FuNGI

N1JIH5

Protein Details

Accession

N1JIH5

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-48	QFIRRHRATDPLRPRKRPLKRPLPSQIGT	Hydrophilic
399-419	EVRKKFGKDVKKALKKRERNY	Basic
478-526	AAKNSDSSKKQNSRKRHGSPNLSESSGNESSRKKPKKKNQSQPHGSSII	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-41	HRATDPLRPRKRPLKRP
401-416	RKKFGKDVKKALKKRE
490-494	SRKRH
507-515	SSRKKPKKK

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSGQPNGATPKNEQPQFIRRHRATDPLRPRKRPLKRPLPSQIGTATKFPVAEATPLYPVNGLAPPRETTSIQNQAQALEANGGTTRRTTLPYRQIFRKKEVDPQNQNEFVRPVVLHRRDPQQPSGRESKDIEAGLDQPVDSKELEKQEIARAEKEKQRAIDMAQIAPAGNNPSALASKKVMHGRNEKTTQVYRLDKTEEEKKASDLRYEEALPWHIEDAENKNTWVGNYEAALSDINVAFVIKDGVFKMIPLEKWYKFTSKGQFKAYTIDEAEAKMSKKVKESRWVMKSNEQKEADRVNQESRKAMARLYTVKSESSTFKNSGKRETEDMDEIDFDGGELFQDDDELATVEPDKDEETKEAQERIKKEQLGANVFDQANEAEVDKEFIEEEKEAEVRKKFGKDVKKALKKRERNYIYDSDSDHPYSDASEDDTSDEEKVKEIDRRLEEENKSKTKTEQKVTSGAPKGTNPALGAAKNSDSSKKQNSRKRHGSPNLSESSGNESSRKKPKKKNQSQPHGSSIISSGSRQPNSNPTSDCDVAGEMSDEGKRRQRLKITMASGMSSGSRQASPGLQVTHPTAANSGPITTEEVIAALPVAGISIGNLMKSFGGRVGEDPVNQTKKADFIKLVRENAKFGPDKLLRPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.51
3	0.53
4	0.52
5	0.5
6	0.55
7	0.62
8	0.66
9	0.67
10	0.6
11	0.64
12	0.63
13	0.67
14	0.64
15	0.65
16	0.68
17	0.68
18	0.76
19	0.76
20	0.83
21	0.83
22	0.87
23	0.86
24	0.86
25	0.86
26	0.85
27	0.89
28	0.9
29	0.89
30	0.79
31	0.72
32	0.68
33	0.64
34	0.57
35	0.49
36	0.41
37	0.33
38	0.31
39	0.27
40	0.25
41	0.19
42	0.19
43	0.19
44	0.19
45	0.2
46	0.21
47	0.21
48	0.17
49	0.16
50	0.16
51	0.18
52	0.17
53	0.16
54	0.19
55	0.2
56	0.23
57	0.26
58	0.25
59	0.26
60	0.34
61	0.41
62	0.4
63	0.42
64	0.39
65	0.36
66	0.36
67	0.32
68	0.23
69	0.16
70	0.14
71	0.11
72	0.12
73	0.12
74	0.11
75	0.11
76	0.14
77	0.13
78	0.17
79	0.22
80	0.29
81	0.39
82	0.48
83	0.54
84	0.61
85	0.69
86	0.71
87	0.73
88	0.73
89	0.65
90	0.66
91	0.7
92	0.71
93	0.71
94	0.73
95	0.74
96	0.71
97	0.69
98	0.62
99	0.52
100	0.42
101	0.35
102	0.28
103	0.25
104	0.29
105	0.34
106	0.37
107	0.41
108	0.48
109	0.52
110	0.57
111	0.61
112	0.6
113	0.59
114	0.59
115	0.63
116	0.58
117	0.55
118	0.52
119	0.46
120	0.41
121	0.37
122	0.32
123	0.24
124	0.23
125	0.21
126	0.18
127	0.15
128	0.11
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.11
133	0.14
134	0.18
135	0.2
136	0.2
137	0.21
138	0.26
139	0.32
140	0.33
141	0.33
142	0.32
143	0.37
144	0.42
145	0.45
146	0.44
147	0.39
148	0.39
149	0.36
150	0.35
151	0.35
152	0.32
153	0.27
154	0.23
155	0.22
156	0.19
157	0.17
158	0.16
159	0.12
160	0.1
161	0.09
162	0.08
163	0.09
164	0.11
165	0.12
166	0.14
167	0.13
168	0.15
169	0.21
170	0.28
171	0.31
172	0.37
173	0.45
174	0.49
175	0.55
176	0.57
177	0.53
178	0.52
179	0.5
180	0.47
181	0.45
182	0.44
183	0.37
184	0.36
185	0.38
186	0.34
187	0.35
188	0.4
189	0.37
190	0.36
191	0.35
192	0.35
193	0.38
194	0.38
195	0.36
196	0.29
197	0.27
198	0.26
199	0.26
200	0.24
201	0.2
202	0.2
203	0.17
204	0.16
205	0.15
206	0.12
207	0.12
208	0.13
209	0.17
210	0.19
211	0.19
212	0.19
213	0.19
214	0.19
215	0.18
216	0.18
217	0.13
218	0.09
219	0.09
220	0.1
221	0.09
222	0.1
223	0.1
224	0.07
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.06
233	0.04
234	0.05
235	0.06
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.1
240	0.12
241	0.12
242	0.15
243	0.21
244	0.2
245	0.24
246	0.26
247	0.27
248	0.27
249	0.33
250	0.39
251	0.42
252	0.46
253	0.48
