Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RP46

Protein Details
Accession F4RP46    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-115STPRHIRKARYERYRGLVRDBasic
948-972SDTGYIRPRLQKPTNRKPKGLPVEEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11.5, cyto 8, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041679  DNA2/NAM7-like_C  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR026122  MOV-10/SDE3_DEXXQ/H-box  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR047187  SF1_C_Upf1  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0032574  F:5'-3' RNA helicase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG mlr:MELLADRAFT_77976  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13087  AAA_12  
PF13604  AAA_30  
PF12874  zf-met  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd18038  DEXXQc_Helz-like  
cd18808  SF1_C_Upf1  
Amino Acid Sequences MPVPPRFKACRNLLDTGSCPIEDCPYQHKLIHCEPCRVFVTTQFSYKQHLNGKQHRQVTAQLQQVAPQLVNNLPKPQGPRCEICDVYAPNPARHASTPRHIRKARYERYRGLVRDSEQNKQGIVIFPDEINFGSLDTRSIRDNKLKSLTQTIRIFNQRSHFEPVVWLKGIKTLSARSRRGHSSVLSKFHPQVIEFPLQLDCNDSDQTSIEINFQPKGITGKHVDTLEFYFEIPGTGDTFKISRPLLAIVSDEALMEELKPVAPYVASLWLPSTEIADEIVDGVMPPPLAAVKWTGSLPFYDLPRWITRGLNSTGGGTRRTIQWATNAGVIPSEFSLSNYSKWWQGVLWIEETQMREDIRRYDIKGVSIARVKNDSLYSLDVPGLAEKRPSVLYGDQVLFRPSGDVEGTWYGGRVHKVEATKLQLKFHPNFSALQGQKFDVQFSLSRTVLRRMHQAVMLKAQQPLSIFPDLPRHRILSAPTEAERKTIRFFNRNFETNPPQQDAIANILTRRHPDIPFIVFGPPGTGKTAVLVEAVLQLCENPSTRILMAAPSNAAADQLALRLLQAGLKASLFRFCAPTRATITLTPGLEKVVCRNGRDGPFCTPELEVLKRYRVVISTCLSAGVLAGVGVPAGHYTHVMIDEAGQALEPEVMVPMKTLQKPGTEIILAGDPHQLGPIVRSPVAAALGLDKSLLARFIELKVYHMLPNRYSSTISKLTQNYRSHPSILEFPNKEFYEGDLTACADPMLTTSLERWEELPIGKTPIAFHNVPGEDLRESGSPSFFNLLEVVEVKRYVESLKEDRRFRLTDQDIGVITPYNAQASKIRIALKQYPKIKVGTVEEFQGQERRVIVLSTVRSNQEYLEYDLKFSLGFVSNPRRMNVAITRAQAALVIIGDSSVLQLDPLWKRYLSTLSLKGCWKGQPINWDAEDYLYQSSDESESSEEFSESDTGYIRPRLQKPTNRKPKGLPVEEDHLFVLTGMVQTIRLEDNLSDDEDYEMVDKNRARRLRHEAMADKDWGTLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.55
3 0.5
4 0.44
5 0.34
6 0.29
7 0.25
8 0.26
9 0.23
10 0.24
11 0.26
12 0.28
13 0.31
14 0.34
15 0.38
16 0.4
17 0.48
18 0.55
19 0.53
20 0.58
21 0.56
22 0.59
23 0.57
24 0.54
25 0.45
26 0.42
27 0.46
28 0.4
29 0.44
30 0.42
31 0.4
32 0.41
33 0.44
34 0.44
35 0.45
36 0.51
37 0.56
38 0.62
39 0.71
40 0.74
41 0.77
42 0.73
43 0.66
44 0.64
45 0.62
46 0.59
47 0.55
48 0.51
49 0.46
50 0.45
51 0.46
52 0.41
53 0.33
54 0.26
55 0.22
56 0.22
57 0.28
58 0.27
59 0.28
60 0.28
61 0.32
62 0.37
63 0.41
64 0.46
65 0.46
66 0.49
67 0.5
68 0.56
69 0.53
70 0.49
71 0.5
72 0.45
73 0.41
74 0.44
75 0.4
76 0.33
77 0.36
78 0.35
79 0.31
80 0.31
81 0.35
