Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RKX7

Protein Details
Accession F4RKX7    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-62LVNNKSRTLNFQNRKNIRRISHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.166, nucl 10.5, cyto 8.5, cyto_pero 7.832, cyto_mito 6.332, pero 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027145  PWP2  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0034388  C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030010  P:establishment of cell polarity  
GO:0000920  P:septum digestion after cytokinesis  
KEGG mlr:MELLADRAFT_35901  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04003  Utp12  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MATRFEFSNLLGTVYRQGNVIFTPDGQSVISPVGNRVSIFDLVNNKSRTLNFQNRKNIRRISLSPDGKLLISVDDDGRALLVNFKQSVVLHHINFKGRVEDIKFSPDGKYILVTHGQHAQIWLTPSHQVKSFAPFHLHRTYTGHFDDVISVTWSACSSYFLTTSKDMSSRMYTVNPVEDFRPRTFTGHKESVLGAWFTGKIGDVNDEPRVITVSKDGACFVWRNKDEPEDSDDDTDSEDQKMTSSAPVSKAPVSDPLARVRWGISTRHFFNVPGTYVTTCTFHPANNLLIVGFSNGVFGLYEVGKEVGSFINIHSLSISQENITSVSIDPTGQWLAFGASKLGQLLVWEWQSESYILKQQGHYFDMNTLAFSTDGQNIVTGGDDGKVKVWNANSGFCYVTFTEHQSAISAVEFAKQGSVIFSASLDGTIRAFDLSRYRNFKTFTSPTPVQFTALAVDPSGEVVVGGGTGEGFEIFVWSVQTGKLVDIMSGHEGPISALAFSPLGDKIVSISWDKTLRIWEMYGRKTTVEPFQLPSDGLAVAFRPDGLEIAASTLDGQIAFFDVINGSQKSLIEGRKDVSGGRKFDDRVTAANSASGKSFNSLCYTADGLRLIAGGNSKYVCLYDCRDGMLLKRFEISANLSLDGTEEFLDSRKLLSSGVPLDEINDTGDLSDLDDRLDANKVLPGSKGGDMSRRKYKPEIRTKAVKFSPTGRTWGAASTDGLLLYSLDETVHFDPFDLSLEITPQSILESVRCKEFLKALVMAFRLNEHKMIKLVYQTVSFDQIKVVASQLPKVYVSKLMGFVAQEVTDSSSNRIEFNLIWINSILSAHGRYLKANSHEVAPVMRSVQKALLDTHSSVAKLSNSNTHMMRYLIDQASHSKQLAESDRLETLDLMVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.19
4 0.19
5 0.19
6 0.19
7 0.21
8 0.16
9 0.15
10 0.18
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.14
16 0.15
17 0.16
18 0.13
19 0.14
20 0.17
21 0.18
22 0.18
23 0.19
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.23
28 0.27
29 0.3
30 0.38
31 0.37
32 0.35
33 0.37
34 0.37
35 0.41
36 0.44
37 0.51
38 0.52
39 0.6
40 0.69
41 0.75
42 0.81
43 0.81
44 0.78
45 0.73
46 0.72
47 0.67
48 0.65
49 0.66
50 0.64
51 0.57
52 0.52
53 0.48
54 0.39
55 0.36
56 0.28
57 0.18
58 0.15
59 0.15
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.12
68 0.13
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.2
73 0.19
74 0.23
75 0.27
76 0.31
77 0.28
78 0.34
79 0.38
80 0.41
81 0.43
82 0.4
83 0.35
84 0.3
85 0.35
86 0.33
87 0.34
88 0.31
89 0.35
90 0.35
91 0.33
92 0.33
93 0.3
94 0.27
95 0.22
96 0.23
97 0.19
98 0.21
99 0.26
100 0.25
101 0.24
102 0.29
103 0.29
104 0.26
105 0.26
106 0.24
107 0.2
108 0.21
109 0.2
110 0.15
111 0.2
112 0.23
113 0.24
114 0.27
115 0.28
116 0.27
117 0.34
118 0.37
119 0.34
120 0.38
121 0.38
122 0.41
123 0.45
124 0.44
125 0.38
126 0.4
127 0.39
128 0.38
129 0.38
130 0.33
131 0.25
132 0.25
133 0.25
134 0.2
135 0.19
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.12
146 0.14
147 0.15
148 0.19
149 0.2
150 0.22
151 0.22
