Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JI00

Protein Details
Accession N1JI00    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-112QVEAGPIKKERKKRQHDPNAPKRPLTBasic
259-288DESTLPQKTPKPKSSRKSKQKTTVNPTEAQHydrophilic
297-346EPKISSEKVKNLEKKRKRGKKTQEINENEEASVDGSRTAPKQRKKKAKNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-106IKKERKKRQHDPNA
269-275KPKSSRK
304-317KVKNLEKKRKRGKK
335-345APKQRKKKAKN
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 12.333, mito 2.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MVRAKKMDEKRGATLQIEGLSLIQWKVVTGLQTLQDAIRTLSSAYIKHTNAILGEHGAGLDVDATLAKLGDNPLLTLGENSAQEKIQVEAGPIKKERKKRQHDPNAPKRPLTPFFLYMQTARPIIANDLGSVTVKGAVGAEGQRRWQTMAEDDKQLWTDAYKDNLRLYHARIHSYKAGNLNAKEMDDNEANQYAAEHDISIPEAMTDVQLLGEATGTILADEIEPENEPELEHESEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEDESTLPQKTPKPKSSRKSKQKTTVNPTEAQISVNSPSNEPKISSEKVKNLEKKRKRGKKTQEINENEEASVDGSRTAPKQRKKKAKND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.43
3 0.35
4 0.3
5 0.24
6 0.17
7 0.15
8 0.15
9 0.12
10 0.11
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.16
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.14
29 0.16
30 0.15
31 0.19
32 0.26
33 0.25
34 0.27
35 0.27
36 0.24
37 0.23
38 0.23
39 0.19
40 0.13
41 0.13
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.05
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.05
56 0.06
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.13
76 0.18
77 0.21
78 0.26
79 0.29
80 0.36
81 0.39
82 0.49
83 0.59
84 0.63
85 0.7
86 0.75
87 0.83
88 0.86
89 0.91
90 0.92
91 0.93
92 0.93
93 0.85
94 0.76
95 0.68
96 0.64
97 0.56
98 0.51
99 0.44
100 0.36
101 0.36
102 0.37
103 0.35
104 0.28
105 0.28
106 0.24
107 0.19
108 0.17
109 0.15
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.12
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.08
127 0.11
128 0.11
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.17
136 0.23
137 0.24
138 0.25
139 0.24
140 0.24
141 0.24
142 0.23
143 0.17
144 0.1
145 0.11
146 0.1
147 0.14
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.17
152 0.2
153 0.19
154 0.2
155 0.23
156 0.23
157 0.26
158 0.25
159 0.27
160 0.3
161 0.29
162 0.29
163 0.26
164 0.29
165 0.28
166 0.28
167 0.27
168 0.22
169 0.22
170 0.19
171 0.16
172 0.15
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.15
223 0.16
224 0.17
225 0.14
226 0.14
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.18
232 0.19
233 0.19
234 0.2
235 0.21
236 0.21
237 0.21
238 0.21
239 0.21
240 0.2
241 0.21
242 0.2
243 0.21
244 0.2
245 0.2
246 0.18
247 0.19
248 0.23
249 0.21
250 0.21
251 0.22
252 0.28
253 0.35
254 0.44
255 0.5
256 0.56
257 0.64
258 0.73
259 0.81
260 0.86
261 0.87
262 0.89
263 0.9
264 0.9
265 0.91
266 0.91
267 0.9
268 0.89
269 0.83
270 0.75
271 0.65
272 0.59
273 0.49
274 0.4
275 0.31
276 0.23
277 0.2
278 0.23
279 0.23
280 0.2
281 0.24
282 0.26
283 0.27
284 0.26
285 0.28
286 0.29
287 0.32
288 0.39
289 0.42
290 0.46
291 0.53
292 0.61
293 0.65
294 0.7
295 0.77
296 0.79
297 0.82
298 0.86
299 0.89
300 0.89
301 0.91
302 0.91
303 0.91
304 0.92
305 0.91
306 0.91
307 0.87
308 0.85
309 0.81
310 0.71
311 0.6
312 0.49
313 0.39
314 0.29
315 0.23
316 0.16
317 0.1
318 0.1
319 0.14
320 0.17
321 0.27
322 0.35
323 0.44
324 0.54
325 0.64
326 0.75