82 0.34
83 0.42
84 0.52
85 0.57
86 0.67
87 0.67
88 0.7
89 0.75
90 0.79
91 0.79
92 0.79
93 0.79
94 0.75
95 0.79
96 0.81
97 0.72
98 0.68
99 0.64
100 0.55
101 0.57
102 0.54
103 0.53
104 0.48
105 0.47
106 0.4
107 0.35
108 0.35
109 0.29
110 0.27
111 0.23
112 0.2
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.16
117 0.13
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.16
126 0.21
127 0.26
128 0.34
129 0.37
130 0.42
131 0.47
132 0.5
133 0.49
134 0.55
135 0.54
136 0.54
137 0.57
138 0.53
139 0.53
140 0.57
141 0.56
142 0.5
143 0.52
144 0.48
145 0.46
146 0.5
147 0.44
148 0.37
149 0.41
150 0.42
151 0.39
152 0.36
153 0.33
154 0.25
155 0.29
156 0.29
157 0.24
158 0.22
159 0.24
160 0.32
161 0.41
162 0.46
163 0.45
164 0.51
165 0.54
166 0.55
167 0.52
168 0.47
169 0.48
170 0.49
171 0.5
172 0.47
173 0.46
174 0.44
175 0.44
176 0.42
177 0.33
178 0.31
179 0.31
180 0.32
181 0.28
182 0.27
183 0.25
184 0.23
185 0.23
186 0.21
187 0.16
188 0.15
189 0.16
190 0.15
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.16
198 0.18
199 0.18
200 0.17
201 0.16
202 0.16
203 0.19
204 0.17
205 0.18
206 0.21
207 0.23
208 0.27
209 0.27
210 0.26
211 0.25
212 0.25
213 0.23
214 0.19
215 0.17
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.14
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.12
259 0.12
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.07
278 0.07
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.13
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.19
290 0.21
291 0.23
292 0.21
293 0.21
294 0.21
295 0.25
296 0.26
297 0.25
298 0.24
299 0.23
300 0.24
301 0.24
302 0.23
303 0.18
304 0.18
305 0.16
306 0.2
307 0.19
308 0.17
309 0.2
310 0.23
311 0.23
312 0.26
313 0.24
314 0.2
315 0.19
316 0.18
317 0.14
318 0.1
319 0.1
320 0.07
321 0.07
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.15
326 0.16
327 0.17
328 0.18
329 0.17
330 0.12
331 0.15
332 0.18
333 0.18
334 0.2
335 0.17
336 0.18
337 0.2
338 0.2
339 0.18
340 0.16
341 0.14
342 0.13
343 0.14
344 0.16
345 0.19
346 0.21
347 0.22
348 0.27
349 0.28
350 0.28
351 0.3
352 0.29
353 0.28
354 0.3
355 0.28
356 0.23
357 0.24
358 0.23
359 0.22
360 0.21
361 0.18
362 0.15
363 0.17
364 0.15
365 0.14
366 0.14
367 0.12
368 0.11
369 0.12
370 0.11
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.12
378 0.11
379 0.13
380 0.16
381 0.17
382 0.17
383 0.17
384 0.17
385 0.14
386 0.13
387 0.12
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.09
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.14
403 0.15
404 0.17
405 0.2
406 0.24
407 0.29
408 0.29
409 0.3
410 0.31
411 0.35
412 0.35
413 0.36
414 0.33