152 0.22
153 0.21
154 0.22
155 0.24
156 0.23
157 0.24
158 0.24
159 0.24
160 0.24
161 0.28
162 0.26
163 0.24
164 0.24
165 0.28
166 0.31
167 0.29
168 0.33
169 0.29
170 0.32
171 0.35
172 0.39
173 0.41
174 0.42
175 0.41
176 0.37
177 0.37
178 0.34
179 0.32
180 0.26
181 0.18
182 0.13
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.07
188 0.08
189 0.11
190 0.11
191 0.14
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.14
196 0.16
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.18
206 0.2
207 0.2
208 0.26
209 0.25
210 0.28
211 0.29
212 0.34
213 0.34
214 0.34
215 0.37
216 0.31
217 0.31
218 0.3
219 0.28
220 0.23
221 0.23
222 0.21
223 0.16
224 0.13
225 0.12
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.14
233 0.16
234 0.18
235 0.2
236 0.21
237 0.21
238 0.2
239 0.23
240 0.25
241 0.27
242 0.27
243 0.3
244 0.31
245 0.31
246 0.3
247 0.25
248 0.25
249 0.23
250 0.25
251 0.25
252 0.3
253 0.32
254 0.35
255 0.35
256 0.3
257 0.31
258 0.31
259 0.27
260 0.22
261 0.21
262 0.18
263 0.19
264 0.2
265 0.17
266 0.14
267 0.16
268 0.15
269 0.13
270 0.16
271 0.17
272 0.17
273 0.16
274 0.16
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.09
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.06
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.14
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.13
343 0.15
344 0.17
345 0.18
346 0.21
347 0.23
348 0.25
349 0.24
350 0.19
351 0.18
352 0.19
353 0.18
354 0.14
355 0.12
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.05
368 0.04
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.1
376 0.11
377 0.15
378 0.16
379 0.18
380 0.18
381 0.18
382 0.18
383 0.16
384 0.18
385 0.13
386 0.14
387 0.13
388 0.15
389 0.15
390 0.15
391 0.15
392 0.13
393 0.13
394 0.11
395 0.1
396 0.07
397 0.05
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.1
421 0.14
422 0.19
423 0.24
424 0.25
425 0.29
426 0.31
427 0.31
428 0.33
429 0.34
430 0.31
431 0.34
432 0.35
433 0.32
434 0.35
435 0.34
436 0.27
437 0.24
438 0.21
439 0.15
440 0.13
441 0.12
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.03
449 0.02
450 0.02
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.02
457 0.02
458 0.02
459 0.02
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.09
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.07
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.06
489 0.05
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.11
499 0.13
500 0.14
501 0.14
502 0.15
503 0.15
504 0.15
505 0.15
506 0.18
507 0.22
508 0.25
509 0.26
510 0.24
511 0.24
512 0.24
513 0.26
514 0.25
515 0.23
516 0.21
517 0.21
518 0.22
519 0.22
520 0.21
521 0.19
522 0.15
523 0.1
524 0.09
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.05
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.04
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.04
543 0.04
544 0.03
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.08
552 0.09
553 0.08
554 0.09
555 0.09
556 0.11
557 0.15
558 0.18
559 0.17
560 0.18
561 0.19
562 0.19
563 0.2
564 0.2
565 0.24
566 0.27
567 0.26
568 0.27
569 0.3
570 0.3
571 0.31
572 0.35
573 0.27
574 0.24
575 0.25
576 0.25
577 0.21
578 0.23
579 0.22
580 0.17
581 0.16
582 0.15
583 0.11
584 0.11
585 0.12
586 0.1
587 0.13
588 0.14
589 0.14
590 0.15
591 0.17
592 0.15
593 0.16
594 0.15
595 0.12
596 0.11
597 0.11
598 0.09
599 0.08
600 0.09
601 0.07
602 0.08
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.09
607 0.09
608 0.1
609 0.14
610 0.16
611 0.17
612 0.18
613 0.19
614 0.19
615 0.22
616 0.28
617 0.25
618 0.21
619 0.22
620 0.21
621 0.2
622 0.22
623 0.22
624 0.18
625 0.18
626 0.18
627 0.17
628 0.17
629 0.17
630 0.15
631 0.12
632 0.07
633 0.06
634 0.06
635 0.07
636 0.08
637 0.07
638 0.08
639 0.08
640 0.08
641 0.09
642 0.09
643 0.13
644 0.14
645 0.15
646 0.15
647 0.14
648 0.15
649 0.15
650 0.14
651 0.11
652 0.09
653 0.08
654 0.07
655 0.07
656 0.06
657 0.07
658 0.08
659 0.07
660 0.07
661 0.08
662 0.08
663 0.09
664 0.11
665 0.1
666 0.09
667 0.11
668 0.12
669 0.12
670 0.13
671 0.13
672 0.14
673 0.16
674 0.19
675 0.18
676 0.25
677 0.3
678 0.36
679 0.44
680 0.44
681 0.47
682 0.52
683 0.6
684 0.63
685 0.68
686 0.71
687 0.68
688 0.76
689 0.75
690 0.75
691 0.71
692 0.64
693 0.55
694 0.52
695 0.54
696 0.45
697 0.47
698 0.38
699 0.35
700 0.32
701 0.32
702 0.28
703 0.2
704 0.19
705 0.16
706 0.15
707 0.13
708 0.13
709 0.1
710 0.08
711 0.07
712 0.07
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.09
717 0.1
718 0.12
719 0.11
720 0.11
721 0.12
722 0.12
723 0.15
724 0.11
725 0.11
726 0.09
727 0.11
728 0.11
729 0.11
730 0.1
731 0.08
732 0.08
733 0.09
734 0.09
735 0.11
736 0.16
737 0.17
738 0.21
739 0.22
740 0.23
741 0.24
742 0.27
743 0.28
744 0.27
745 0.28
746 0.26
747 0.29
748 0.28
749 0.27
750 0.23
751 0.22
752 0.21
753 0.2
754 0.24
755 0.21
756 0.22
757 0.23
758 0.25
759 0.24
760 0.25
761 0.27
762 0.24
763 0.25
764 0.26
765 0.25
766 0.3
767 0.29
768 0.24
769 0.21
770 0.21
771 0.2
772 0.18
773 0.18
774 0.15
775 0.15
776 0.19
777 0.2
778 0.21
779 0.21
780 0.22
781 0.22
782 0.23
783 0.25
784 0.24
785 0.25
786 0.23
787 0.23
788 0.22
789 0.22
790 0.18
791 0.15
792 0.13
793 0.11
794 0.14
795 0.15
796 0.16
797 0.17
798 0.2
799 0.2
800 0.21
801 0.21
802 0.19
803 0.17
804 0.22
805 0.28
806 0.23
807 0.24
808 0.24
809 0.23
810 0.22
811 0.22
812 0.17
813 0.11
814 0.12
815 0.13
816 0.18
817 0.19
818 0.2
819 0.24
820 0.3
821 0.32
822 0.36
823 0.35
824 0.32
825 0.33
826 0.32
827 0.31
828 0.25
829 0.22
830 0.2
831 0.22
832 0.2
833 0.21
834 0.23
835 0.24
836 0.25
837 0.26
838 0.29
839 0.29
840 0.29
841 0.3
842 0.28
843 0.26
844 0.24
845 0.24
846 0.22
847 0.21
848 0.23
849 0.28
850 0.28
851 0.33
852 0.34
853 0.33
854 0.32
855 0.29
856 0.28
857 0.23
858 0.29
859 0.26
860 0.26
861 0.26
862 0.3
863 0.35
864 0.37
865 0.35
866 0.28
867 0.26
868 0.33
869 0.38
870 0.36
871 0.33
872 0.33
873 0.35
874 0.34
875 0.34
876 0.26