FuNGI

N1JD39

Protein Details

Accession

N1JD39

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
615-634	NNGPKSSRDRDNNEQRRNGR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
375-389	PHRIRRRSRSRSPAG

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 3, extr 3, mito 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006569 CID_dom IPR008942 ENTH_VHS IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51391 CID PS50102 RRM
CDD	cd16984 CID_Nrd1_like

Amino Acid Sequences

MSSAVAELESALQAMLGLKPPGVSGSRIASLTALCHANVQVSYVMRKSIKSLANVNAIKSESVLIQKIYTHFKKAPGTHKLGVLYVVDSVTRKWTEQAKRAGQAINSAAHDGTYAAGVHRVKELLPVLMNDIILTAPSDQKWSSGIDGTTKTTTPPGSPPPELSSRLGLSNASNTAPTAVSDTSAILAALANMARQSTAGPTTTPQYQSQDAPFNLPNAQNIPSAQQSANSNHNFLTPFQTPLSAPVPATSYTPQLNGPSNNTPSFSAQTNTFGNIQPVPQTISPPVSQPIVPAAGLDPSVQQQLLLIKALSDQGFSPDKIAGIIAAVGNGGSLPSSQAFIGQNQNPVGQNGQNVWAGKPGESCERDNFEAARSPHRIRRRSRSRSPAGWNTRDSPIRRRDEPSAEHERGSPLPRTDDRNRGRTRATEYRQRSPQRLAHSLSPTNQNNTINKWVSHDSTIPKGSIKVLSRTLFVGGVTGTEQELRQLFSRYGHVQTCVVNRDKRHAFVKMVSRADAVTAKDSMEKTRIPESSLRTRWGVGFGPRDCSDYATGVSIIPISKLTDADRKWMLSAEYGGSGGAAIESGMVVEEPDIEIGQGVSSKAISRRMQTDRGGNNGPKSSRDRDNNEQRRNGREPGKDEFGRDLRDDERKDRLPSISGPPSMPAVPPFGMLPPGFPFSLPTQPTGMPMYPPGYNFLGQQSAPTQPPPPGRN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.08
3	0.1
4	0.11
5	0.11
6	0.11
7	0.12
8	0.15
9	0.16
10	0.16
11	0.16
12	0.2
13	0.22
14	0.22
15	0.23
16	0.2
17	0.19
18	0.18
19	0.19
20	0.16
21	0.14
22	0.15
23	0.15
24	0.17
25	0.16
26	0.17
27	0.16
28	0.17
29	0.21
30	0.2
31	0.25
32	0.24
33	0.25
34	0.27
35	0.32
36	0.35
37	0.36
38	0.41
39	0.42
40	0.5
41	0.51
42	0.48
43	0.44
44	0.4
45	0.35
46	0.29
47	0.24
48	0.17
49	0.19
50	0.2
51	0.17
52	0.17
53	0.2
54	0.23
55	0.31
56	0.32
57	0.35
58	0.36
59	0.42
60	0.5
61	0.54
62	0.6
63	0.6
64	0.64
65	0.61
66	0.61
67	0.56
68	0.48
69	0.43
70	0.34
71	0.25
72	0.18
73	0.15
74	0.12
75	0.12
76	0.12
77	0.16
78	0.16
79	0.17
80	0.2
81	0.29
82	0.37
83	0.45
84	0.54
85	0.55
86	0.58
87	0.61
88	0.6
89	0.51
90	0.47
91	0.42
92	0.36
93	0.29
94	0.26
95	0.22
96	0.19
97	0.18
98	0.13
99	0.1
100	0.08
101	0.07
102	0.06
103	0.12
104	0.12
105	0.13
106	0.15
107	0.15
108	0.14
109	0.18
110	0.19
111	0.17
112	0.17
113	0.17
114	0.18
115	0.19
116	0.18
117	0.14
118	0.13
119	0.1
120	0.09
121	0.09
122	0.07
123	0.09
124	0.09
125	0.12
126	0.12
127	0.13
128	0.14
129	0.15
130	0.16
131	0.17
132	0.17
133	0.18
134	0.2
135	0.23
136	0.24
137	0.22
138	0.21
139	0.21
140	0.21
141	0.19
142	0.23
143	0.27
144	0.31
145	0.33
146	0.35
147	0.37
148	0.4
149	0.41
150	0.38
151	0.34
152	0.29
153	0.28
154	0.26
155	0.22
156	0.18
157	0.18
158	0.18
159	0.14
160	0.13
161	0.12
162	0.13
163	0.12
164	0.11
165	0.11
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.09
171	0.09
172	0.09
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.07
185	0.09
186	0.09
187	0.1
188	0.11
189	0.14
190	0.18
191	0.2
192	0.2
193	0.22
194	0.24
195	0.26
196	0.29
197	0.33
198	0.29
199	0.3
200	0.29
201	0.27
202	0.27
203	0.25
204	0.23
205	0.19
206	0.2
207	0.17
208	0.17
209	0.18
210	0.16
211	0.18
212	0.17
213	0.17
214	0.19
215	0.21
216	0.29
217	0.27
218	0.26
219	0.24
220	0.26
221	0.25
222	0.22
223	0.25
224	0.18
225	0.19
226	0.19
227	0.2
228	0.18
229	0.2
230	0.21
231	0.16
232	0.15
233	0.13
234	0.15
235	0.14
236	0.16
237	0.14
238	0.14
239	0.14
240	0.15
241	0.16
242	0.16
243	0.19
244	0.19
245	0.22
246	0.25
247	0.27
248	0.27
249	0.27
250	0.26
251	0.24
252	0.25
253	0.21
254	0.18
255	0.15
256	0.18
257	0.17
258	0.18
259	0.17
260	0.16
261	0.16
262	0.15
263	0.15
264	0.13
265	0.13
266	0.14
267	0.12
268	0.13
269	0.13
270	0.15
271	0.15
272	0.15
273	0.16
274	0.14
275	0.14
276	0.13
277	0.13
278	0.11
279	0.11
280	0.09
281	0.08
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.06
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.06