415 0.28
416 0.27
417 0.27
418 0.32
419 0.28
420 0.28
421 0.25
422 0.22
423 0.25
424 0.24
425 0.22
426 0.13
427 0.14
428 0.13
429 0.15
430 0.18
431 0.15
432 0.17
433 0.18
434 0.24
435 0.26
436 0.26
437 0.29
438 0.28
439 0.3
440 0.3
441 0.31
442 0.26
443 0.27
444 0.28
445 0.24
446 0.23
447 0.22
448 0.2
449 0.18
450 0.18
451 0.17
452 0.15
453 0.14
454 0.13
455 0.23
456 0.23
457 0.25
458 0.26
459 0.23
460 0.22
461 0.24
462 0.25
463 0.2
464 0.21
465 0.2
466 0.2
467 0.22
468 0.21
469 0.22
470 0.22
471 0.18
472 0.18
473 0.22
474 0.25
475 0.29
476 0.3
477 0.36
478 0.4
479 0.41
480 0.41
481 0.41
482 0.43
483 0.4
484 0.42
485 0.35
486 0.3
487 0.27
488 0.26
489 0.21
490 0.18
491 0.15
492 0.12
493 0.1
494 0.12
495 0.13
496 0.14
497 0.16
498 0.16
499 0.15
500 0.17
501 0.19
502 0.19
503 0.19
504 0.18
505 0.16
506 0.13
507 0.12
508 0.12
509 0.1
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.07
517 0.07
518 0.06
519 0.05
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.07
527 0.08
528 0.05
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.07
539 0.08
540 0.07
541 0.07
542 0.05
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.06
555 0.06
556 0.07
557 0.07
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.13
562 0.13
563 0.18
564 0.18
565 0.21
566 0.22
567 0.24
568 0.24
569 0.21
570 0.25
571 0.23
572 0.22
573 0.2
574 0.16
575 0.15
576 0.14
577 0.13
578 0.13
579 0.17
580 0.19
581 0.19
582 0.22
583 0.27
584 0.31
585 0.34
586 0.34
587 0.31
588 0.32
589 0.32
590 0.3
591 0.25
592 0.22
593 0.22
594 0.21
595 0.2
596 0.19
597 0.21
598 0.21
599 0.21
600 0.2
601 0.19
602 0.18
603 0.19
604 0.19
605 0.18
606 0.16
607 0.16
608 0.15
609 0.12
610 0.1
611 0.06
612 0.04
613 0.03
614 0.03
615 0.02
616 0.02
617 0.02
618 0.02
619 0.02
620 0.03
621 0.03
622 0.03
623 0.04
624 0.05
625 0.06
626 0.06
627 0.05
628 0.06
629 0.06
630 0.07
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.04
637 0.03
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.07
643 0.12
644 0.14
645 0.17
646 0.18
647 0.19
648 0.22
649 0.22
650 0.22
651 0.17
652 0.16
653 0.14
654 0.15
655 0.13
656 0.12
657 0.12
658 0.1
659 0.1
660 0.1
661 0.1
662 0.07
663 0.08
664 0.12
665 0.13
666 0.13
667 0.13
668 0.13
669 0.13
670 0.14
671 0.12
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.07
677 0.06
678 0.06
679 0.06
680 0.07
681 0.05
682 0.06
683 0.08
684 0.09
685 0.14
686 0.14
687 0.15
688 0.17
689 0.19
690 0.21
691 0.25
692 0.26
693 0.23
694 0.27
695 0.28
696 0.27
697 0.27
698 0.25
699 0.27
700 0.3
701 0.3
702 0.31
703 0.34
704 0.39
705 0.45
706 0.48
707 0.46
708 0.47
709 0.48
710 0.43
