Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RTC8

Protein Details
Accession F4RTC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-128SVTAGCPWPPKKKKKVLGIFRRSDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-118PKKKKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 11, cyto 10, mito 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR002241  Glyco_hydro_27  
IPR013780  Glyco_hydro_b  
IPR017853  Glycoside_hydrolase_SF  
IPR041233  Melibiase_C  
Gene Ontology GO:0052692  F:raffinose alpha-galactosidase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
KEGG mlr:MELLADRAFT_64941  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16499  Melibiase_2  
PF17801  Melibiase_C  
Amino Acid Sequences MPPGAPLPGQLPQPPNQKRPPLGFTSSQYCQWNDYGLKPQVDVLERTGLKDLGFKTFVIACEWNKGMDPEGKLIVDDKQFEGGLTGFGRFLQDKQMKFGLRIDSVTAGCPWPPKKKKKVLGIFRRSDENEKLGLNSKQLQKRKGDYPPLDPSRVENQFQQIASWGVTHLEYRPCLFVTAGAIQNPDLSKVTNDPYIQMKQSIQRSQKDIFLATGQWGVTDETRLETADTWRVNNPAKEDWQKIRQTINAMVALSHKSAPGHFNDLDAIDWNHRDLSPMEQATQVIFWAATKSPLLLTGDLNQDNPSILGFLKNKALIDINQDALGKSITFRRRYTNDNDVWAGELSDGSMVAMLINWKDEERELTLSLADVELTSANGFDVISGKDLGPSNTTQSKTKGMGKAVLRPVTDKLQAMTYLEPDGVGAVQFVNLEGGDKGGRLLVAIDYINSKLDDFSPSWCPNCLIAKIKVNDAPEVEIEFPITGLTNNIPMSYLVELDGFKPGSDNTLTYTGAHKQAAPDITQVSFFSASAPSGYQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.58
3 0.63
4 0.69
5 0.7
6 0.73
7 0.72
8 0.68
9 0.66
10 0.63
11 0.59
12 0.57
13 0.53
14 0.52
15 0.49
16 0.43
17 0.4
18 0.35
19 0.37
20 0.32
21 0.33
22 0.37
23 0.39
24 0.39
25 0.36
26 0.38
27 0.37
28 0.37
29 0.35
30 0.29
31 0.32
32 0.31
33 0.32
34 0.32
35 0.28
36 0.25
37 0.28
38 0.26
39 0.23
40 0.25
41 0.23
42 0.23
43 0.25
44 0.25
45 0.25
46 0.27
47 0.22
48 0.27
49 0.28
50 0.26
51 0.24
52 0.24
53 0.23
54 0.24
55 0.25
56 0.22
57 0.24
58 0.23
59 0.22
60 0.23
61 0.24
62 0.22
63 0.22
64 0.2
65 0.2
66 0.2
67 0.19
68 0.19
69 0.15
70 0.14
71 0.12
72 0.12
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.21
79 0.26
80 0.26
81 0.31
82 0.37
83 0.36
84 0.37
85 0.41
86 0.36
87 0.32
88 0.32
89 0.29
90 0.26
91 0.25
92 0.25
93 0.21
94 0.16
95 0.15
96 0.21
97 0.25
98 0.33
99 0.42
100 0.51
101 0.61
102 0.71
103 0.78
104 0.83
105 0.88
106 0.88
107 0.89
108 0.89
109 0.85
110 0.77
111 0.75
112 0.67
113 0.63
114 0.55
115 0.47
116 0.39
117 0.33
118 0.32
119 0.31
120 0.29
121 0.26
122 0.29
123 0.34
124 0.4
125 0.46
126 0.5
127 0.51
128 0.56
129 0.6
130 0.63
131 0.65
132 0.6
133 0.62
134 0.66
135 0.64
136 0.6
137 0.53
138 0.48
139 0.47
140 0.47
141 0.41
142 0.33
143 0.32
144 0.34
145 0.33
146 0.29
147 0.22
148 0.19
149 0.18
150 0.15
151 0.11
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.12
164 0.12
165 0.15
166 0.16
167 0.15
168 0.15
169 0.14
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.1
174 0.09
175 0.1
176 0.12
177 0.14
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.21
182 0.23
183 0.22
184 0.22
185 0.22
186 0.24
187 0.31
188 0.36
189 0.38
190 0.39
191 0.43
192 0.43
193 0.44
194 0.4
195 0.34
196 0.27
197 0.22
198 0.18
199 0.14
200 0.14
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.09
214 0.14
215 0.14
216 0.15
217 0.16
218 0.19
219 0.22
220 0.23
221 0.24
222 0.22
223 0.26
224 0.3
225 0.33
226 0.34
227 0.39
228 0.4
229 0.39
230 0.39
231 0.36
232 0.34
233 0.32
234 0.3
235 0.23
236 0.2
237 0.18
238 0.17
239 0.16
240 0.14
241 0.12
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.15
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.13
254 0.12
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.09
261 0.08
262 0.11
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.15
267 0.16
268 0.14
269 0.14
270 0.1
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.16
286 0.16
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.12
292 0.09
293 0.06
294 0.05
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.16
303 0.12
304 0.17
305 0.17
306 0.15
307 0.16
308 0.16
309 0.15
310 0.14
311 0.14
312 0.08
313 0.07
314 0.14
315 0.19
316 0.23
317 0.25
318 0.31
319 0.34
320 0.4
321 0.46
322 0.48
323 0.44
324 0.44
325 0.43
326 0.36
327 0.34
328 0.29
329 0.22
330 0.13
331 0.1
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.09
348 0.11
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.1
356 0.07
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.14
376 0.15
377 0.18
378 0.23
379 0.25
380 0.25
381 0.27
382 0.31
383 0.33
384 0.39
385 0.39
386 0.35
387 0.4
388 0.4
389 0.46
390 0.48
391 0.48
392 0.41
393 0.39
394 0.39
395 0.37
396 0.38
397 0.3
398 0.24
399 0.22
400 0.22
401 0.22
402 0.2
403 0.16
404 0.14
405 0.13
406 0.12
407 0.09
408 0.09
409 0.07
410 0.06
411 0.05
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.07
428 0.06
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.1
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.1
438 0.11
439 0.14
440 0.14
441 0.17
442 0.24
443 0.27
444 0.28
445 0.28
446 0.29
447 0.29
448 0.33
449 0.35
450 0.33
451 0.36
452 0.43
453 0.44
454 0.47
455 0.46
456 0.43
457 0.4
458 0.36
459 0.32
460 0.25
461 0.25
462 0.22
463 0.18
464 0.17
465 0.14
466 0.13
467 0.1
468 0.1
469 0.07
470 0.08
471 0.09
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.13
476 0.13
477 0.15
478 0.14
479 0.13
480 0.1
481 0.11
482 0.12
483 0.12
484 0.16
485 0.14
486 0.13
487 0.14
488 0.14
489 0.16
490 0.17
491 0.17
492 0.17
493 0.2
494 0.21
495 0.21
496 0.24
497 0.25
498 0.28
499 0.29
500 0.26
501 0.25
502 0.31
503 0.32
504 0.3
505 0.28
506 0.26
507 0.26
508 0.26
509 0.24
510 0.21
511 0.19
512 0.17
513 0.16
514 0.15
515 0.14