Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1J514

Protein Details
Accession N1J514    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-186MEAEHKRRVKQKRMGKREGKFBasic
253-274QYSKGQSKSRSRGERRRARGDNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-185KRRVKQKRMGKREGK
259-286SKSRSRGERRRARGDNGRARGDRNSRTP
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MAGDGGSDDEGGDKSKSSGGQLRTKNEIPEVVIPRPDIVITQDMPIIELGVVEQIVDNVLLIKANTSGEYRVLESGSILCLPDRRVIGVVAETIGRVEQPFYSVLFTNSAEILALGISMGIKVFYSESHSTYVFTKSLKVFKGSDASNMNDEEVGEDEVEFSDDEMEAEHKRRVKQKRMGKREGKFQAKVGSTRNAHSLQQMSALNEKNSVQSISYDEDEPYKPLTRPIGYAEHVSQNEAPLDNAYTGDSERQYSKGQSKSRSRGERRRARGDNGRARGDRNSRTPKASLPTKEPYQQSYGQISAPRPQTSSMSHSHDDNIAMQNITPQFPFYPLPQSTSSSAQPPENLSHQIASQPHMQPHLQSHLQNHMQSHLQPHLQPHLQLWSQIFSQQGSQQPSPNTNQNWANLVQSLPTGGYVNPAFFTTQNGLSQPWKPPNHQDPSNSQGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.16
4 0.2
5 0.27
6 0.32
7 0.4
8 0.47
9 0.51
10 0.55
11 0.57
12 0.55
13 0.5
14 0.46
15 0.4
16 0.42
17 0.42
18 0.38
19 0.37
20 0.35
21 0.33
22 0.31
23 0.27
24 0.19
25 0.17
26 0.19
27 0.17
28 0.18
29 0.18
30 0.17
31 0.18
32 0.17
33 0.14
34 0.09
35 0.08
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.08
51 0.08
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.16
60 0.14
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.11
68 0.13
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.16
76 0.15
77 0.11
78 0.11
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.07
85 0.06
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.13
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.05
101 0.05
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.11
113 0.13
114 0.15
115 0.17
116 0.18
117 0.19
118 0.2
119 0.22
120 0.17
121 0.16
122 0.19
123 0.2
124 0.26
125 0.26
126 0.28
127 0.26
128 0.27
129 0.32
130 0.28
131 0.3
132 0.27
133 0.27
134 0.26
135 0.25
136 0.23
137 0.17
138 0.17
139 0.12
140 0.1
141 0.09
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.07
154 0.08
155 0.1
156 0.13
157 0.16
158 0.21
159 0.3
160 0.39
161 0.48
162 0.55
163 0.63
164 0.71
165 0.78
166 0.84
167 0.84
168 0.79
169 0.79
170 0.79
171 0.76
172 0.66
173 0.59
174 0.55
175 0.48
176 0.47
177 0.4
178 0.38
179 0.32
180 0.32
181 0.34
182 0.29
183 0.27
184 0.27
185 0.25
186 0.18
187 0.21
188 0.21
189 0.17
190 0.2
191 0.21
192 0.18
193 0.18
194 0.18
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.11
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.14
212 0.17
213 0.16
214 0.16
215 0.19
216 0.21
217 0.19
218 0.21
219 0.21
220 0.22
221 0.21
222 0.21
223 0.18
224 0.15
225 0.15
226 0.13
227 0.11
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.12
240 0.13
241 0.16
242 0.22
243 0.28
244 0.33
245 0.4
246 0.48
247 0.54
248 0.62
249 0.69
250 0.71
251 0.74
252 0.8
253 0.81
254 0.8
255 0.82
256 0.77
257 0.74
258 0.74
259 0.74
260 0.73
261 0.68
262 0.67
263 0.58
264 0.55
265 0.55
266 0.53
267 0.48
268 0.48
269 0.52
270 0.48
271 0.51
272 0.5
273 0.47
274 0.47
275 0.5
276 0.44
277 0.41
278 0.44
279 0.44
280 0.49
281 0.47
282 0.43
283 0.4
284 0.4
285 0.38
286 0.34
287 0.32
288 0.28
289 0.3
290 0.28
291 0.29
292 0.3
293 0.27
294 0.25
295 0.25
296 0.26
297 0.26
298 0.29
299 0.28
300 0.3
301 0.3
302 0.3
303 0.3
304 0.28
305 0.26
306 0.24
307 0.21
308 0.16
309 0.15
310 0.14
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.15
315 0.13
316 0.13
317 0.15
318 0.17
319 0.14
320 0.21
321 0.21
322 0.25
323 0.26
324 0.29
325 0.29
326 0.31
327 0.31
328 0.27
329 0.29
330 0.26
331 0.26
332 0.26
333 0.26
334 0.26
335 0.28
336 0.24
337 0.23
338 0.22
339 0.25
340 0.23
341 0.22
342 0.26
343 0.27
344 0.27
345 0.3
346 0.3
347 0.28
348 0.31
349 0.36
350 0.33
351 0.31
352 0.33
353 0.38
354 0.43
355 0.43
356 0.39
357 0.35
358 0.33
359 0.32
360 0.34
361 0.3
362 0.28
363 0.28
364 0.31
365 0.35
366 0.35
367 0.34
368 0.31
369 0.34
370 0.31
371 0.32
372 0.3
373 0.25
374 0.23
375 0.25
376 0.24
377 0.18
378 0.2
379 0.22
380 0.27
381 0.31
382 0.32
383 0.36
384 0.38
385 0.42
386 0.45
387 0.48
388 0.44
389 0.44
390 0.46
391 0.43
392 0.44
393 0.4
394 0.36
395 0.29
396 0.27
397 0.21
398 0.17
399 0.15
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.09
404 0.14
405 0.14
406 0.15
407 0.15
408 0.16
409 0.16
410 0.15
411 0.2
412 0.19
413 0.21
414 0.22
415 0.23
416 0.25
417 0.28
418 0.32
419 0.36
420 0.42
421 0.44
422 0.47
423 0.56
424 0.64
425 0.68
426 0.7
427 0.67
428 0.66