Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JFA8

Protein Details
Accession N1JFA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-62PSTLARKPEKTTKARAEKKRKRGPTQDEDEPVKRKKTKSHRPRTASTTPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-55RKPEKTTKARAEKKRKRGPTQDEDEPVKRKKTKSHRPR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MPVTEPYLEAMSPSTLARKPEKTTKARAEKKRKRGPTQDEDEPVKRKKTKSHRPRTASTTPECDEEISPFHLQTSSLFLPLSPISQKFPVEGMCAEHLSPLILTYYPPFNGLILSYSNPKLSQNPFNDDGDSVLLKSIDEYGVSWAWVTAEFLVLKPEKGASLEGYINLQNDGHLGVVCWNLFNASIERKRLPADWEWRDGCEAQMDEDDKDNQPLAGESSGYYVDGHGEKVEGMIKFRVADVESSQDRERGFLTIMGTMLSVEEEAQLVISEKSQGPEARSKAGRRLGGPNALGATNLGVIVDGAASDMDEIKYKPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.23
4 0.3
5 0.34
6 0.39
7 0.49
8 0.58
9 0.6
10 0.67
11 0.73
12 0.77
13 0.81
14 0.86
15 0.87
16 0.88
17 0.92
18 0.92
19 0.92
20 0.91
21 0.92
22 0.91
23 0.9
24 0.87
25 0.84
26 0.8
27 0.77
28 0.73
29 0.69
30 0.65
31 0.63
32 0.62
33 0.58
34 0.61
35 0.66
36 0.71
37 0.75
38 0.81
39 0.83
40 0.84
41 0.86
42 0.85
43 0.82
44 0.78
45 0.71
46 0.67
47 0.58
48 0.52
49 0.46
50 0.39
51 0.31
52 0.25
53 0.23
54 0.2
55 0.19
56 0.17
57 0.17
58 0.15
59 0.15
60 0.14
61 0.19
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.17
67 0.17
68 0.18
69 0.14
70 0.14
71 0.16
72 0.19
73 0.2
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.16
82 0.15
83 0.13
84 0.12
85 0.1
86 0.09
87 0.07
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.07
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.09
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.18
108 0.21
109 0.28
110 0.29
111 0.34
112 0.36
113 0.36
114 0.35
115 0.3
116 0.27
117 0.2
118 0.16
119 0.1
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.09
148 0.06
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.13
173 0.16
174 0.19
175 0.2
176 0.21
177 0.22
178 0.23
179 0.25
180 0.26
181 0.32
182 0.33
183 0.38
184 0.38
185 0.37
186 0.37
187 0.34
188 0.27
189 0.2
190 0.17
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.14
196 0.16
197 0.14
198 0.15
199 0.14
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.07
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.12
220 0.1
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.18
231 0.18
232 0.22
233 0.22
234 0.23
235 0.22
236 0.22
237 0.21
238 0.16
239 0.16
240 0.14
241 0.15
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.09
260 0.1
261 0.12
262 0.16
263 0.18
264 0.22
265 0.3
266 0.32
267 0.37
268 0.42
269 0.44
270 0.48
271 0.53
272 0.53
273 0.49
274 0.54
275 0.52
276 0.53
277 0.5
278 0.43
279 0.38
280 0.34
281 0.3
282 0.22
283 0.17
284 0.1
285 0.1
286 0.07
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.06
297 0.07
298 0.09
299 0.1