTKKEQKKKVEAKVNEAASHAAANVTTAQFLGGGGGLFGKKKKYSWMNPAPGGGASSSKRIGAQGSPNTGGISNAPVERLTVDGARRLGTWREDREKGAGVQLRDWITVLEQDGHEKKALQIAYMNLDNSDPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.24
4 0.22
5 0.23
6 0.23
7 0.19
8 0.16
9 0.15
10 0.16
11 0.16
12 0.16
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.18
18 0.15
19 0.2
20 0.23
21 0.31
22 0.4
23 0.42
24 0.44
25 0.49
26 0.58
27 0.6
28 0.65
29 0.68
30 0.69
31 0.77
32 0.74
33 0.68
34 0.61
35 0.57
36 0.55
37 0.46
38 0.38
39 0.31
40 0.33
41 0.37
42 0.37
43 0.38
44 0.39
45 0.44
46 0.43
47 0.4
48 0.41
49 0.43
50 0.44
51 0.41
52 0.4
53 0.4
54 0.41
55 0.46
56 0.43
57 0.37
58 0.36
59 0.33
60 0.29
61 0.25
62 0.25
63 0.24
64 0.23
65 0.23
66 0.21
67 0.21
68 0.22
69 0.23
70 0.22
71 0.23
72 0.25
73 0.28
74 0.33
75 0.36
76 0.39
77 0.41
78 0.38
79 0.35
80 0.37
81 0.33
82 0.29
83 0.27
84 0.23
85 0.2
86 0.21
87 0.23
88 0.21
89 0.23
90 0.27
91 0.32
92 0.38
93 0.37
94 0.38
95 0.37
96 0.36
97 0.37
98 0.39
99 0.38
100 0.36
101 0.38
102 0.41
103 0.46
104 0.49
105 0.5
106 0.47
107 0.48
108 0.49
109 0.51
110 0.5
111 0.47
112 0.49
113 0.5
114 0.46
115 0.41
116 0.35
117 0.3
118 0.26
119 0.23
120 0.17
121 0.14
122 0.14
123 0.12
124 0.16
125 0.16
126 0.14
127 0.15
128 0.19
129 0.24
130 0.27
131 0.36
132 0.41
133 0.46
134 0.5
135 0.56
136 0.58
137 0.54
138 0.5
139 0.45
140 0.37
141 0.31
142 0.26
143 0.18
144 0.12
145 0.11
146 0.09
147 0.06
148 0.03
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.09
155 0.11
156 0.13
157 0.13
158 0.15
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.17
163 0.16
164 0.17
165 0.16
166 0.16
167 0.14
168 0.13
169 0.14
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.11
181 0.09
182 0.1
183 0.09
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.18
188 0.18
189 0.18
190 0.22
191 0.24
192 0.23
193 0.23
194 0.24
195 0.19
196 0.19
197 0.17
198 0.15
199 0.13
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.2
223 0.21
224 0.21
225 0.25
226 0.26
227 0.28
228 0.31
229 0.34
230 0.35
231 0.38
232 0.37
233 0.36
234 0.38
235 0.39
236 0.37
237 0.35
238 0.33
239 0.31
240 0.33
241 0.34
242 0.29
243 0.3
244 0.28
245 0.25
246 0.23
247 0.19
248 0.17
249 0.15
250 0.17
251 0.17
252 0.2
253 0.2
254 0.23
255 0.23
256 0.23
257 0.21
258 0.2
259 0.21
260 0.2
261 0.2
262 0.19
263 0.19
264 0.18
265 0.16
266 0.15
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.04
275 0.05
276 0.06
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.21
285 0.21
286 0.23
287 0.23
288 0.23
289 0.21
290 0.21
291 0.19
292 0.12
293 0.11
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.04
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.14
332 0.17
333 0.17
334 0.17
335 0.14
336 0.12
337 0.13
338 0.12
339 0.13
340 0.11
341 0.12
342 0.14
343 0.15
344 0.22
345 0.25
346 0.26
347 0.28
348 0.28
349 0.3
350 0.3
351 0.3
352 0.23
353 0.2
354 0.18
355 0.14
356 0.11
357 0.09
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.11
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.12
381 0.1
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.18
386 0.24
387 0.29
388 0.31
389 0.35
390 0.4
391 0.45
392 0.51
393 0.54
394 0.54
395 0.52
396 0.5
397 0.47
398 0.42
399 0.38
400 0.32
401 0.27
402 0.23
403 0.19
404 0.19
405 0.23
406 0.24
407 0.26
408 0.3
409 0.32
410 0.36
411 0.37
412 0.4
413 0.41
414 0.46
415 0.47
416 0.49
417 0.47
418 0.45
419 0.49
420 0.54
421 0.53
422 0.51
423 0.52
424 0.51
425 0.59
426 0.59
427 0.55
428 0.47
429 0.43
430 0.38
431 0.33
432 0.28
433 0.19
434 0.19
435 0.18
436 0.19
437 0.16
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.15
442 0.13
443 0.12
444 0.1
445 0.09
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.15
450 0.13
451 0.17
452 0.22
453 0.29
454 0.37
455 0.46
456 0.55
457 0.63
458 0.72
459 0.79
460 0.83
461 0.86
462 0.87
463 0.81
464 0.79
465 0.76
466 0.68
467 0.59
468 0.5
469 0.4
470 0.3
471 0.27
472 0.19
473 0.11
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.05
485 0.04
486 0.04
487 0.06
488 0.07
489 0.09
490 0.11
491 0.16
492 0.17
493 0.19
494 0.28
495 0.37
496 0.45
497 0.54
498 0.63
499 0.67
500 0.67
501 0.67
502 0.59
503 0.49
504 0.41
505 0.31
506 0.25
507 0.18
508 0.19
509 0.19
510 0.18
511 0.19
512 0.19
513 0.21
514 0.21
515 0.29
516 0.32
517 0.36
518 0.37
519 0.37
520 0.36
521 0.34
522 0.29
523 0.21
524 0.17
525 0.15
526 0.14
527 0.14
528 0.13
529 0.14
530 0.14
531 0.14
532 0.13
533 0.15
534 0.16
535 0.2
536 0.21
537 0.21
538 0.22
539 0.24
540 0.26
541 0.3
542 0.37
543 0.41
544 0.48
545 0.5
546 0.52
547 0.53
548 0.52
549 0.46
550 0.47
551 0.43
552 0.36
553 0.35
554 0.38
555 0.36
556 0.32
557 0.31
558 0.23
559 0.19
560 0.2
561 0.2
562 0.18
563 0.16
564 0.24
565 0.27
566 0.28
567 0.28
568 0.27
569 0.26
570 0.29
571 0.29
572 0.22
573 0.23
574 0.24
575 0.29
576 0.3
577 0.29
578 0.23