711 0.39
712 0.36
713 0.35
714 0.36
715 0.4
716 0.34
717 0.34
718 0.4
719 0.39
720 0.38
721 0.3
722 0.27
723 0.26
724 0.24
725 0.23
726 0.16
727 0.17
728 0.16
729 0.16
730 0.14
731 0.07
732 0.06
733 0.06
734 0.07
735 0.06
736 0.07
737 0.08
738 0.13
739 0.13
740 0.14
741 0.14
742 0.14
743 0.16
744 0.17
745 0.18
746 0.15
747 0.18
748 0.18
749 0.18
750 0.18
751 0.2
752 0.24
753 0.21
754 0.21
755 0.24
756 0.24
757 0.25
758 0.24
759 0.22
760 0.17
761 0.18
762 0.19
763 0.12
764 0.13
765 0.13
766 0.14
767 0.12
768 0.12
769 0.15
770 0.13
771 0.13
772 0.12
773 0.11
774 0.1
775 0.12
776 0.11
777 0.1
778 0.11
779 0.1
780 0.1
781 0.1
782 0.1
783 0.12
784 0.17
785 0.25
786 0.34
787 0.42
788 0.45
789 0.48
790 0.53
791 0.53
792 0.48
793 0.5
794 0.44
795 0.42
796 0.41
797 0.4
798 0.34
799 0.32
800 0.3
801 0.2
802 0.16
803 0.12
804 0.11
805 0.1
806 0.1
807 0.12
808 0.15
809 0.18
810 0.22
811 0.24
812 0.26
813 0.27
814 0.33
815 0.41
816 0.47
817 0.52
818 0.55
819 0.56
820 0.55
821 0.55
822 0.51
823 0.47
824 0.43
825 0.4
826 0.35
827 0.32
828 0.31
829 0.3
830 0.3
831 0.29
832 0.24
833 0.2
834 0.2
835 0.19
836 0.17
837 0.16
838 0.16
839 0.17
840 0.2
841 0.22
842 0.25
843 0.26
844 0.26
845 0.26
846 0.25
847 0.25
848 0.24
849 0.25
850 0.28
851 0.26
852 0.26
853 0.26
854 0.25
855 0.2
856 0.17
857 0.17
858 0.12
859 0.13
860 0.19
861 0.28
862 0.34
863 0.37
864 0.37
865 0.36
866 0.34
867 0.39
868 0.38
869 0.37
870 0.36
871 0.35
872 0.37
873 0.34
874 0.34
875 0.28
876 0.22
877 0.15
878 0.1
879 0.08
880 0.05
881 0.05
882 0.05
883 0.05
884 0.05
885 0.04
886 0.04
887 0.04
888 0.05
889 0.12
890 0.16
891 0.2
892 0.22
893 0.22
894 0.23
895 0.26
896 0.3
897 0.28
898 0.31
899 0.36
900 0.38
901 0.43
902 0.44
903 0.43
904 0.42
905 0.41
906 0.4
907 0.39
908 0.38
909 0.43
910 0.43
911 0.48
912 0.45
913 0.43
914 0.37
915 0.33
916 0.31
917 0.23
918 0.21
919 0.15
920 0.14
921 0.12
922 0.13
923 0.12
924 0.11
925 0.11
926 0.12
927 0.12
928 0.14
929 0.15
930 0.14
931 0.13
932 0.14
933 0.14
934 0.12
935 0.12
936 0.12
937 0.12
938 0.16
939 0.2
940 0.25
941 0.32
942 0.38
943 0.47
944 0.56
945 0.64
946 0.71
947 0.78
948 0.84
949 0.82
950 0.82
951 0.79
952 0.81
953 0.82
954 0.78
955 0.73
956 0.68
957 0.67
958 0.63
959 0.57
960 0.46
961 0.36
962 0.28
963 0.22
964 0.16
965 0.1
966 0.09
967 0.08
968 0.07
969 0.07
970 0.08
971 0.1
972 0.11
973 0.1
974 0.12
975 0.11
976 0.15
977 0.17
978 0.19
979 0.17
980 0.16
981 0.17
982 0.15
983 0.16
984 0.12
985 0.14
986 0.13
987 0.19
988 0.22
989 0.27
990 0.36
991 0.42
992 0.45
993 0.51
994 0.6
995 0.63
996 0.66
997 0.69
998 0.68
999 0.69
1000 0.68
1001 0.62
1002 0.53