254	0.49
255	0.46
256	0.47
257	0.42
258	0.35
259	0.27
260	0.23
261	0.18
262	0.15
263	0.16
264	0.14
265	0.13
266	0.14
267	0.17
268	0.17
269	0.24
270	0.3
271	0.34
272	0.41
273	0.47
274	0.52
275	0.56
276	0.6
277	0.56
278	0.57
279	0.61
280	0.55
281	0.56
282	0.49
283	0.43
284	0.41
285	0.43
286	0.38
287	0.33
288	0.31
289	0.3
290	0.31
291	0.32
292	0.29
293	0.26
294	0.27
295	0.24
296	0.23
297	0.18
298	0.18
299	0.22
300	0.22
301	0.24
302	0.21
303	0.21
304	0.21
305	0.21
306	0.2
307	0.19
308	0.21
309	0.2
310	0.24
311	0.3
312	0.3
313	0.35
314	0.36
315	0.34
316	0.33
317	0.33
318	0.31
319	0.26
320	0.26
321	0.19
322	0.16
323	0.14
324	0.11
325	0.09
326	0.06
327	0.04
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.09
348	0.11
349	0.14
350	0.16
351	0.2
352	0.22
353	0.25
354	0.27
355	0.32
356	0.36
357	0.33
358	0.34
359	0.32
360	0.35
361	0.33
362	0.33
363	0.26
364	0.26
365	0.25
366	0.23
367	0.2
368	0.15
369	0.12
370	0.11
371	0.1
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.09
384	0.1
385	0.14
386	0.15
387	0.17
388	0.21
389	0.22
390	0.25
391	0.32
392	0.4
393	0.43
394	0.53
395	0.6
396	0.67
397	0.71
398	0.77
399	0.81
400	0.8
401	0.79
402	0.79
403	0.74
404	0.69
405	0.69
406	0.66
407	0.59
408	0.52
409	0.5
410	0.42
411	0.39
412	0.35
413	0.28
414	0.21
415	0.17
416	0.15
417	0.12
418	0.1
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.1
423	0.11
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.1
428	0.1
429	0.11
430	0.13
431	0.17
432	0.19
433	0.26
434	0.27
435	0.31
436	0.35
437	0.42
438	0.43
439	0.47
440	0.52
441	0.5
442	0.5
443	0.48
444	0.5
445	0.52
446	0.55
447	0.55
448	0.55
449	0.52
450	0.56
451	0.57
452	0.59
453	0.54
454	0.48
455	0.42
456	0.35
457	0.36
458	0.3
459	0.29
460	0.21
461	0.2
462	0.2
463	0.18
464	0.19
465	0.17
466	0.17
467	0.18
468	0.19
469	0.2
470	0.22
471	0.28
472	0.37
473	0.45
474	0.53
475	0.59
476	0.68
477	0.74
478	0.81
479	0.83
480	0.83
481	0.83
482	0.84
483	0.82
484	0.79
485	0.72
486	0.63
487	0.55
488	0.45
489	0.44
490	0.38
491	0.32
492	0.28
493	0.28
494	0.35
495	0.45
496	0.55
497	0.57
498	0.64
499	0.74
500	0.81
501	0.89
502	0.92
503	0.92
504	0.93
505	0.94
506	0.89
507	0.85
508	0.76
509	0.64
510	0.54
511	0.44
512	0.37
513	0.28
514	0.22
515	0.23
516	0.28
517	0.3
518	0.3
519	0.32
520	0.37
521	0.4
522	0.44
523	0.38
524	0.35
525	0.41
526	0.4
527	0.37
528	0.29
529	0.26
530	0.21
531	0.2
532	0.17
533	0.09
534	0.1
535	0.12
536	0.13
537	0.17
538	0.24
539	0.31
540	0.34
541	0.41
542	0.48
543	0.54
544	0.6
545	0.65
546	0.62
547	0.61
548	0.57
549	0.5
550	0.42
551	0.35
552	0.27
553	0.19
554	0.16
555	0.13
556	0.12
557	0.12
558	0.13
559	0.14
560	0.17
561	0.21
562	0.22
563	0.21
564	0.23
565	0.26
566	0.28
567	0.26
568	0.24
569	0.21
570	0.18
571	0.2
572	0.18
573	0.15
574	0.12
575	0.12
576	0.16
577	0.15
578	0.15
579	0.13
580	0.12
581	0.11
582	0.11
583	0.1
584	0.05
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.03
589	0.03
590	0.03
591	0.07
592	0.07
593	0.08
594	0.08
595	0.09
596	0.1
597	0.11
598	0.11
599	0.11
600	0.13
601	0.13
602	0.15
603	0.21
604	0.23
605	0.24
606	0.28
607	0.35
608	0.37
609	0.36
610	0.36
611	0.31
612	0.35
613	0.38
614	0.38
615	0.35
616	0.36
617	0.47
618	0.53
619	0.59
620	0.59
621	0.57
622	0.56
623	0.53
624	0.56
625	0.48
626	0.42
627	0.45
628	0.42

N1JIH5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer