Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JN29

Protein Details
Accession N1JN29    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-63NLPEPDPKKNEKKDNENAEVKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034772  CPSF6/7  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Amino Acid Sequences MADDEFDIDIYGDTNAVQGVENNESKKSDGNSMPLKREAPSDNLPEPDPKKNEKKDNENAEVKADNNGFELSAEHQKIKSTDESGQNTLNIPKQAPQQQGIKRKEGSDDRPIDPGATTALLISELNWWNTDDDIRGWVNQAQVEDELKDITFSEHKVNGKSKGQAWVEFTSQQAATAAKRKIDAFGEGQQYVKKHIVTFSNPNVNPFRTLPKDAPLRAGKDGQANRAPSGSYGNERGNQNTNYGGNFRGRAPGYNARGGMNNNNNNMNNFNRNFTGPTMGNIGANFNGPMGGFPGNQLTNQFGGFNNRGGMMGNLRGGTGMRGGRGMSNGMMSGMPMGGMQMNGMPGMGGIPMNMGNITGGIPGSGFQGMQPHFNPAFFPGNQAGTDWQNPHGVKRPRPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.07
5 0.08
6 0.11
7 0.17
8 0.21
9 0.22
10 0.24
11 0.25
12 0.26
13 0.29
14 0.28
15 0.31
16 0.3
17 0.36
18 0.44
19 0.49
20 0.53
21 0.52
22 0.51
23 0.44
24 0.47
25 0.42
26 0.39
27 0.4
28 0.42
29 0.41
30 0.42
31 0.42
32 0.45
33 0.46
34 0.48
35 0.48
36 0.5
37 0.57
38 0.63
39 0.72
40 0.73
41 0.79
42 0.8
43 0.83
44 0.82
45 0.78
46 0.7
47 0.63
48 0.55
49 0.46
50 0.42
51 0.33
52 0.25
53 0.21
54 0.2
55 0.16
56 0.14
57 0.15
58 0.12
59 0.2
60 0.21
61 0.21
62 0.22
63 0.25
64 0.25
65 0.28
66 0.28
67 0.24
68 0.29
69 0.35
70 0.39
71 0.39
72 0.4
73 0.37
74 0.35
75 0.34
76 0.32
77 0.25
78 0.21
79 0.22
80 0.28
81 0.35
82 0.37
83 0.38
84 0.42
85 0.49
86 0.58
87 0.59
88 0.58
89 0.53
90 0.51
91 0.54
92 0.53
93 0.51
94 0.51
95 0.52
96 0.47
97 0.47
98 0.46
99 0.39
100 0.31
101 0.25
102 0.16
103 0.11
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.1
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.14
118 0.1
119 0.09
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.12
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.13
141 0.17
142 0.19
143 0.23
144 0.26
145 0.3
146 0.32
147 0.34
148 0.33
149 0.36
150 0.36
151 0.34
152 0.35
153 0.32
154 0.3
155 0.28
156 0.26
157 0.2
158 0.18
159 0.15
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.17
164 0.18
165 0.16
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.2
170 0.2
171 0.16
172 0.2
173 0.22
174 0.21
175 0.21
176 0.21
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.15
181 0.13
182 0.15
183 0.18
184 0.2
185 0.26
186 0.28
187 0.34
188 0.34
189 0.36
190 0.36
191 0.33
192 0.31
193 0.27
194 0.28
195 0.23
196 0.26
197 0.24
198 0.28
199 0.33
200 0.31
201 0.36
202 0.34
203 0.33
204 0.32
205 0.33
206 0.28
207 0.3
208 0.31
209 0.3
210 0.31
211 0.29
212 0.27
213 0.26
214 0.24
215 0.17
216 0.19
217 0.16
218 0.14
219 0.16
220 0.18
221 0.22
222 0.23
223 0.25
224 0.27
225 0.26
226 0.25
227 0.23
228 0.22
229 0.19
230 0.19
231 0.18
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.18
236 0.18
237 0.18
238 0.24
239 0.3
240 0.31
241 0.33
242 0.34
243 0.29
244 0.31
245 0.31
246 0.32
247 0.33
248 0.33
249 0.32
250 0.36
251 0.36
252 0.35
253 0.36
254 0.32
255 0.3
256 0.27
257 0.28
258 0.25
259 0.25
260 0.26
261 0.24
262 0.26
263 0.19
264 0.19
265 0.21
266 0.19
267 0.19
268 0.17
269 0.17
270 0.12
271 0.13
272 0.11
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.11
290 0.17
291 0.18
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.17
296 0.16
297 0.17
298 0.12
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.15
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.15
356 0.16
357 0.21
358 0.21
359 0.27
360 0.28
361 0.28
362 0.28
363 0.26
364 0.31
365 0.26
366 0.31
367 0.26
368 0.28
369 0.28
370 0.28
371 0.27
372 0.25
373 0.3
374 0.27
375 0.26
376 0.32
377 0.32
378 0.36
379 0.43
380 0.47