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.06
296	0.07
297	0.09
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.1
302	0.12
303	0.12
304	0.13
305	0.11
306	0.11
307	0.1
308	0.1
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.04
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.02
320	0.02
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.04
325	0.07
326	0.07
327	0.09
328	0.15
329	0.16
330	0.18
331	0.18
332	0.2
333	0.18
334	0.18
335	0.17
336	0.12
337	0.12
338	0.1
339	0.12
340	0.12
341	0.12
342	0.12
343	0.14
344	0.13
345	0.13
346	0.13
347	0.12
348	0.16
349	0.19
350	0.2
351	0.2
352	0.23
353	0.23
354	0.24
355	0.23
356	0.18
357	0.21
358	0.2
359	0.23
360	0.24
361	0.26
362	0.31
363	0.39
364	0.46
365	0.47
366	0.57
367	0.63
368	0.68
369	0.75
370	0.78
371	0.77
372	0.76
373	0.77
374	0.76
375	0.73
376	0.68
377	0.61
378	0.54
379	0.52
380	0.5
381	0.45
382	0.43
383	0.44
384	0.45
385	0.46
386	0.46
387	0.47
388	0.48
389	0.49
390	0.47
391	0.47
392	0.43
393	0.41
394	0.38
395	0.35
396	0.31
397	0.3
398	0.26
399	0.18
400	0.22
401	0.24
402	0.31
403	0.34
404	0.42
405	0.44
406	0.5
407	0.52
408	0.5
409	0.5
410	0.46
411	0.49
412	0.49
413	0.49
414	0.49
415	0.52
416	0.57
417	0.64
418	0.64
419	0.6
420	0.57
421	0.57
422	0.54
423	0.54
424	0.49
425	0.46
426	0.47
427	0.45
428	0.41
429	0.45
430	0.4
431	0.37
432	0.38
433	0.36
434	0.32
435	0.33
436	0.38
437	0.31
438	0.3
439	0.31
440	0.3
441	0.28
442	0.28
443	0.28
444	0.23
445	0.26
446	0.27
447	0.24
448	0.22
449	0.21
450	0.21
451	0.23
452	0.22
453	0.22
454	0.26
455	0.26
456	0.27
457	0.26
458	0.26
459	0.2
460	0.18
461	0.14
462	0.08
463	0.08
464	0.07
465	0.07
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.08
470	0.09
471	0.1
472	0.11
473	0.13
474	0.13
475	0.14
476	0.19
477	0.2
478	0.23
479	0.23
480	0.23
481	0.23
482	0.25
483	0.27
484	0.28
485	0.31
486	0.31
487	0.31
488	0.38
489	0.39
490	0.4
491	0.41
492	0.39
493	0.36
494	0.39
495	0.47
496	0.46
497	0.44
498	0.41
499	0.37
500	0.33
501	0.32
502	0.29
503	0.21
504	0.16
505	0.15
506	0.14
507	0.17
508	0.18
509	0.19
510	0.19
511	0.19
512	0.2
513	0.26
514	0.27
515	0.26
516	0.3
517	0.35
518	0.41
519	0.44
520	0.44
521	0.38
522	0.39
523	0.37
524	0.35
525	0.32
526	0.27
527	0.31
528	0.29
529	0.33
530	0.33
531	0.34
532	0.31
533	0.3
534	0.27
535	0.2
536	0.2
537	0.16
538	0.15
539	0.13
540	0.13
541	0.11
542	0.1
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.09
547	0.1
548	0.13
549	0.2
550	0.2
551	0.25
552	0.27
553	0.26
554	0.26
555	0.27
556	0.25
557	0.19
558	0.2
559	0.16
560	0.14
561	0.13
562	0.12
563	0.1
564	0.09
565	0.07
566	0.05
567	0.04
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.04
577	0.04
578	0.05
579	0.05
580	0.04
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.09
589	0.13
590	0.2
591	0.23
592	0.26
593	0.34
594	0.4
595	0.46
596	0.48
597	0.54
598	0.5
599	0.53
600	0.57
601	0.52
602	0.51
603	0.51
604	0.48
605	0.45
606	0.47
607	0.47
608	0.49
609	0.55
610	0.58
611	0.62
612	0.72
613	0.77
614	0.8
615	0.83
616	0.78
617	0.78
618	0.75
619	0.72
620	0.69
621	0.66
622	0.62
623	0.61
624	0.65
625	0.58
626	0.55
627	0.54
628	0.5
629	0.47
630	0.43
631	0.39
632	0.36
633	0.43
634	0.45
635	0.42
636	0.47
637	0.48
638	0.51
639	0.52
640	0.49
641	0.45
642	0.45
643	0.49
644	0.47
645	0.44
646	0.4
647	0.37
648	0.38
649	0.34
650	0.31
651	0.24
652	0.21
653	0.19
654	0.19
655	0.19
656	0.17
657	0.2
658	0.18
659	0.19
660	0.18
661	0.21
662	0.2
663	0.19
664	0.21
665	0.21
666	0.3
667	0.29
668	0.28
669	0.29
670	0.29
671	0.32
672	0.33
673	0.3
674	0.23
675	0.25
676	0.26
677	0.25
678	0.25
679	0.27
680	0.25
681	0.25
682	0.24
683	0.24
684	0.26
685	0.23
686	0.25
687	0.24
688	0.26
689	0.27
690	0.28
691	0.27
692	0.3

N1JD39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer