FuNGI

N1J5C6

Protein Details

Accession

N1J5C6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
498-521	NRGRGKNSSLRKYLRKQGSRNVID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
499-513	RGRGKNSSLRKYLRK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012952 BING4_C_dom IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf IPR040315 WDR46/Utp7
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF08149 BING4CT
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MIATHGSQLGADEGVQRTTIAHSNGAVAVKPQKIFLSTPEDAAKVRKQREAEKLYGRGRKIPCMGIKDRKLRGNLKALEDKHKIATLQAKDAEILLENEAGFLQPENEMERTYKVRQDEIQAEVAVETAKKKFDLKLDALGPYVFDYTRNGRELLLAGRKGHIATMDWREGRLGCELQLGETIRDAKWLHNNQLFALAQKKYVYIYDRVGVEIHCLKKHIEVTNMEFLPYHYLLATAGNAGCLKYQDVSTGKIVVELPTRLGSPTSLTQNPQNAILHMGHQNGNVTLWSPNSTTPLVKLLAHRGPVRALGIDREGRYMVSTGQDLKMCVWDIRTFKEVNSYTLKQPGSSVAISDRGLTAVGWGTQTSIWRGLFQKSAAEQEKVRDPYMSWSGQGKRIERVRWCPFEDLLGVSHDHGFSSLIVPGSGEPNFDAYEVNPYENTKQRQDNEVRSLLNKLQPEMISLNPNIIGNLDISTAEQRKADKNLDKKEVDPIAMIKNRGRGKNSSLRKYLRKQGSRNVIDERRLRIEELRKNQNSKVQKRLAEKTDELGPALGRFVRKNNLT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.14
3	0.13
4	0.13
5	0.16
6	0.21
7	0.18
8	0.19
9	0.18
10	0.2
11	0.23
12	0.23
13	0.2
14	0.18
15	0.23
16	0.26
17	0.26
18	0.26
19	0.25
20	0.27
21	0.28
22	0.29
23	0.32
24	0.28
25	0.32
26	0.32
27	0.32
28	0.3
29	0.34
30	0.37
31	0.37
32	0.41
33	0.43
34	0.46
35	0.53
36	0.63
37	0.64
38	0.64
39	0.64
40	0.68
41	0.71
42	0.73
43	0.67
44	0.65
45	0.61
46	0.6
47	0.56
48	0.55
49	0.53
50	0.54
51	0.61
52	0.62
53	0.68
54	0.69
55	0.72
56	0.7
57	0.72
58	0.7
59	0.69
60	0.69
61	0.65
62	0.63
63	0.65
64	0.62
65	0.63
66	0.61
67	0.56
68	0.48
69	0.45
70	0.38
71	0.34
72	0.39
73	0.33
74	0.35
75	0.35
76	0.33
77	0.31
78	0.31
79	0.27
80	0.19
81	0.17
82	0.12
83	0.11
84	0.1
85	0.1
86	0.1
87	0.09
88	0.08
89	0.07
90	0.07
91	0.06
92	0.07
93	0.1
94	0.11
95	0.12
96	0.13
97	0.17
98	0.21
99	0.24
100	0.27
101	0.27
102	0.3
103	0.31
104	0.36
105	0.37
106	0.35
107	0.35
108	0.3
109	0.28
110	0.24
111	0.21
112	0.15
113	0.12
114	0.11
115	0.1
116	0.11
117	0.12
118	0.14
119	0.17
120	0.23
121	0.3
122	0.31
123	0.36
124	0.37
125	0.37
126	0.35
127	0.32
128	0.26
129	0.19
130	0.18
131	0.11
132	0.09
133	0.12
134	0.16
135	0.2
136	0.22
137	0.21
138	0.2
139	0.21
140	0.22
141	0.24
142	0.26
143	0.24
144	0.23
145	0.23
146	0.24
147	0.23
148	0.22
149	0.17
150	0.12
151	0.15
152	0.2
153	0.25
154	0.24
155	0.24
156	0.25
157	0.25
158	0.24
159	0.23
160	0.18
161	0.12
162	0.15
163	0.15
164	0.14
165	0.17
166	0.16
167	0.13
168	0.14
169	0.15
170	0.12
171	0.16
172	0.16
173	0.16
174	0.24
175	0.28
176	0.34
177	0.35
178	0.36
179	0.32
180	0.37
181	0.34
182	0.26
183	0.27
184	0.2
185	0.19
186	0.19
187	0.19
188	0.14
189	0.17
190	0.19
191	0.16
192	0.18
193	0.19
194	0.19
195	0.19
196	0.19
197	0.17
198	0.17
199	0.19
200	0.2
201	0.17
202	0.18
203	0.18
204	0.21
205	0.26
206	0.25
207	0.25
208	0.25
209	0.29
210	0.35
211	0.35
212	0.31
213	0.26
214	0.23
215	0.23
216	0.21
217	0.16
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.1
222	0.09
223	0.06
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.06
232	0.07
233	0.1
234	0.11
235	0.13
236	0.14
237	0.15
238	0.14
239	0.15
240	0.15
241	0.13
242	0.13
243	0.11
244	0.11
245	0.1
246	0.11
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.09
251	0.11
252	0.14
253	0.15
254	0.16
255	0.19
256	0.22
257	0.22
258	0.22
259	0.2
260	0.16
261	0.17
262	0.16
263	0.15
264	0.14
265	0.15
266	0.13
267	0.13
268	0.13
269	0.11
270	0.11
271	0.09
272	0.08
273	0.07
274	0.06
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.11
279	0.12
280	0.11
281	0.11
282	0.13
283	0.13
284	0.13
285	0.14
286	0.18
287	0.19
288	0.22
289	0.22
290	0.21
291	0.2
292	0.2
293	0.19
294	0.14
295	0.12
296	0.1
297	0.12
298	0.15
299	0.14
300	0.14
301	0.14
302	0.13
303	0.13
304	0.12
305	0.1
306	0.08
307	0.09
308	0.09
309	0.11
310	0.12
311	0.11
312	0.11
313	0.12
314	0.12
315	0.11
316	0.12
317	0.14
318	0.15
319	0.18
320	0.2
321	0.19
322	0.18
323	0.26
324	0.25
325	0.25
326	0.3
327	0.29
328	0.28
329	0.34
330	0.34
331	0.26
332	0.25
333	0.24
334	0.21
335	0.18
336	0.17
337	0.12
338	0.15
339	0.15
340	0.15
341	0.12
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.08
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.09
354	0.12
355	0.12
356	0.14
357	0.17
358	0.18
359	0.19
360	0.19
361	0.21
362	0.18
363	0.25
364	0.25
365	0.26
366	0.24
367	0.25
368	0.33
369	0.32
370	0.31
371	0.25
372	0.23
373	0.26
374	0.3
375	0.28
376	0.22
377	0.25
378	0.28
379	0.33
380	0.38
381	0.34
382	0.36
383	0.41
384	0.45
385	0.45
386	0.52
387	0.54
388	0.55
389	0.56
390	0.52
391	0.46
392	0.42
393	0.37
394	0.29
395	0.22
396	0.17
397	0.15
398	0.13
399	0.13
400	0.11
401	0.1
402	0.09
403	0.09
404	0.08
405	0.09
406	0.09
407	0.08
408	0.08
409	0.09
410	0.09
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.09
415	0.1
416	0.11
417	0.11
418	0.11
419	0.08
420	0.16
421	0.16
422	0.17
423	0.16
424	0.18
425	0.23
426	0.3
427	0.34
428	0.33
429	0.39
430	0.41
431	0.5
432	0.55
433	0.58
434	0.58
435	0.58
436	0.53
437	0.47
438	0.48
439	0.43
440	0.4
441	0.34
442	0.28
443	0.28
444	0.26
445	0.28
446	0.27
447	0.25
448	0.25
449	0.23
450	0.23
451	0.2
452	0.2
453	0.16
454	0.14
455	0.12
456	0.08
457	0.09
458	0.08
459	0.07
460	0.08
461	0.14
462	0.16
463	0.16
464	0.18
465	0.2
466	0.25
467	0.31
468	0.38
469	0.41
470	0.48
471	0.56
472	0.63
473	0.62
474	0.58
475	0.61
476	0.55
477	0.48
478	0.4
479	0.34
480	0.35
481	0.37
482	0.38
483	0.32
484	0.37
485	0.43
486	0.47
487	0.49
488	0.45
489	0.5
490	0.57
491	0.64
492	0.65
493	0.67
494	0.7
495	0.75
496	0.78
497	0.8
498	0.81
499	0.8
500	0.78
501	0.79
502	0.82
503	0.78
504	0.74
505	0.74
506	0.69
507	0.68
508	0.66
509	0.62
510	0.58
511	0.54
512	0.52
513	0.51
514	0.54
515	0.56
516	0.6
517	0.65
518	0.65
519	0.68
520	0.71
521	0.72
522	0.73
523	0.71
524	0.72
525	0.69
526	0.69
527	0.73
528	0.77
529	0.75
530	0.72
531	0.66
532	0.59
533	0.58
534	0.52
535	0.44
536	0.36
537	0.31
538	0.23
539	0.24
540	0.23
541	0.19
542	0.21
543	0.26

N1J5C6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer