Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JDJ5

Protein Details
Accession N1JDJ5    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MDRWRKLHGRKLDHEERARKRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-30RKLHGRKLDHEERARKRAAREGHKAS
46-58NKRRLEKIQMKKQ
131-143KTGKKTAKKGWKR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 7, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MDRWRKLHGRKLDHEERARKRAAREGHKASDDAQKLTGLRAKLYQNKRRLEKIQMKKQIKAHEERNVKSAAPKEPSTTPLPQYLLDRSNPTNAKALSSAIKNKRAEKAAKFSVPLPKVRGIAEEEMFKVVKTGKKTAKKGWKRMITKPTFVGPDFTRRPVKYERFIRPMGLRYKKANVTHPELGVTVQLPIISVKKNPQNQMYTQLGVLTKGTIIEVNVSELGMVTAGGKVVWGRWAQITNNCENDGCVNAVLLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.83
3 0.82
4 0.79
5 0.77
6 0.72
7 0.66
8 0.65
9 0.66
10 0.65
11 0.66
12 0.67
13 0.67
14 0.65
15 0.62
16 0.56
17 0.55
18 0.48
19 0.4
20 0.33
21 0.28
22 0.26
23 0.29
24 0.3
25 0.21
26 0.2
27 0.24
28 0.3
29 0.37
30 0.47
31 0.53
32 0.57
33 0.65
34 0.7
35 0.73
36 0.7
37 0.71
38 0.72
39 0.74
40 0.76
41 0.78
42 0.76
43 0.74
44 0.75
45 0.73
46 0.69
47 0.66
48 0.63
49 0.61
50 0.65
51 0.6
52 0.58
53 0.51
54 0.44
55 0.41
56 0.38
57 0.35
58 0.32
59 0.32
60 0.32
61 0.32
62 0.36
63 0.36
64 0.35
65 0.3
66 0.29
67 0.3
68 0.27
69 0.28
70 0.28
71 0.26
72 0.24
73 0.26
74 0.23
75 0.29
76 0.29
77 0.28
78 0.29
79 0.26
80 0.26
81 0.23
82 0.23
83 0.19
84 0.21
85 0.28
86 0.28
87 0.36
88 0.37
89 0.4
90 0.43
91 0.46
92 0.48
93 0.44
94 0.46
95 0.44
96 0.43
97 0.4
98 0.38
99 0.41
100 0.38
101 0.35
102 0.31
103 0.28
104 0.28
105 0.27
106 0.26
107 0.21
108 0.21
109 0.19
110 0.17
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.12
115 0.1
116 0.1
117 0.12
118 0.14
119 0.21
120 0.28
121 0.36
122 0.41
123 0.49
124 0.57
125 0.63
126 0.7
127 0.72
128 0.74
129 0.71
130 0.75
131 0.77
132 0.71
133 0.64
134 0.57
135 0.51
136 0.44
137 0.39
138 0.34
139 0.25
140 0.29
141 0.28
142 0.31
143 0.35
144 0.32
145 0.37
146 0.41
147 0.46
148 0.46
149 0.53
150 0.56
151 0.55
152 0.56
153 0.55
154 0.5
155 0.5
156 0.51
157 0.49
158 0.45
159 0.43
160 0.48
161 0.51
162 0.51
163 0.53
164 0.49
165 0.5
166 0.5
167 0.46
168 0.41
169 0.35
170 0.32
171 0.24
172 0.18
173 0.11
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.09
179 0.1
180 0.12
181 0.18
182 0.26
183 0.32
184 0.37
185 0.43
186 0.45
187 0.46
188 0.51
189 0.48
190 0.41
191 0.35
192 0.33
193 0.26
194 0.22
195 0.2
196 0.14
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.06
211 0.06
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.1
220 0.1
221 0.12
222 0.16
223 0.2
224 0.24
225 0.31
226 0.35
227 0.37
228 0.4
229 0.4
230 0.36
231 0.33
232 0.31
233 0.26
234 0.23
235 0.17