Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JGD6

Protein Details
Accession N1JGD6    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-52DEAIHNVKTKRPRREKHSFGGIIKLKKPPPKHNKPGNWLDGSHydrophilic
116-144HVTACNKLKKEKAQRKKEQKEARERERREBasic
194-221AEKGPRLKKKKDEPKPKHPKQKGPVDVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-45KTKRPRREKHSFGGIIKLKKPPPKHNKP
123-143LKKEKAQRKKEQKEARERERR
167-216KSIKKSAGKKVDPTDERKSKKRKAETDAEKGPRLKKKKDEPKPKHPKQKG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013243  SCA7_dom  
IPR037804  SGF73  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF08313  SCA7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51505  SCA7  
Amino Acid Sequences MASTKSVASDDEAIHNVKTKRPRREKHSFGGIIKLKKPPPKHNKPGNWLDGSILDGRKKRVDELDQQTASLEPVVNQLDDAAWETFPTGRPLVDSPDLTRCTICKKMILKSVSAIHVTACNKLKKEKAQRKKEQKEARERERREAEGAGEEEDEEEDADDKTGNGIKSIKKSAGKKVDPTDERKSKKRKAETDAEKGPRLKKKKDEPKPKHPKQKGPVDVERQCGVIKDGVPCARSLTCKSHSMGAKRAVAGRSLPYDFLLAAYQKKNQAKQQKAAIDANAPLEDEDPTLGPIDSDEELSAVMHGFSNWNPRPAVPPLVQIPIDRKYMRERLREQLSQATNGFTLNIFKVKAPVDEIEFKTEESSGAGNIATSRKPSLSAEGLVSTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.3
3 0.28
4 0.31
5 0.4
6 0.45
7 0.54
8 0.63
9 0.73
10 0.75
11 0.84
12 0.86
13 0.85
14 0.87
15 0.83
16 0.74
17 0.74
18 0.71
19 0.67
20 0.63
21 0.62
22 0.58
23 0.59
24 0.66
25 0.67
26 0.71
27 0.75
28 0.81
29 0.84
30 0.87
31 0.88
32 0.9
33 0.86
34 0.78
35 0.68
36 0.58
37 0.48
38 0.41
39 0.36
40 0.3
41 0.27
42 0.27
43 0.3
44 0.34
45 0.35
46 0.36
47 0.39
48 0.42
49 0.47
50 0.52
51 0.58
52 0.53
53 0.52
54 0.48
55 0.41
56 0.34
57 0.25
58 0.17
59 0.08
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.12
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.12
74 0.14
75 0.12
76 0.11
77 0.14
78 0.15
79 0.2
80 0.22
81 0.22
82 0.21
83 0.28
84 0.3
85 0.28
86 0.28
87 0.24
88 0.26
89 0.31
90 0.29
91 0.29
92 0.32
93 0.37
94 0.44
95 0.45
96 0.41
97 0.38
98 0.41
99 0.36
100 0.33
101 0.27
102 0.19
103 0.23
104 0.22
105 0.24
106 0.26
107 0.27
108 0.28
109 0.33
110 0.39
111 0.43
112 0.54
113 0.59
114 0.64
115 0.71
116 0.8
117 0.87
118 0.9
119 0.91
120 0.89
121 0.87
122 0.88
123 0.87
124 0.87
125 0.85
126 0.79
127 0.78
128 0.74
129 0.66
130 0.57
131 0.49
132 0.39
133 0.32
134 0.3
135 0.21
136 0.16
137 0.14
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.13
153 0.16
154 0.2
155 0.22
156 0.26
157 0.29
158 0.32
159 0.4
160 0.46
161 0.46
162 0.47
163 0.5
164 0.54
165 0.53
166 0.56
167 0.56
168 0.55
169 0.57
170 0.6
171 0.65
172 0.64
173 0.69
174 0.71
175 0.69
176 0.67
177 0.73
178 0.72
179 0.71
180 0.71
181 0.66
182 0.6
183 0.55
184 0.54
185 0.52
186 0.5
187 0.48
188 0.49
189 0.56
190 0.64
191 0.71
192 0.77
193 0.78
194 0.83
195 0.89
196 0.9
197 0.9
198 0.87
199 0.86
200 0.83
201 0.84
202 0.81
203 0.77
204 0.75
205 0.73
206 0.69
207 0.62
208 0.54
209 0.45
210 0.36
211 0.29
212 0.23
213 0.16
214 0.14
215 0.13
216 0.16
217 0.17
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.18
222 0.18
223 0.21
224 0.23
225 0.25
226 0.28
227 0.28
228 0.32
229 0.35
230 0.37
231 0.4
232 0.39
233 0.38
234 0.36
235 0.39
236 0.33
237 0.3
238 0.27
239 0.23
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.15
244 0.15
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.1
249 0.13
250 0.15
251 0.18
252 0.24
253 0.29
254 0.33
255 0.4
256 0.48
257 0.51
258 0.56
259 0.61
260 0.58
261 0.58
262 0.56
263 0.5
264 0.41
265 0.36
266 0.31
267 0.23
268 0.19
269 0.14
270 0.12
271 0.11
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.08
294 0.18
295 0.2
296 0.23
297 0.23
298 0.24
299 0.29
300 0.31
301 0.36
302 0.27
303 0.31
304 0.31
305 0.34
306 0.34
307 0.31
308 0.32
309 0.3
310 0.34
311 0.3
312 0.3
313 0.34
314 0.42
315 0.49
316 0.53
317 0.54
318 0.58
319 0.66
320 0.66
321 0.61
322 0.61
323 0.56
324 0.51
325 0.46
326 0.39
327 0.31
328 0.28
329 0.25
330 0.16
331 0.16
332 0.14
333 0.16
334 0.16
335 0.16
336 0.2
337 0.21
338 0.22
339 0.23
340 0.24
341 0.26
342 0.33
343 0.35
344 0.36
345 0.35
346 0.34
347 0.31
348 0.29
349 0.23
350 0.17
351 0.16
352 0.1
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.12
357 0.15
358 0.15
359 0.17
360 0.2
361 0.19
362 0.22
363 0.24
364 0.28
365 0.29
366 0.3
367 0.3